MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 1142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018294	CG	3	6	245128	245133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_018294	GTCG	2	8	245193	245200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_018294	GGA	2	6	245283	245288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018294	AGG	2	6	246576	246581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018294	CGG	2	6	246721	246726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_018294	CGT	2	6	246758	246763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_018294	CCT	2	6	246776	246781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_018294	ACG	2	6	246811	246816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_018294	CGGG	2	8	246828	246835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_018294	TAGCT	2	10	248021	248030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1011	NC_018294	CCG	2	6	248062	248067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_018294	GCG	2	6	248086	248091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018294	TCAA	2	8	248107	248114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_018294	TCC	2	6	248133	248138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_018294	TCG	2	6	248142	248147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_018294	CGG	2	6	248175	248180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_018294	GC	3	6	248208	248213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_018294	CGA	2	6	248214	248219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_018294	CCG	2	6	248230	248235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_018294	GC	3	6	248258	248263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_018294	TCT	2	6	248602	248607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_018294	GC	3	6	248623	248628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_018294	CTA	2	6	248631	248636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_018294	TCA	2	6	248647	248652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_018294	TTG	2	6	248653	248658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018294	CG	3	6	248806	248811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_018294	GCC	2	6	248816	248821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_018294	CAT	2	6	248826	248831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_018294	CGGT	2	8	251392	251399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_018294	CG	3	6	251411	251416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_018294	TTCG	2	8	251456	251463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_018294	A	6	6	251494	251499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018294	GAA	2	6	251612	251617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018294	GCC	2	6	251708	251713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_018294	GAT	2	6	251721	251726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018294	GAA	2	6	251763	251768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018294	GCC	2	6	251905	251910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_018294	GCA	2	6	251987	251992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_018294	GCGG	2	8	252025	252032	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_018294	AT	3	6	252045	252050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018294	T	6	6	252057	252062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018294	CTC	2	6	252112	252117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_018294	AG	3	6	252166	252171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018294	AG	3	6	252214	252219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018294	AGT	2	6	252231	252236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018294	A	6	6	252271	252276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018294	GCGA	2	8	252332	252339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_018294	GCCT	2	8	252425	252432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_018294	ATTG	2	8	253234	253241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018294	GCC	2	6	253312	253317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_018294	CCA	2	6	253341	253346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_018294	CA	3	6	255108	255113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_018294	ACA	3	9	255111	255119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_018294	AGCAT	2	10	255173	255182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_018294	ATA	2	6	255202	255207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018294	GCTGA	2	10	255225	255234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_018294	TTG	2	6	255280	255285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018294	CTC	2	6	255309	255314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_018294	CAG	2	6	255320	255325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_018294	CGT	2	6	255362	255367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_018294	TC	3	6	255456	255461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_018294	TGAC	2	8	257427	257434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_018294	CAG	2	6	257441	257446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_018294	CCGT	2	8	258766	258773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_018294	TGC	2	6	260029	260034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_018294	GTC	2	6	260092	260097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_018294	GTTG	2	8	260118	260125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018294	AGTG	2	8	260139	260146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018294	AC	3	6	260195	260200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_018294	TTC	2	6	260206	260211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_018294	TCT	2	6	260223	260228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_018294	ATTG	2	8	260254	260261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018294	TGA	2	6	260324	260329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018294	CGG	2	6	260345	260350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_018294	GCCA	2	8	260365	260372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_018294	CGA	2	6	261088	261093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_018294	AGG	2	6	262440	262445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_018294	CGG	2	6	262585	262590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_018294	CGT	2	6	262622	262627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_018294	CCT	2	6	262640	262645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_018294	ACG	2	6	262675	262680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_018294	CGGG	2	8	262692	262699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_018294	CAG	2	6	264060	264065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_018294	CGA	2	6	264080	264085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_018294	A	6	6	264184	264189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018294	TGC	2	6	264304	264309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_018294	CAA	2	6	264371	264376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_018294	AGG	2	6	264406	264411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018294	CCG	2	6	264438	264443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_018294	CCG	2	6	264453	264458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_018294	GAG	2	6	264475	264480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018294	CAG	2	6	264527	264532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_018294	GCG	2	6	264559	264564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_018294	GATG	2	8	264607	264614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018294	GAA	2	6	264658	264663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018294	AGC	2	6	264705	264710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_018294	TCG	2	6	264737	264742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_018294	TTGC	2	8	265580	265587	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_018294	CG	3	6	265622	265627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_018294	CTC	2	6	265702	265707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_018294	GC	3	6	265746	265751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_018294	CCG	2	6	265754	265759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_018294	CAT	2	6	265778	265783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_018294	CT	3	6	265966	265971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_018294	ATTT	2	8	266029	266036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018294	TGC	2	6	266052	266057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_018294	GGT	2	6	266198	266203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018294	GCG	2	6	266307	266312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_018294	ACG	2	6	266413	266418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_018294	CCT	2	6	266487	266492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_018294	AT	3	6	266550	266555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018294	CT	3	6	266605	266610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_018294	GAG	2	6	266611	266616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018294	TGA	2	6	266936	266941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018294	GAG	2	6	266947	266952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018294	GGC	2	6	267031	267036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_018294	GCC	2	6	267110	267115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_018294	GC	3	6	268468	268473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_018294	TCCTGC	2	12	268544	268555	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_018294	GAT	2	6	268592	268597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_018294	GGA	2	6	268658	268663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018294	ATGG	2	8	268680	268687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018294	GAA	2	6	268782	268787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018294	CG	3	6	268792	268797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_018294	TCA	2	6	269565	269570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_018294	GTC	2	6	269659	269664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_018294	GCG	2	6	272861	272866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_018294	TTCGTC	2	12	272890	272901	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_018294	TCG	2	6	272908	272913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_018294	CGATG	2	10	272936	272945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_018294	GCG	2	6	273207	273212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_018294	ATCG	2	8	273242	273249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_018294	GCC	3	9	273279	273287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_018294	CG	3	6	273304	273309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_018294	CAC	2	6	273316	273321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_018294	GGCC	2	8	273364	273371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_018294	ATC	2	6	274284	274289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_018294	TGTT	2	8	274345	274352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_018294	TCGA	2	8	275378	275385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_018294	TCA	2	6	275547	275552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_018294	GCT	3	9	275575	275583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_018294	CGC	2	6	275705	275710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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