MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 10701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_018594	ATTAA	2	10	1548932	1548941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_018594	AAG	2	6	1548963	1548968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_018594	CTT	2	6	1548992	1548997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_018594	ATA	2	6	1549033	1549038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_018594	TCA	2	6	1549044	1549049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_018594	A	6	6	1549052	1549057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_018594	TCC	2	6	1550472	1550477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_018594	TAAAA	2	10	1553188	1553197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_018594	A	6	6	1553209	1553214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_018594	CTT	2	6	1553225	1553230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_018594	TAAT	2	8	1553317	1553324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_018594	TTTTA	2	10	1553339	1553348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_018594	T	7	7	1553385	1553391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_018594	TG	3	6	1553396	1553401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_018594	CATA	2	8	1553447	1553454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_018594	TCATC	2	10	1553534	1553543	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8017	NC_018594	TAA	2	6	1553553	1553558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_018594	TTGA	2	8	1553618	1553625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_018594	TCA	2	6	1553738	1553743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_018594	CT	3	6	1553805	1553810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_018594	CTA	2	6	1553827	1553832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_018594	AATTA	2	10	1554009	1554018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_018594	TGC	2	6	1554036	1554041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_018594	ACA	2	6	1554101	1554106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_018594	AAAC	2	8	1554107	1554114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_018594	TTCT	2	8	1554152	1554159	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8027	NC_018594	TAA	2	6	1554179	1554184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_018594	TCA	2	6	1554193	1554198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_018594	CTCTTT	2	12	1554201	1554212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_018594	ATCT	2	8	1554231	1554238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_018594	CAATC	2	10	1554335	1554344	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8032	NC_018594	AAG	2	6	1554398	1554403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_018594	AATTGC	2	12	1554412	1554423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8034	NC_018594	CAG	2	6	1554449	1554454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_018594	CAA	2	6	1554557	1554562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_018594	ATG	2	6	1554588	1554593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_018594	ATC	3	9	1554607	1554615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_018594	CCT	3	9	1554770	1554778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_018594	TTA	2	6	1554832	1554837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_018594	AAT	2	6	1554846	1554851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_018594	TGTTTT	2	12	1554852	1554863	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_018594	AGC	2	6	1554879	1554884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_018594	ATAA	2	8	1555088	1555095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_018594	AAAT	2	8	1555110	1555117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_018594	TC	3	6	1555122	1555127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_018594	TAAA	2	8	1555164	1555171	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_018594	CTTG	2	8	1555289	1555296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8048	NC_018594	CTT	2	6	1555304	1555309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_018594	AGGCA	2	10	1555440	1555449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8050	NC_018594	C	6	6	1555465	1555470	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8051	NC_018594	AGGA	2	8	1555473	1555480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_018594	TTTC	2	8	1555557	1555564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_018594	AGA	2	6	1555604	1555609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_018594	TTC	2	6	1555679	1555684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_018594	CTT	2	6	1555700	1555705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_018594	TCA	2	6	1555717	1555722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_018594	A	6	6	1555735	1555740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_018594	ATC	2	6	1555749	1555754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_018594	AGGA	2	8	1555874	1555881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_018594	CAT	2	6	1555928	1555933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_018594	CGT	2	6	1555977	1555982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_018594	ACT	2	6	1555989	1555994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_018594	AGA	2	6	1556094	1556099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_018594	TCCA	2	8	1556127	1556134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_018594	CCT	2	6	1556162	1556167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_018594	AAAAT	2	10	1556215	1556224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_018594	A	6	6	1556370	1556375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_018594	TAT	2	6	1556396	1556401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_018594	ATG	2	6	1556413	1556418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_018594	AAAT	2	8	1556474	1556481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_018594	ATTG	2	8	1556519	1556526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_018594	A	6	6	1556550	1556555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_018594	CTT	2	6	1556673	1556678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_018594	TTG	2	6	1556716	1556721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_018594	A	6	6	1556778	1556783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_018594	AGG	2	6	1556804	1556809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_018594	AGAA	2	8	1556816	1556823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_018594	TCT	3	9	1556870	1556878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_018594	CTA	3	9	1556906	1556914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_018594	TCG	2	6	1557008	1557013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_018594	ATTT	2	8	1557015	1557022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_018594	TGA	2	6	1557073	1557078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_018594	AAG	2	6	1557136	1557141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_018594	ATC	2	6	1557416	1557421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_018594	AG	3	6	1557429	1557434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_018594	ATG	2	6	1557487	1557492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_018594	CTT	2	6	1557498	1557503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_018594	TAC	2	6	1557595	1557600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_018594	AATT	2	8	1557672	1557679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_018594	G	6	6	1557691	1557696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_018594	T	6	6	1557752	1557757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_018594	TTC	2	6	1558615	1558620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_018594	TTGG	2	8	1558641	1558648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_018594	AT	10	20	1558692	1558711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_018594	ATA	2	6	1558723	1558728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_018594	ACT	2	6	1558746	1558751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_018594	A	6	6	1559670	1559675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_018594	TCA	2	6	1559682	1559687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_018594	TTTAT	2	10	1562377	1562386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_018594	AGC	2	6	1562400	1562405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_018594	TTC	2	6	1562406	1562411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_018594	TAT	2	6	1562426	1562431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_018594	AGT	2	6	1562441	1562446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_018594	CAA	2	6	1562609	1562614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_018594	TGA	2	6	1562626	1562631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_018594	ATC	2	6	1562634	1562639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_018594	CAA	2	6	1562640	1562645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_018594	ATG	2	6	1562908	1562913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_018594	TCA	2	6	1563751	1563756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_018594	TCTGC	2	10	1563791	1563800	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8111	NC_018594	TC	4	8	1563806	1563813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_018594	TAAAA	2	10	1563903	1563912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_018594	ATA	2	6	1563924	1563929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_018594	TTA	2	6	1563934	1563939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_018594	AAC	2	6	1563960	1563965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_018594	AAAAG	2	10	1563984	1563993	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_018594	ACC	2	6	1564037	1564042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8118	NC_018594	TAAAA	2	10	1564075	1564084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_018594	T	6	6	1564101	1564106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_018594	GCC	2	6	1564151	1564156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8121	NC_018594	A	6	6	1564655	1564660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_018594	GAC	2	6	1566565	1566570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_018594	AT	3	6	1566685	1566690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_018594	TTATA	2	10	1566754	1566763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_018594	GA	4	8	1566771	1566778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_018594	A	6	6	1566781	1566786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_018594	CCAAT	2	10	1566850	1566859	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8128	NC_018594	ATC	2	6	1566896	1566901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_018594	AAT	2	6	1566922	1566927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_018594	ATT	2	6	1567152	1567157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_018594	TCT	2	6	1567199	1567204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8249	NC_018594	TGAAT	2	10	1588364	1588373	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8398	NC_018594	CAT	2	6	1622348	1622353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8399	NC_018594	AT	3	6	1622371	1622376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8432	NC_018594	A	6	6	1626961	1626966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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