MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 20236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018420	ATT	2	6	201879	201884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_018420	T	6	6	201883	201888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_018420	TAA	2	6	201903	201908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_018420	GAA	2	6	201936	201941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_018420	T	6	6	201947	201952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_018420	TATTAA	2	12	201988	201999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018420	T	6	6	202007	202012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018420	A	6	6	202015	202020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018420	AAGT	2	8	202028	202035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018420	ATT	2	6	202125	202130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018420	A	8	8	202174	202181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018420	AAAAGA	2	12	202203	202214	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018420	TTAA	2	8	202232	202239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_018420	TTGT	2	8	202245	202252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018420	CAT	2	6	202301	202306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_018420	TAA	2	6	202313	202318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018420	A	6	6	202317	202322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018420	AAC	2	6	202332	202337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_018420	AAATTC	2	12	202392	202403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4020	NC_018420	ATT	2	6	202409	202414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_018420	T	6	6	202450	202455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_018420	ATTT	2	8	202462	202469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_018420	TAAA	2	8	202472	202479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_018420	A	6	6	202477	202482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018420	A	6	6	202523	202528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018420	TAT	2	6	202559	202564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_018420	ATA	2	6	202589	202594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_018420	TAAT	2	8	202612	202619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018420	ATA	2	6	202639	202644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_018420	TAT	2	6	202652	202657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_018420	ATT	2	6	202673	202678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018420	T	6	6	202677	202682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018420	AACAT	2	10	202683	202692	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_018420	AAG	2	6	203649	203654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018420	TAA	2	6	203678	203683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_018420	AAC	2	6	205730	205735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_018420	T	8	8	205743	205750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_018420	A	7	7	205758	205764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018420	TA	3	6	205794	205799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_018420	CTTAT	2	10	205813	205822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4041	NC_018420	TGT	2	6	205833	205838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_018420	TTA	2	6	205850	205855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_018420	T	6	6	205871	205876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_018420	ATT	2	6	205883	205888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018420	A	6	6	205889	205894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018420	TAA	2	6	205895	205900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_018420	T	6	6	205958	205963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018420	TTAT	2	8	205967	205974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_018420	AG	3	6	205985	205990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018420	TAA	2	6	206001	206006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018420	T	6	6	206010	206015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_018420	CTA	2	6	206041	206046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_018420	TAGA	2	8	206051	206058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018420	AAG	2	6	206066	206071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018420	TAA	2	6	206087	206092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_018420	TAA	2	6	206118	206123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018420	TGA	2	6	206177	206182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018420	TAATA	2	10	206200	206209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018420	TA	3	6	206227	206232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018420	AGA	2	6	206277	206282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018420	A	6	6	206300	206305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018420	TAA	2	6	206309	206314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_018420	AAAT	2	8	206325	206332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_018420	T	6	6	206346	206351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018420	A	6	6	206375	206380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_018420	A	7	7	206382	206388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_018420	TAT	2	6	206396	206401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_018420	ATA	2	6	206407	206412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018420	TA	3	6	206411	206416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018420	A	7	7	206439	206445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_018420	AATTA	2	10	206452	206461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_018420	AT	3	6	206491	206496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_018420	AATT	2	8	206533	206540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018420	TTTC	2	8	206574	206581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_018420	ATA	2	6	206595	206600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_018420	TTA	2	6	206625	206630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_018420	TAA	2	6	206700	206705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_018420	TAA	2	6	206716	206721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_018420	AT	3	6	206737	206742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018420	A	6	6	206764	206769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_018420	CATT	2	8	206802	206809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_018420	GAAA	2	8	206826	206833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_018420	TTA	2	6	206903	206908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018420	A	6	6	206936	206941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_018420	AGA	2	6	206951	206956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_018420	AC	3	6	206990	206995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_018420	GAA	2	6	207002	207007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_018420	ATA	2	6	207010	207015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_018420	CAA	2	6	207068	207073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_018420	A	6	6	207079	207084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018420	ATTT	2	8	207096	207103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018420	TAAT	3	12	207179	207190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018420	TAAA	2	8	207192	207199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_018420	CAA	2	6	207225	207230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_018420	ATT	2	6	207250	207255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_018420	A	7	7	207261	207267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_018420	CAT	2	6	207291	207296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_018420	TGT	2	6	207793	207798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018420	TAG	2	6	207826	207831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_018420	T	8	8	207866	207873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018420	AGA	2	6	207882	207887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018420	TCAT	2	8	207900	207907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_018420	A	6	6	207918	207923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018420	AAAG	2	8	207935	207942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018420	TA	3	6	207959	207964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018420	A	6	6	207964	207969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_018420	TAA	2	6	207990	207995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_018420	TTC	2	6	208018	208023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_018420	TCT	2	6	208038	208043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_018420	A	8	8	209001	209008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018420	AAG	2	6	209064	209069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018420	GAT	2	6	210128	210133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018420	TAA	2	6	210162	210167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018420	A	6	6	210205	210210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_018420	CAT	2	6	210216	210221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_018420	TAA	2	6	210232	210237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_018420	TATTT	2	10	210244	210253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_018420	T	7	7	210291	210297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018420	T	9	9	210299	210307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018420	TAAA	2	8	210356	210363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_018420	A	7	7	210374	210380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018420	TTAGT	2	10	210384	210393	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018420	CTA	2	6	210405	210410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_018420	T	7	7	210417	210423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_018420	T	6	6	210459	210464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_018420	ATT	2	6	210475	210480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018420	TAAAT	2	10	210503	210512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_018420	TATT	2	8	210536	210543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_018420	ACA	2	6	210552	210557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_018420	ATT	2	6	210588	210593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_018420	A	6	6	210605	210610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_018420	T	7	7	210613	210619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_018420	ATTA	2	8	210634	210641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_018420	TA	3	6	210667	210672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_018420	A	7	7	210725	210731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_018420	T	7	7	210734	210740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_018420	TTAT	2	8	210771	210778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_018420	AAT	2	6	210853	210858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_018420	ACACCA	3	18	210886	210903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4142	NC_018420	CAT	2	6	210905	210910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_018420	TTAAAT	2	12	210932	210943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_018420	TTA	2	6	210957	210962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_018420	A	9	9	210979	210987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_018420	A	7	7	211007	211013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_018420	TAC	2	6	211099	211104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4149	NC_018420	AAT	2	6	211183	211188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_018420	TTTA	2	8	211237	211244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_018420	TAAA	2	8	211301	211308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_018420	TA	3	6	211367	211372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4157	NC_018420	TATT	2	8	212266	212273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4161	NC_018420	T	6	6	212405	212410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_018420	A	6	6	212496	212501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4170	NC_018420	T	6	6	212723	212728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4235	NC_018420	GTA	2	6	214931	214936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_018420	A	8	8	215593	215600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_018420	TA	3	6	215615	215620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_018420	ACA	2	6	215627	215632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_018420	AT	3	6	215637	215642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_018420	ATATA	2	10	215644	215653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_018420	TAA	2	6	215657	215662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4271	NC_018420	TAATA	2	10	215786	215795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_018420	ATT	2	6	215798	215803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4275	NC_018420	T	6	6	218865	218870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4276	NC_018420	T	6	6	218874	218879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4277	NC_018420	ATA	3	9	218907	218915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4278	NC_018420	TAT	2	6	218916	218921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4279	NC_018420	T	8	8	218943	218950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4280	NC_018420	TTTA	2	8	218972	218979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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