MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 25715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019673	CCCG	2	8	559625	559632	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1502	NC_019673	GCCT	2	8	559641	559648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_019673	CAC	2	6	559665	559670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_019673	GCAG	2	8	559740	559747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_019673	CGG	2	6	559756	559761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_019673	CGG	2	6	559794	559799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_019673	GAAC	2	8	559811	559818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_019673	GCC	2	6	560791	560796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_019673	CGC	2	6	560812	560817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_019673	TCG	2	6	560890	560895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_019673	GCCGGA	2	12	560949	560960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_019673	CGG	2	6	560961	560966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_019673	GC	3	6	560988	560993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_019673	GCT	2	6	562226	562231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_019673	TCC	2	6	562237	562242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_019673	CG	3	6	562300	562305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_019673	TGC	2	6	562359	562364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_019673	CGC	3	9	562365	562373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_019673	TGC	2	6	562376	562381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_019673	GTG	2	6	562383	562388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_019673	CCG	2	6	562389	562394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_019673	GTG	2	6	562415	562420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_019673	GCA	2	6	562428	562433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_019673	CCGG	2	8	562492	562499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_019673	CG	3	6	564149	564154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_019673	CGG	2	6	564176	564181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_019673	ACCG	2	8	564185	564192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_019673	ACC	2	6	564206	564211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_019673	ACCA	2	8	564214	564221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_019673	GGGCCG	2	12	564247	564258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_019673	CCAGGG	2	12	564262	564273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_019673	CG	3	6	566360	566365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_019673	CTC	2	6	566398	566403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_019673	CGG	2	6	566418	566423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_019673	TCA	2	6	566475	566480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_019673	CG	3	6	566512	566517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_019673	ATC	2	6	566518	566523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_019673	CGA	2	6	566538	566543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_019673	GACC	2	8	566561	566568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_019673	GTG	2	6	566569	566574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019673	CG	5	10	566577	566586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_019673	ACA	2	6	566603	566608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_019673	GCG	2	6	566645	566650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_019673	TGG	2	6	566696	566701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_019673	CGA	2	6	566748	566753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_019673	GC	3	6	566769	566774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_019673	GCGCG	2	10	566785	566794	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1548	NC_019673	TCA	2	6	566883	566888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_019673	CAA	2	6	566948	566953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_019673	ACCCCG	2	12	567663	567674	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_019673	CGG	2	6	567687	567692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_019673	CAC	2	6	570067	570072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_019673	ATT	2	6	570108	570113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_019673	CCA	2	6	570447	570452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_019673	CGG	2	6	573329	573334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_019673	GGC	2	6	573359	573364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_019673	GTT	2	6	574239	574244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_019673	CCT	2	6	575472	575477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_019673	CGT	2	6	575481	575486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_019673	GTA	2	6	577163	577168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019673	CGC	2	6	578877	578882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_019673	GCC	2	6	578901	578906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_019673	GTG	2	6	578942	578947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019673	CG	3	6	578980	578985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_019673	CCG	2	6	580383	580388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_019673	CCG	2	6	580404	580409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_019673	CGA	2	6	580417	580422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_019673	CTTCCC	2	12	580483	580494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_019673	CGC	2	6	580497	580502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_019673	CTC	2	6	580520	580525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_019673	CGG	2	6	580553	580558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_019673	CCG	2	6	581950	581955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_019673	CCG	2	6	581983	581988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_019673	AGC	2	6	582001	582006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1576	NC_019673	C	6	6	582169	582174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1577	NC_019673	CCAC	2	8	582209	582216	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1578	NC_019673	GAC	2	6	582217	582222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_019673	CCAC	2	8	582226	582233	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1580	NC_019673	GAC	2	6	582234	582239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_019673	GCC	2	6	582251	582256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_019673	CG	4	8	582259	582266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_019673	GC	3	6	582273	582278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_019673	CGCC	2	8	582284	582291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1585	NC_019673	GCGCC	2	10	582294	582303	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1586	NC_019673	CCGC	2	8	582341	582348	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1587	NC_019673	GCG	2	6	582373	582378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_019673	CGC	2	6	582394	582399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_019673	GC	3	6	582398	582403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_019673	GCG	2	6	582418	582423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_019673	CAGC	2	8	582487	582494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_019673	GGCG	2	8	582507	582514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_019673	GGCG	2	8	582517	582524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_019673	GGCG	2	8	582533	582540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_019673	TGG	2	6	582558	582563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_019673	TGG	2	6	582568	582573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_019673	TGG	2	6	582584	582589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_019673	TGG	2	6	582594	582599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_019673	CG	3	6	582628	582633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_019673	GCGG	2	8	582815	582822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_019673	GCTGGG	3	18	582843	582860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1602	NC_019673	GT	3	6	582892	582897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_019673	GGT	2	6	582910	582915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_019673	CCT	2	6	585032	585037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_019673	CG	3	6	585049	585054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_019673	CCG	3	9	585057	585065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_019673	CA	3	6	585373	585378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_019673	CGG	2	6	585389	585394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_019673	CGT	2	6	585482	585487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_019673	CCT	2	6	587987	587992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_019673	GT	3	6	588087	588092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019673	CGG	3	9	589564	589572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_019673	CG	3	6	589573	589578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_019673	CGAG	2	8	589583	589590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_019673	CGG	2	6	593015	593020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_019673	CGG	2	6	593027	593032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_019673	CCGG	2	8	593804	593811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_019673	CCGG	2	8	593813	593820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_019673	GCG	2	6	593833	593838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_019673	GTG	2	6	593867	593872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019673	CGG	2	6	593883	593888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_019673	CAT	2	6	595674	595679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_019673	CCG	2	6	595712	595717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_019673	GATCG	2	10	596124	596133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_019673	CAG	2	6	596221	596226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_019673	GGT	2	6	596242	596247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019673	GCC	2	6	596282	596287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_019673	TCG	3	9	596308	596316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_019673	CGG	2	6	596323	596328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_019673	GCG	2	6	596390	596395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_019673	CGC	2	6	596417	596422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_019673	GCGG	2	8	596465	596472	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_019673	GC	3	6	596481	596486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_019673	GCC	2	6	596493	596498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1636	NC_019673	AGT	2	6	600322	600327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1908	NC_019673	GCG	2	6	693147	693152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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