MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 6534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018073	CA	3	6	1434	1439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018073	ACT	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018073	TAA	2	6	1469	1474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018073	ATA	2	6	1482	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018073	ATG	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018073	TTG	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018073	A	6	6	2702	2707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018073	ATT	2	6	2723	2728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018073	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018073	T	6	6	2846	2851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018073	CCT	2	6	3364	3369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018073	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018073	A	6	6	3403	3408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018073	AAT	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018073	ATTGA	2	10	3471	3480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018073	AAT	2	6	4651	4656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018073	A	6	6	8803	8808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018073	ATA	2	6	8816	8821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018073	TAT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018073	CGT	2	6	8879	8884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018073	AAG	2	6	8895	8900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018073	ATG	2	6	8967	8972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018073	A	6	6	9038	9043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018073	TGC	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018073	ACAA	2	8	9481	9488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018073	AGA	2	6	9523	9528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018073	A	8	8	9536	9543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018073	GAT	2	6	9562	9567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018073	A	6	6	9569	9574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018073	GA	3	6	9580	9585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018073	GATA	2	8	12702	12709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018073	T	6	6	14701	14706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018073	TAGT	2	8	14756	14763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018073	ATACT	2	10	14772	14781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018073	AGC	2	6	14793	14798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018073	T	7	7	14870	14876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018073	TCA	2	6	14979	14984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018073	ATT	2	6	14998	15003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018073	TGT	2	6	15008	15013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018073	CATATT	2	12	15035	15046	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018073	A	7	7	15103	15109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018073	ATT	2	6	15190	15195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018073	TCA	2	6	15207	15212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018073	GTT	2	6	15214	15219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018073	TGA	2	6	15231	15236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018073	TAT	2	6	15309	15314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018073	CTTT	2	8	15350	15357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018073	AT	3	6	15401	15406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018073	TCTAT	2	10	15418	15427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018073	TA	3	6	15437	15442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018073	TGT	2	6	15455	15460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018073	ATA	2	6	15461	15466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018073	GA	3	6	15482	15487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018073	AACAG	2	10	15517	15526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018073	AAT	2	6	15529	15534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018073	GA	3	6	15542	15547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018073	TTTG	2	8	15575	15582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018073	GAA	2	6	15594	15599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018073	A	6	6	15615	15620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018073	T	6	6	15633	15638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018073	AATA	2	8	18514	18521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018073	AT	3	6	18537	18542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018073	TCT	2	6	18560	18565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018073	GTTC	2	8	18578	18585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018073	TCT	2	6	18621	18626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018073	AGA	2	6	18663	18668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018073	AGT	2	6	18675	18680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018073	T	6	6	18680	18685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018073	AAGG	2	8	18722	18729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018073	AGA	2	6	18730	18735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018073	A	7	7	19243	19249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018073	A	6	6	19254	19259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018073	AAG	2	6	19269	19274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018073	AGT	2	6	19275	19280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018073	GA	3	6	19368	19373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018073	CAGT	2	8	19374	19381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018073	AAAT	2	8	19393	19400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018073	GGC	2	6	19472	19477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018073	TAC	2	6	19522	19527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018073	CCTG	2	8	19572	19579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018073	TAG	2	6	19697	19702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018073	CGA	2	6	19725	19730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018073	GCA	2	6	19799	19804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018073	G	6	6	19824	19829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018073	CGC	2	6	19846	19851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018073	GTGA	2	8	19852	19859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018073	TGT	2	6	19885	19890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018073	GAA	2	6	19895	19900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018073	CAG	2	6	19968	19973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018073	AGCG	2	8	20023	20030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018073	AT	3	6	20152	20157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018073	GGA	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018073	CT	3	6	20183	20188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018073	GAA	2	6	20422	20427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018073	GGT	2	6	20496	20501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018073	GTC	2	6	20510	20515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018073	TCGTG	2	10	20519	20528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018073	CAT	2	6	20578	20583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018073	TAA	2	6	20613	20618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018073	GGA	2	6	20622	20627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018073	ATC	2	6	20646	20651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018073	AC	3	6	20673	20678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018073	CGC	2	6	20812	20817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018073	AC	3	6	20842	20847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018073	CAC	2	6	20857	20862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018073	AGCC	2	8	20904	20911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018073	GAT	2	6	20927	20932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018073	CCT	2	6	20983	20988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018073	AGG	2	6	21087	21092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018073	TGA	2	6	21145	21150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018073	GAA	2	6	21308	21313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018073	ACG	2	6	21325	21330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018073	GTAA	2	8	21348	21355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018073	CAG	2	6	21389	21394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018073	GAG	2	6	21429	21434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018073	GCG	2	6	21502	21507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018073	AGA	2	6	21584	21589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018073	AG	3	6	21612	21617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018073	CGG	2	6	21668	21673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018073	GGA	2	6	21700	21705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018073	GGGAG	2	10	21781	21790	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018073	ACA	2	6	21818	21823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018073	ATG	2	6	21885	21890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018073	TGT	2	6	21955	21960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018073	GGA	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018073	TC	3	6	22104	22109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018073	ACC	2	6	22283	22288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018073	AAT	2	6	22303	22308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018073	AGC	2	6	22363	22368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018073	ATTC	2	8	22370	22377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018073	TG	3	6	22492	22497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018073	GA	3	6	22643	22648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018073	AGG	2	6	22707	22712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018073	TAG	2	6	22826	22831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018073	AGTG	2	8	22835	22842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018073	GA	3	6	22939	22944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018073	CT	3	6	23054	23059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018073	GAT	2	6	23072	23077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018073	CGG	2	6	23163	23168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018073	GA	3	6	23261	23266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018073	TAGG	2	8	23379	23386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018073	TAC	2	6	23433	23438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018073	ATC	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018073	CCT	2	6	23521	23526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_018073	TTGG	2	8	23562	23569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018073	AATC	2	8	23571	23578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018073	GGT	2	6	23657	23662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018073	TCG	2	6	23772	23777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018073	CGT	2	6	23852	23857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018073	GTT	2	6	23955	23960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018073	AGGGA	2	10	23990	23999	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018073	GA	3	6	24076	24081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018073	TG	3	6	24112	24117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018073	ACTAAT	2	12	24131	24142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_018073	AAG	2	6	24163	24168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_018073	GT	3	6	24273	24278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018073	CAG	2	6	24287	24292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_018073	AGT	2	6	24340	24345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018073	AGT	2	6	24365	24370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018073	CTTT	2	8	24428	24435	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_018073	T	6	6	24433	24438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018073	TAT	2	6	24468	24473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_018073	AAG	2	6	24988	24993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_018073	AG	3	6	25171	25176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_018073	CGC	2	6	25434	25439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_018073	TTG	2	6	25450	25455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018073	TGT	2	6	25532	25537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018073	GGA	2	6	25543	25548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018073	GCGT	2	8	25602	25609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_018073	TCC	2	6	25626	25631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NC_018073	CGG	2	6	25772	25777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_018073	TTTG	2	8	25798	25805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018073	TGT	2	6	25854	25859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018073	GGT	2	6	25935	25940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018073	GGT	2	6	25970	25975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018073	CAT	2	6	25993	25998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_018073	T	6	6	28804	28809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018073	TTGA	2	8	28814	28821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_018073	TAGG	2	8	29897	29904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018073	TCAA	2	8	29938	29945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
196	NC_018073	TGA	2	6	29954	29959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_018073	ATT	2	6	33005	33010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_018073	ATAA	2	8	48997	49004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_018073	TATGA	2	10	49060	49069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_018073	AGT	2	6	70836	70841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018073	TAA	2	6	70888	70893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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