MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 25715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_019673	CCCAAG	2	12	8811374	8811385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24502	NC_019673	GCC	2	6	8811510	8811515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24503	NC_019673	CGAC	2	8	8811531	8811538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24504	NC_019673	CCG	2	6	8811543	8811548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24505	NC_019673	GCC	2	6	8811604	8811609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24506	NC_019673	AAGAA	2	10	8811616	8811625	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24507	NC_019673	ACG	2	6	8811635	8811640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24508	NC_019673	CGG	2	6	8811649	8811654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24509	NC_019673	CAGGC	2	10	8811662	8811671	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24510	NC_019673	TGCGG	2	10	8811719	8811728	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24511	NC_019673	CGA	2	6	8811766	8811771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24512	NC_019673	CCT	2	6	8814021	8814026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24513	NC_019673	TGC	2	6	8814043	8814048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24514	NC_019673	GTC	2	6	8814175	8814180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24515	NC_019673	GACAT	2	10	8814202	8814211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24516	NC_019673	GTG	2	6	8814219	8814224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24517	NC_019673	GGC	2	6	8814316	8814321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24518	NC_019673	AC	3	6	8818196	8818201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24519	NC_019673	GACA	2	8	8818230	8818237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24520	NC_019673	ATC	2	6	8818255	8818260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24521	NC_019673	CAC	2	6	8818701	8818706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24522	NC_019673	AGT	2	6	8818715	8818720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24523	NC_019673	CAG	2	6	8819982	8819987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24524	NC_019673	TTCG	2	8	8820073	8820080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24525	NC_019673	GC	3	6	8820167	8820172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24526	NC_019673	TGG	2	6	8820217	8820222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24527	NC_019673	AGG	2	6	8820243	8820248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24528	NC_019673	TCT	2	6	8821641	8821646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24529	NC_019673	AC	3	6	8821651	8821656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24530	NC_019673	CAC	2	6	8823345	8823350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24531	NC_019673	TCG	2	6	8823371	8823376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24532	NC_019673	CCA	2	6	8823381	8823386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24533	NC_019673	CGC	2	6	8826445	8826450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24534	NC_019673	CCG	2	6	8826474	8826479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24535	NC_019673	AAC	2	6	8827476	8827481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24536	NC_019673	GGC	2	6	8827966	8827971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24537	NC_019673	CCGG	2	8	8827976	8827983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24538	NC_019673	GCG	2	6	8828837	8828842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24539	NC_019673	GGAGG	2	10	8828942	8828951	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24540	NC_019673	GGCG	2	8	8828967	8828974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24541	NC_019673	AG	3	6	8828978	8828983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24542	NC_019673	AC	3	6	8831966	8831971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24543	NC_019673	TCCC	2	8	8832016	8832023	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24544	NC_019673	GGA	2	6	8832045	8832050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24545	NC_019673	C	6	6	8832090	8832095	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24546	NC_019673	CCG	2	6	8832101	8832106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24547	NC_019673	ACC	2	6	8834517	8834522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24548	NC_019673	CG	4	8	8834527	8834534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24549	NC_019673	GCC	2	6	8834539	8834544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24550	NC_019673	AAT	2	6	8834565	8834570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24551	NC_019673	CCGG	2	8	8835553	8835560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24552	NC_019673	GCC	2	6	8835571	8835576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24553	NC_019673	AACGGG	2	12	8835606	8835617	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24554	NC_019673	AACGGG	2	12	8835620	8835631	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24555	NC_019673	GC	3	6	8842087	8842092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24556	NC_019673	GGCC	2	8	8842093	8842100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24557	NC_019673	GGGC	2	8	8842114	8842121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24558	NC_019673	ACCG	2	8	8842149	8842156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24559	NC_019673	GGA	2	6	8842175	8842180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24560	NC_019673	CGG	2	6	8842184	8842189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24561	NC_019673	CGT	2	6	8852587	8852592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24562	NC_019673	GGT	3	9	8852611	8852619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24563	NC_019673	CCG	2	6	8852623	8852628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24564	NC_019673	CA	4	8	8852773	8852780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24565	NC_019673	GCC	2	6	8852781	8852786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24566	NC_019673	C	6	6	8852794	8852799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24567	NC_019673	AC	3	6	8852800	8852805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24568	NC_019673	CTG	2	6	8852806	8852811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24569	NC_019673	TGC	2	6	8852904	8852909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24570	NC_019673	GCC	2	6	8854281	8854286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24571	NC_019673	TCCGC	2	10	8854303	8854312	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24572	NC_019673	AGA	2	6	8855261	8855266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24573	NC_019673	GGC	2	6	8855270	8855275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24574	NC_019673	CGG	2	6	8855277	8855282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24575	NC_019673	GC	3	6	8855349	8855354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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24577	NC_019673	CG	3	6	8855384	8855389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24578	NC_019673	CG	3	6	8855394	8855399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24579	NC_019673	GC	3	6	8855508	8855513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24580	NC_019673	CACG	3	12	8855672	8855683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24581	NC_019673	CG	3	6	8855682	8855687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24582	NC_019673	CGCA	2	8	8855721	8855728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24583	NC_019673	GCC	2	6	8855735	8855740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24585	NC_019673	CCA	2	6	8855779	8855784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24586	NC_019673	CAC	2	6	8855801	8855806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24587	NC_019673	CGC	2	6	8855822	8855827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24588	NC_019673	GC	3	6	8855826	8855831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24589	NC_019673	CTCAC	2	10	8855835	8855844	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24590	NC_019673	CGC	2	6	8855852	8855857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24591	NC_019673	GC	3	6	8855856	8855861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24592	NC_019673	GC	3	6	8855863	8855868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24593	NC_019673	TCA	2	6	8857054	8857059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24595	NC_019673	TGG	2	6	8858306	8858311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24596	NC_019673	CG	3	6	8859207	8859212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24597	NC_019673	TGG	2	6	8863636	8863641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24598	NC_019673	GCC	2	6	8867132	8867137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24599	NC_019673	GGC	2	6	8867150	8867155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24600	NC_019673	CCGT	2	8	8868741	8868748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24601	NC_019673	C	6	6	8871490	8871495	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24602	NC_019673	GCC	2	6	8871514	8871519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24603	NC_019673	C	6	6	8871541	8871546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24604	NC_019673	CCG	2	6	8871551	8871556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24606	NC_019673	CCGCCA	2	12	8871581	8871592	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24607	NC_019673	CAG	2	6	8871594	8871599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24608	NC_019673	CAA	2	6	8871602	8871607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24609	NC_019673	GCG	2	6	8871608	8871613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24610	NC_019673	GGCA	2	8	8871618	8871625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24611	NC_019673	CAG	2	6	8871675	8871680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24612	NC_019673	GGC	3	9	8871688	8871696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24613	NC_019673	AGC	2	6	8871730	8871735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24614	NC_019673	CGGC	2	8	8871737	8871744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24615	NC_019673	CGG	2	6	8871759	8871764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24616	NC_019673	GGC	3	9	8871775	8871783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24617	NC_019673	CGG	2	6	8871789	8871794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24618	NC_019673	CGG	3	9	8871816	8871824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24619	NC_019673	GGC	2	6	8871825	8871830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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24622	NC_019673	GGT	2	6	8871975	8871980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24623	NC_019673	GTT	2	6	8873037	8873042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24628	NC_019673	GCGG	2	8	8875374	8875381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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24630	NC_019673	GCGG	2	8	8875402	8875409	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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