MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 5547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018526	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018526	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018526	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018526	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018526	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018526	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018526	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018526	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018526	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018526	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018526	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018526	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018526	A	8	8	4390	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018526	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018526	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018526	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018526	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018526	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018526	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018526	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018526	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018526	T	6	6	15720	15725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018526	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018526	A	6	6	15868	15873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018526	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018526	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018526	A	6	6	16551	16556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018526	A	6	6	16585	16590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018526	A	6	6	16595	16600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018526	GAT	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018526	A	6	6	16674	16679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018526	AGA	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018526	A	7	7	16763	16769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018526	A	6	6	16775	16780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018526	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018526	ACAAA	2	10	16914	16923	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018526	GGC	2	6	17007	17012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018526	GCA	2	6	17326	17331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018526	CGC	2	6	17373	17378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018526	GTGA	2	8	17379	17386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018526	TGT	2	6	17412	17417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018526	AGA	2	6	17421	17426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018526	AGA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018526	CAG	2	6	17495	17500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018526	AGCG	2	8	17550	17557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018526	AT	3	6	17679	17684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018526	GGA	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018526	CT	3	6	17710	17715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018526	GAA	2	6	17949	17954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018526	GGT	2	6	18023	18028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018526	GTC	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018526	TCGTG	2	10	18046	18055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018526	CAT	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018526	TAA	2	6	18140	18145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018526	GGA	2	6	18149	18154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018526	ATC	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018526	AC	3	6	18200	18205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018526	CGC	2	6	18339	18344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018526	AC	3	6	18369	18374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018526	CAC	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018526	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018526	GAT	2	6	18455	18460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018526	CCT	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018526	TCT	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018526	AGG	2	6	18612	18617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018526	AAC	2	6	18647	18652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018526	GTT	2	6	18657	18662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018526	A	6	6	18792	18797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018526	ATC	2	6	18850	18855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018526	AGT	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018526	GTTAA	2	10	18923	18932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018526	ACG	2	6	18986	18991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018526	GTAA	2	8	19009	19016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018526	TCAC	2	8	19066	19073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018526	TAG	2	6	19157	19162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018526	GCGA	2	8	19165	19172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018526	AGG	2	6	19179	19184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018526	GAG	2	6	19192	19197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018526	CTC	2	6	19202	19207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018526	AGA	2	6	19244	19249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018526	AG	3	6	19272	19277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018526	T	6	6	19300	19305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018526	TCG	2	6	19347	19352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018526	GGA	2	6	19360	19365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018526	CT	3	6	19386	19391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018526	ACA	2	6	19478	19483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018526	ATG	2	6	19545	19550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018526	TAT	2	6	19610	19615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018526	GGA	2	6	19678	19683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018526	TC	3	6	19764	19769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018526	ACC	2	6	19944	19949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018526	AAT	2	6	19964	19969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018526	AGC	2	6	20023	20028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018526	ATTC	2	8	20030	20037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018526	TG	3	6	20154	20159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018526	AAG	2	6	20160	20165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018526	GAG	2	6	20175	20180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018526	GA	3	6	20303	20308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018526	ACA	2	6	20329	20334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018526	CTAA	2	8	20384	20391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018526	GA	3	6	20599	20604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018526	CT	3	6	20713	20718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018526	GAT	2	6	20731	20736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018526	AGG	2	6	20776	20781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018526	CGG	2	6	20822	20827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018526	GA	3	6	20920	20925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018526	TAGG	2	8	21038	21045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018526	TAC	2	6	21092	21097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018526	CCT	2	6	21180	21185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018526	GGT	2	6	21316	21321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018526	TCG	2	6	21431	21436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018526	CGT	2	6	21511	21516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018526	GA	3	6	21735	21740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018526	TGGAAG	2	12	21758	21769	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018526	AGT	2	6	21902	21907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018526	CAG	2	6	21953	21958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018526	AGT	2	6	21979	21984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018526	AATC	2	8	22184	22191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018526	ACC	2	6	22502	22507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018526	CGT	2	6	22539	22544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018526	ATTAT	2	10	22853	22862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018526	CGC	2	6	22932	22937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018526	TA	3	6	22938	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018526	AT	3	6	23029	23034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018526	GGA	2	6	23036	23041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018526	GCGT	2	8	23095	23102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018526	TCC	2	6	23119	23124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018526	CTA	2	6	23129	23134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018526	AGC	2	6	23146	23151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018526	TCG	2	6	23160	23165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018526	CGG	2	6	23272	23277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018526	TAT	2	6	23320	23325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018526	GGT	2	6	23378	23383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018526	ATATT	2	10	23402	23411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018526	AT	3	6	23555	23560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018526	TAA	2	6	24909	24914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018526	T	7	7	24936	24942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018526	GA	3	6	24951	24956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018526	GAG	2	6	24970	24975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018526	TTTG	2	8	26283	26290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018526	AT	3	6	26330	26335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018526	AGG	2	6	26336	26341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018526	CTT	2	6	27338	27343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018526	T	6	6	27342	27347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018526	ATTT	2	8	27350	27357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018526	TAT	2	6	27366	27371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018526	T	6	6	30615	30620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_018526	TG	3	6	30657	30662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018526	T	6	6	39823	39828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018526	T	6	6	42773	42778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018526	TTA	2	6	42781	42786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_018526	AATA	2	8	46208	46215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_018526	TA	3	6	52715	52720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_018526	AAGAA	2	10	108592	108601	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
432	NC_018526	ATT	2	6	108606	108611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_018526	TC	4	8	112275	112282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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435	NC_018526	AT	4	8	112319	112326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_018526	TCG	2	6	113069	113074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_018526	CCT	2	6	113082	113087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_018526	AT	3	6	113099	113104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_018526	GTCTG	2	10	113107	113116	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_018526	ATT	2	6	113774	113779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_018526	AT	3	6	119816	119821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_018526	GT	3	6	119823	119828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_018526	CATGA	2	10	123025	123034	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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458	NC_018526	TTA	2	6	123212	123217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_018526	GTG	2	6	123625	123630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_018526	AGA	2	6	125955	125960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_018526	A	6	6	129895	129900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_018526	TA	3	6	129901	129906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_018526	TCTA	2	8	133462	133469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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