MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 6784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018630	TCG	2	6	1821846	1821851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_018630	TCG	2	6	1821865	1821870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_018630	TTA	2	6	1821903	1821908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_018630	TTA	2	6	1821946	1821951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_018630	TAC	2	6	1821953	1821958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_018630	TC	3	6	1822030	1822035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_018630	CCT	2	6	1822068	1822073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_018630	TCCTTA	2	12	1822152	1822163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_018630	AGG	2	6	1822167	1822172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_018630	ATC	2	6	1822223	1822228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_018630	GGC	2	6	1822241	1822246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_018630	GTG	2	6	1822293	1822298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_018630	GT	3	6	1822308	1822313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_018630	GT	3	6	1822477	1822482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_018630	ATG	2	6	1822502	1822507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_018630	TCC	2	6	1822528	1822533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_018630	TTA	2	6	1822537	1822542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_018630	ATG	2	6	1822572	1822577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_018630	CACGA	2	10	1822627	1822636	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6020	NC_018630	GAC	2	6	1822640	1822645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_018630	CAC	2	6	1822653	1822658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_018630	GTC	2	6	1822697	1822702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_018630	TTC	2	6	1822728	1822733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_018630	AG	3	6	1822967	1822972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_018630	TCC	2	6	1822992	1822997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_018630	AT	3	6	1822998	1823003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_018630	CTA	2	6	1823075	1823080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6029	NC_018630	TTC	2	6	1823255	1823260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_018630	ACA	2	6	1823265	1823270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_018630	CTT	2	6	1823291	1823296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_018630	CTG	2	6	1823350	1823355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_018630	TCG	2	6	1823425	1823430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_018630	CCA	2	6	1823449	1823454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_018630	CAGG	2	8	1823576	1823583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_018630	AAGC	2	8	1823624	1823631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_018630	TCC	2	6	1823632	1823637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_018630	CGC	2	6	1823667	1823672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_018630	T	7	7	1823753	1823759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_018630	TAC	2	6	1823770	1823775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_018630	TGT	2	6	1823782	1823787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_018630	TC	3	6	1823844	1823849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_018630	T	6	6	1823898	1823903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_018630	T	6	6	1823918	1823923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_018630	T	7	7	1823928	1823934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_018630	CCG	2	6	1823992	1823997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_018630	GTT	2	6	1824038	1824043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_018630	TAT	2	6	1824059	1824064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_018630	ACT	2	6	1824087	1824092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6051	NC_018630	T	9	9	1824109	1824117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_018630	A	6	6	1824699	1824704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_018630	CT	3	6	1824718	1824723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_018630	AGA	2	6	1825285	1825290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_018630	CT	3	6	1825499	1825504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_018630	TG	3	6	1825520	1825525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_018630	ATTT	2	8	1825553	1825560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_018630	TTGA	2	8	1825597	1825604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_018630	GCTT	2	8	1825638	1825645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_018630	T	7	7	1825644	1825650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_018630	TTTAT	2	10	1827910	1827919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_018630	TCA	2	6	1827925	1827930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_018630	T	7	7	1827972	1827978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_018630	A	6	6	1828892	1828897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_018630	CAA	2	6	1830020	1830025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_018630	TAT	2	6	1830029	1830034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_018630	CTT	2	6	1831125	1831130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_018630	TCT	2	6	1831514	1831519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_018630	TTA	2	6	1831537	1831542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_018630	AGTT	2	8	1832118	1832125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_018630	T	8	8	1833144	1833151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_018630	ATA	2	6	1833156	1833161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_018630	GGT	2	6	1833183	1833188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_018630	TAT	2	6	1834560	1834565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_018630	TAA	2	6	1834589	1834594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_018630	CT	3	6	1834667	1834672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6078	NC_018630	TAT	2	6	1835120	1835125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_018630	A	6	6	1835140	1835145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_018630	T	7	7	1835151	1835157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_018630	ATGATT	2	12	1835160	1835171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_018630	ATTT	2	8	1835176	1835183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_018630	AT	3	6	1835185	1835190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_018630	AGA	2	6	1835195	1835200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_018630	AAAT	2	8	1835208	1835215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_018630	ATG	2	6	1835430	1835435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_018630	CTT	2	6	1835504	1835509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6091	NC_018630	TAG	2	6	1836333	1836338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_018630	ATA	2	6	1836440	1836445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_018630	AGG	2	6	1836449	1836454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_018630	A	7	7	1836464	1836470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6099	NC_018630	AG	3	6	1837870	1837875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_018630	TTA	2	6	1839825	1839830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6102	NC_018630	A	6	6	1839973	1839978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_018630	ATTT	2	8	1840005	1840012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_018630	TACTA	2	10	1840033	1840042	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6105	NC_018630	TTA	2	6	1840045	1840050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_018630	CTT	2	6	1840116	1840121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_018630	AC	3	6	1840237	1840242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_018630	TAC	2	6	1840294	1840299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_018630	TTAAA	2	10	1840302	1840311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6116	NC_018630	AT	3	6	1840431	1840436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_018630	AT	3	6	1840536	1840541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_018630	TTCTA	2	10	1840547	1840556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6120	NC_018630	T	6	6	1843401	1843406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6123	NC_018630	TTTTC	2	10	1843499	1843508	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6124	NC_018630	ATTT	2	8	1843539	1843546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_018630	T	6	6	1843553	1843558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_018630	CTTG	2	8	1843569	1843576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_018630	GAAA	2	8	1843590	1843597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_018630	TAA	2	6	1843631	1843636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_018630	CCT	2	6	1843639	1843644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_018630	AGG	2	6	1843651	1843656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_018630	CAGA	2	8	1844473	1844480	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6133	NC_018630	CTTT	2	8	1844508	1844515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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