MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019680	TC	3	6	2212540	2212545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_019680	TCC	2	6	2213011	2213016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_019680	TA	4	8	2213066	2213073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_019680	TAA	2	6	2213109	2213114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_019680	TTC	2	6	2213157	2213162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_019680	TTC	2	6	2213216	2213221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_019680	AGCC	2	8	2214723	2214730	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_019680	ATT	2	6	2215580	2215585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_019680	TTAA	2	8	2218724	2218731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_019680	CTGC	2	8	2218748	2218755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_019680	CAG	2	6	2218814	2218819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_019680	AGGG	2	8	2221054	2221061	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_019680	AGGACA	2	12	2223267	2223278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5514	NC_019680	AGGA	2	8	2223286	2223293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_019680	GAAT	2	8	2223319	2223326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_019680	G	6	6	2223390	2223395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_019680	AAG	2	6	2224137	2224142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_019680	GAA	2	6	2224167	2224172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_019680	AGC	2	6	2227102	2227107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_019680	ATCT	2	8	2227194	2227201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5521	NC_019680	CCTA	2	8	2227230	2227237	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_019680	TGT	2	6	2227242	2227247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_019680	GCTG	2	8	2232557	2232564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_019680	CAA	2	6	2232597	2232602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_019680	CTTA	2	8	2232621	2232628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_019680	TAC	2	6	2233423	2233428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_019680	ACA	2	6	2233578	2233583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_019680	TCC	2	6	2233619	2233624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_019680	CAG	2	6	2233636	2233641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_019680	AAT	2	6	2234690	2234695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_019680	AATA	2	8	2234723	2234730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_019680	T	6	6	2235539	2235544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_019680	AACC	2	8	2235549	2235556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_019680	TGG	2	6	2235613	2235618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_019680	AAG	2	6	2235673	2235678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_019680	AGG	2	6	2237161	2237166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_019680	ATA	2	6	2237172	2237177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_019680	CT	3	6	2237196	2237201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_019680	AAGA	2	8	2237352	2237359	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_019680	AT	3	6	2238730	2238735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_019680	TA	3	6	2238826	2238831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_019680	TGT	2	6	2243096	2243101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_019680	TCC	2	6	2243145	2243150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_019680	GACTAT	2	12	2243194	2243205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5545	NC_019680	ATG	2	6	2243207	2243212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_019680	CT	3	6	2244761	2244766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_019680	TCC	2	6	2245905	2245910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_019680	TC	3	6	2246347	2246352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_019680	ATCA	2	8	2246711	2246718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_019680	CAA	2	6	2246731	2246736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_019680	A	6	6	2247590	2247595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_019680	CCT	2	6	2248853	2248858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_019680	AT	3	6	2249634	2249639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_019680	TGT	2	6	2249642	2249647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_019680	TTA	2	6	2249654	2249659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_019680	TGTC	2	8	2249710	2249717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_019680	TTA	2	6	2249743	2249748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_019680	T	6	6	2249756	2249761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_019680	GACC	2	8	2251201	2251208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_019680	TAA	2	6	2251690	2251695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_019680	TACA	2	8	2252051	2252058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_019680	ACA	2	6	2252897	2252902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_019680	GCT	2	6	2253004	2253009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_019680	TGC	2	6	2253054	2253059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_019680	GAG	2	6	2256821	2256826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_019680	AAT	2	6	2258776	2258781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_019680	AATC	2	8	2258785	2258792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5568	NC_019680	ATT	2	6	2259971	2259976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_019680	T	6	6	2259986	2259991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_019680	GAT	2	6	2260017	2260022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_019680	TCAT	2	8	2263890	2263897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_019680	AT	3	6	2265577	2265582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_019680	CAAA	2	8	2265610	2265617	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_019680	GCT	2	6	2265620	2265625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_019680	AC	3	6	2265679	2265684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_019680	TC	3	6	2265826	2265831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_019680	AAG	2	6	2265941	2265946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_019680	TGAT	2	8	2266005	2266012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_019680	TGT	2	6	2266028	2266033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_019680	CAT	2	6	2266091	2266096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_019680	CTGG	2	8	2267160	2267167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_019680	CAAG	2	8	2267675	2267682	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_019680	CTA	2	6	2267858	2267863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_019680	GTTTAT	2	12	2267900	2267911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_019680	AATC	2	8	2267976	2267983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_019680	TA	3	6	2268009	2268014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_019680	ATT	2	6	2268015	2268020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_019680	TTA	2	6	2272158	2272163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_019680	ATC	2	6	2275926	2275931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_019680	GAA	2	6	2276128	2276133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_019680	CCT	2	6	2276135	2276140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_019680	ACT	2	6	2276167	2276172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_019680	CTG	2	6	2276173	2276178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_019680	TCA	2	6	2276206	2276211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_019680	AGA	2	6	2276240	2276245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_019680	ATCA	2	8	2280626	2280633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5597	NC_019680	AGT	2	6	2280652	2280657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_019680	TCT	2	6	2280678	2280683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_019680	TCC	2	6	2280713	2280718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_019680	C	6	6	2280741	2280746	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5601	NC_019680	AG	3	6	2285300	2285305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_019680	GAT	2	6	2285338	2285343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_019680	TGAC	2	8	2285346	2285353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_019680	GAA	2	6	2285376	2285381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_019680	TGG	2	6	2285387	2285392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_019680	TGC	2	6	2285402	2285407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_019680	AAG	2	6	2285459	2285464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_019680	TGT	2	6	2286336	2286341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_019680	TAC	2	6	2286408	2286413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_019680	GAT	2	6	2286415	2286420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_019680	CAAG	3	12	2287108	2287119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_019680	T	6	6	2289187	2289192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_019680	T	6	6	2291006	2291011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_019680	AGG	3	9	2291012	2291020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_019680	T	7	7	2291114	2291120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_019680	CCT	2	6	2291128	2291133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_019680	T	6	6	2291140	2291145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_019680	AAC	2	6	2292142	2292147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_019680	GCGA	2	8	2292206	2292213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_019680	GTC	2	6	2292222	2292227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_019680	TGT	2	6	2292254	2292259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_019680	GCTT	2	8	2292287	2292294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5623	NC_019680	AGGGT	2	10	2292309	2292318	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_019680	AGT	2	6	2292333	2292338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_019680	TAC	2	6	2292342	2292347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_019680	CAG	2	6	2292380	2292385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_019680	ATT	2	6	2292394	2292399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_019680	AGG	3	9	2292497	2292505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_019680	ATTT	2	8	2292536	2292543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_019680	ATA	2	6	2292551	2292556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5632	NC_019680	TC	3	6	2292646	2292651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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