MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 25715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_019673	CGGG	2	8	3280140	3280147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_019673	CGT	2	6	3280162	3280167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_019673	GAC	2	6	3280178	3280183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_019673	CTG	2	6	3280184	3280189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_019673	TTC	2	6	3280193	3280198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_019673	GCCG	2	8	3280211	3280218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_019673	GCT	2	6	3280219	3280224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_019673	GCC	2	6	3280225	3280230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9009	NC_019673	CGG	2	6	3280241	3280246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_019673	GGGC	2	8	3280270	3280277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9011	NC_019673	CTGG	2	8	3280279	3280286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9012	NC_019673	GCG	2	6	3280347	3280352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_019673	CGG	2	6	3280395	3280400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_019673	CAA	2	6	3280429	3280434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_019673	CAT	2	6	3280465	3280470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_019673	GCTC	2	8	3280530	3280537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9017	NC_019673	ACGCAA	2	12	3280578	3280589	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_019673	CGA	2	6	3280662	3280667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_019673	GTAC	2	8	3283077	3283084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9020	NC_019673	GTC	2	6	3283805	3283810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_019673	GGT	2	6	3283817	3283822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_019673	TTTCC	2	10	3283848	3283857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9023	NC_019673	CCG	3	9	3283868	3283876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9024	NC_019673	GAC	2	6	3283894	3283899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_019673	GCG	2	6	3286940	3286945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_019673	CGC	2	6	3286960	3286965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9027	NC_019673	GTCCG	2	10	3286968	3286977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9028	NC_019673	TGG	2	6	3286985	3286990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_019673	CG	3	6	3287011	3287016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9030	NC_019673	GC	3	6	3287030	3287035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9031	NC_019673	CCGT	2	8	3287038	3287045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_019673	CCG	2	6	3287051	3287056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9033	NC_019673	CGGT	2	8	3287080	3287087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9034	NC_019673	GTC	2	6	3287103	3287108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_019673	GTC	2	6	3287113	3287118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_019673	GT	3	6	3287121	3287126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_019673	CCG	2	6	3287138	3287143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9038	NC_019673	GAC	2	6	3287153	3287158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_019673	C	6	6	3287206	3287211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9040	NC_019673	GAT	2	6	3287235	3287240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_019673	GAA	2	6	3291580	3291585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_019673	ATC	2	6	3291586	3291591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_019673	CG	3	6	3291632	3291637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_019673	ACG	2	6	3291638	3291643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_019673	GCG	2	6	3291665	3291670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_019673	GAG	2	6	3291681	3291686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_019673	AC	3	6	3294388	3294393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9048	NC_019673	CCGG	2	8	3294409	3294416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9049	NC_019673	GCC	2	6	3296355	3296360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9050	NC_019673	TGC	2	6	3302174	3302179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_019673	C	6	6	3302217	3302222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9052	NC_019673	C	6	6	3302230	3302235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9053	NC_019673	GCC	2	6	3302263	3302268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9054	NC_019673	CGGAC	2	10	3302288	3302297	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9055	NC_019673	GCC	2	6	3302327	3302332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9056	NC_019673	CGG	2	6	3302352	3302357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_019673	CGG	2	6	3302361	3302366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_019673	CTC	2	6	3302369	3302374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9059	NC_019673	CCTT	2	8	3305190	3305197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9060	NC_019673	TGG	2	6	3305218	3305223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_019673	GAT	2	6	3305227	3305232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_019673	CGCC	2	8	3305910	3305917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9063	NC_019673	CCCG	2	8	3305920	3305927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9064	NC_019673	CGC	2	6	3305936	3305941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_019673	CGC	2	6	3305971	3305976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9066	NC_019673	GCCGC	2	10	3305986	3305995	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9067	NC_019673	GCC	2	6	3306004	3306009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_019673	CGC	2	6	3306022	3306027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9069	NC_019673	GCC	2	6	3306028	3306033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_019673	CGGCT	5	25	3306084	3306108	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9071	NC_019673	TCG	2	6	3306116	3306121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_019673	TCG	2	6	3306155	3306160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_019673	CCG	2	6	3309166	3309171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9074	NC_019673	CCGG	2	8	3309224	3309231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9075	NC_019673	CCG	2	6	3309825	3309830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9081	NC_019673	GTG	2	6	3310132	3310137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_019673	G	6	6	3310147	3310152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_019673	CGG	2	6	3310162	3310167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9087	NC_019673	CGC	2	6	3314055	3314060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9091	NC_019673	GCC	2	6	3314202	3314207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9093	NC_019673	CGAGT	2	10	3318817	3318826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9094	NC_019673	CGA	2	6	3318885	3318890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9095	NC_019673	TCG	3	9	3318911	3318919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9097	NC_019673	CGG	2	6	3320279	3320284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_019673	TGG	2	6	3323990	3323995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_019673	GCG	2	6	3324037	3324042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_019673	ACCG	2	8	3324780	3324787	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9101	NC_019673	CACAA	2	10	3324788	3324797	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9102	NC_019673	GGA	2	6	3324803	3324808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_019673	AC	3	6	3324810	3324815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9104	NC_019673	CCGG	2	8	3325603	3325610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9105	NC_019673	CGG	2	6	3325672	3325677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9107	NC_019673	CG	3	6	3328023	3328028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9108	NC_019673	CGA	2	6	3328032	3328037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_019673	CCG	2	6	3328041	3328046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9110	NC_019673	CGT	2	6	3328055	3328060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_019673	GT	3	6	3328100	3328105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_019673	CCGA	2	8	3328165	3328172	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9113	NC_019673	CGC	2	6	3328202	3328207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9114	NC_019673	GTC	2	6	3328234	3328239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_019673	AG	3	6	3328240	3328245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_019673	CCGG	2	8	3329058	3329065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9117	NC_019673	CCGG	2	8	3329086	3329093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9118	NC_019673	AGG	2	6	3329155	3329160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_019673	GAC	2	6	3329184	3329189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_019673	GAG	2	6	3329208	3329213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_019673	CGGC	3	12	3330086	3330097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9122	NC_019673	ACC	3	9	3333925	3333933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9123	NC_019673	GC	3	6	3334790	3334795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9124	NC_019673	GCCG	2	8	3335429	3335436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_019673	GCC	2	6	3335481	3335486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9126	NC_019673	CGG	2	6	3335499	3335504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_019673	CGG	2	6	3335517	3335522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_019673	GTC	2	6	3335530	3335535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_019673	CCG	2	6	3335557	3335562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9131	NC_019673	CCG	2	6	3335620	3335625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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