MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus phage YMC-2011

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018285	ATA	2	6	4923	4928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018285	A	7	7	6628	6634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018285	CAT	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018285	GGT	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018285	T	7	7	6717	6723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018285	AT	3	6	6734	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018285	CAT	2	6	6745	6750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018285	T	7	7	6783	6789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018285	T	6	6	6886	6891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018285	A	6	6	6899	6904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018285	AT	3	6	6934	6939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018285	TATAA	2	10	6951	6960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018285	AAG	2	6	6986	6991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018285	CAAA	2	8	7219	7226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018285	A	6	6	7234	7239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018285	AG	3	6	7255	7260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018285	AATT	2	8	7346	7353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018285	AGAA	2	8	7356	7363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018285	AAT	2	6	7388	7393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018285	A	6	6	7394	7399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018285	A	7	7	7449	7455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018285	ATAAAA	2	12	7467	7478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018285	TAA	2	6	8673	8678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018285	CA	3	6	8699	8704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018285	T	7	7	8738	8744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018285	TCTT	2	8	9948	9955	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018285	TA	3	6	9958	9963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018285	TAAA	2	8	9986	9993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018285	A	7	7	9991	9997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018285	A	8	8	10000	10007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018285	TA	3	6	10042	10047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018285	AAGG	2	8	10062	10069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018285	T	7	7	10284	10290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018285	AGGA	2	8	10321	10328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018285	A	7	7	10366	10372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018285	TAA	2	6	10397	10402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018285	TC	3	6	10648	10653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018285	TCA	2	6	10657	10662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018285	GAG	2	6	11873	11878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018285	TACC	2	8	11889	11896	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018285	AT	3	6	11937	11942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018285	A	6	6	11944	11949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018285	A	6	6	11978	11983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018285	A	6	6	12214	12219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018285	CA	3	6	12233	12238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018285	A	8	8	12248	12255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018285	A	6	6	12261	12266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018285	A	6	6	12304	12309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018285	ATT	2	6	15620	15625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018285	A	6	6	19824	19829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018285	TTAT	2	8	19897	19904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018285	AT	3	6	19903	19908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018285	ATA	2	6	19913	19918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018285	AATA	5	20	19915	19934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018285	TA	4	8	19938	19945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018285	AACGGT	2	12	19958	19969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018285	A	7	7	19981	19987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018285	ATT	2	6	21169	21174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018285	AT	3	6	21227	21232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018285	A	8	8	21355	21362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018285	GA	3	6	21405	21410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018285	AGTTT	2	10	21426	21435	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018285	AGT	2	6	21464	21469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018285	TGG	2	6	22911	22916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018285	CAAAA	2	10	22969	22978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018285	TAAA	2	8	22984	22991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018285	TGG	2	6	23046	23051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018285	AT	3	6	23066	23071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018285	GGT	2	6	23076	23081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018285	ATTA	2	8	23120	23127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018285	A	7	7	23130	23136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018285	ATT	2	6	23174	23179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018285	TAT	2	6	23657	23662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018285	AGT	2	6	23679	23684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018285	GAG	2	6	23706	23711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018285	AG	3	6	23767	23772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018285	CATTA	2	10	23775	23784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018285	GTA	2	6	23787	23792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018285	TAA	2	6	24274	24279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018285	CCT	2	6	25040	25045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018285	T	6	6	25045	25050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018285	ATA	2	6	25054	25059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018285	CAGGT	2	10	26026	26035	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018285	TGA	2	6	26037	26042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018285	T	6	6	26287	26292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018285	G	6	6	26300	26305	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018285	AGG	2	6	28376	28381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018285	ATA	2	6	28384	28389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018285	AGG	2	6	31406	31411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018285	AAT	2	6	33530	33535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018285	AAGGA	2	10	34147	34156	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018285	AAT	2	6	40745	40750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.