MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 5547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_018526	CT	3	6	448785	448790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_018526	CAA	2	6	448815	448820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_018526	TAA	2	6	449823	449828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018526	A	7	7	449845	449851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018526	TAA	2	6	449858	449863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018526	AGG	2	6	449879	449884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018526	TCT	2	6	450906	450911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_018526	ACA	2	6	450940	450945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_018526	T	6	6	450983	450988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018526	TTAAA	2	10	450991	451000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018526	AT	3	6	451001	451006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018526	GAA	2	6	452874	452879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018526	AGT	2	6	453197	453202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018526	GAA	2	6	453246	453251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_018526	TTAT	2	8	453259	453266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_018526	CGC	2	6	453381	453386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_018526	GCC	3	9	453530	453538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_018526	TTA	2	6	453778	453783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018526	AG	3	6	453822	453827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_018526	A	6	6	454690	454695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018526	AGG	2	6	454701	454706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_018526	CTG	2	6	454863	454868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_018526	TAG	2	6	459717	459722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018526	AAAT	2	8	459772	459779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_018526	AAG	2	6	459782	459787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_018526	ATCT	2	8	461265	461272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_018526	AAGGA	2	10	461332	461341	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018526	TAT	2	6	462267	462272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_018526	CCT	2	6	462319	462324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_018526	CGA	2	6	462350	462355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_018526	CTT	2	6	462365	462370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_018526	GATT	2	8	462466	462473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018526	GTT	2	6	462532	462537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018526	TGA	2	6	462545	462550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018526	ATG	2	6	462586	462591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_018526	A	7	7	466326	466332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1541	NC_018526	AATG	2	8	466370	466377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_018526	GAT	2	6	466409	466414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_018526	AG	3	6	466433	466438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_018526	AGAAA	2	10	467830	467839	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_018526	GAG	2	6	469766	469771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018526	TGG	2	6	472156	472161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_018526	ATC	2	6	472186	472191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_018526	TTTG	2	8	472194	472201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_018526	GA	3	6	472223	472228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_018526	GGT	2	6	472282	472287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018526	T	6	6	472319	472324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018526	TCTA	2	8	475599	475606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_018526	T	7	7	475616	475622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_018526	ATT	2	6	475645	475650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_018526	TGA	2	6	475666	475671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_018526	A	7	7	475735	475741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_018526	A	6	6	475788	475793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1560	NC_018526	A	6	6	475886	475891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1563	NC_018526	CTT	2	6	475949	475954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_018526	A	6	6	476307	476312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018526	A	6	6	476335	476340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018526	TAT	2	6	476356	476361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1568	NC_018526	A	6	6	476445	476450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_018526	T	6	6	476457	476462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_018526	T	6	6	476769	476774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_018526	T	6	6	478323	478328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018526	AGTC	2	8	478361	478368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_018526	A	6	6	478391	478396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_018526	TATAC	2	10	479627	479636	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_018526	T	7	7	479690	479696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_018526	ATCTGC	2	12	479893	479904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1606	NC_018526	A	7	7	480405	480411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018526	CATA	2	8	480467	480474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_018526	TG	3	6	480491	480496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_018526	T	7	7	480510	480516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_018526	T	6	6	480520	480525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_018526	TTG	2	6	480538	480543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1613	NC_018526	ATATT	2	10	480589	480598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_018526	TGAT	2	8	480618	480625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018526	AT	3	6	480652	480657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_018526	GA	3	6	480687	480692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_018526	TAA	2	6	482404	482409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_018526	TTA	2	6	482424	482429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_018526	ATT	2	6	482446	482451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_018526	TA	3	6	483532	483537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_018526	GAAT	2	8	483560	483567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_018526	TGA	2	6	484355	484360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_018526	AAT	2	6	484383	484388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_018526	AAG	2	6	484394	484399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_018526	ATTT	2	8	485422	485429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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