MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Solibacillus silvestris StLB046 plasmid pSSIL1

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018069	TTTA	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018069	TTTA	2	8	584	591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018069	ATT	2	6	594	599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018069	AAT	2	6	682	687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018069	A	6	6	720	725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018069	TTA	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018069	AAT	2	6	864	869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018069	TTC	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018069	TTA	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018069	TCA	3	9	1285	1293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018069	CCT	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018069	ATTAAA	2	12	1369	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018069	ACT	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018069	GCTA	2	8	1414	1421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018069	A	6	6	1424	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018069	AAT	2	6	1448	1453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018069	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018069	A	7	7	1475	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018069	T	6	6	1546	1551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018069	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018069	TGG	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018069	CA	3	6	1593	1598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018069	ATA	2	6	1646	1651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018069	ATTTT	2	10	1691	1700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018069	A	7	7	1713	1719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018069	TAAA	2	8	2816	2823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018069	TTTA	2	8	2864	2871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018069	ACAT	2	8	3453	3460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018069	A	6	6	3546	3551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018069	ATA	2	6	3704	3709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018069	T	7	7	3741	3747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018069	TTCA	2	8	3753	3760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018069	AAT	2	6	3773	3778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018069	AAG	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018069	TGTA	2	8	6457	6464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018069	T	6	6	6487	6492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018069	CAG	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018069	ATT	2	6	6519	6524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018069	CAA	2	6	7153	7158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018069	TAA	2	6	7163	7168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018069	TTA	2	6	7265	7270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018069	AAT	2	6	7274	7279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018069	AATG	2	8	7365	7372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018069	T	8	8	7397	7404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018069	ATT	2	6	7406	7411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018069	TAAA	2	8	7424	7431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018069	ATTA	2	8	7467	7474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018069	T	6	6	7866	7871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018069	CAG	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018069	TGCT	2	8	7934	7941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018069	CTAT	2	8	8028	8035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018069	AAG	2	6	8067	8072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018069	GCGA	2	8	8102	8109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018069	AT	3	6	8133	8138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018069	CTT	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018069	A	6	6	8185	8190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018069	TG	3	6	8197	8202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018069	TTA	2	6	8306	8311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018069	AG	3	6	8370	8375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018069	CT	3	6	8399	8404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018069	T	7	7	8409	8415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018069	GAAA	2	8	8422	8429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018069	A	7	7	8443	8449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018069	ACC	2	6	8453	8458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018069	CCT	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018069	TGC	2	6	8762	8767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018069	ATAA	2	8	8779	8786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018069	TA	3	6	8795	8800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018069	T	6	6	8830	8835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018069	CTA	2	6	8849	8854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018069	CCA	2	6	8894	8899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018069	CAA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018069	AAT	2	6	8999	9004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018069	ATT	3	9	9055	9063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018069	T	6	6	9062	9067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018069	TACA	2	8	9099	9106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018069	CTAT	2	8	9145	9152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018069	AG	3	6	9164	9169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018069	TAA	2	6	9187	9192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018069	AAGC	2	8	9194	9201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018069	AGC	2	6	9236	9241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018069	ACACT	2	10	9256	9265	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018069	A	7	7	9278	9284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018069	TTCCC	2	10	9325	9334	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_018069	TAG	2	6	9347	9352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018069	CAT	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018069	TAG	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018069	AT	3	6	9457	9462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018069	AAG	2	6	9506	9511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018069	A	8	8	9547	9554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018069	ATA	2	6	9562	9567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018069	TTA	2	6	9600	9605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018069	TTATA	2	10	9627	9636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018069	TGTATT	2	12	9646	9657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018069	ACTTA	2	10	9689	9698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018069	TGTACT	2	12	9699	9710	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018069	AAC	2	6	9775	9780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018069	CAGA	2	8	9787	9794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018069	GCT	2	6	9800	9805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018069	TTCT	2	8	9822	9829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018069	TTA	2	6	9876	9881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018069	GGT	2	6	9928	9933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018069	CTT	2	6	12142	12147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018069	A	6	6	12155	12160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018069	GCTAC	2	10	12163	12172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018069	AAG	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018069	GTTAGT	2	12	12263	12274	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018069	T	6	6	12335	12340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018069	TAC	2	6	12427	12432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018069	CAAA	2	8	12478	12485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018069	CTAT	2	8	12562	12569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018069	T	6	6	13714	13719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018069	A	6	6	13816	13821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018069	TCGCT	2	10	13830	13839	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018069	GC	3	6	13868	13873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018069	A	7	7	13912	13918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018069	CAG	2	6	14064	14069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018069	CAA	2	6	14080	14085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018069	A	7	7	14140	14146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018069	CA	3	6	14147	14152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018069	CAT	2	6	14215	14220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018069	TTC	2	6	14283	14288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018069	AT	3	6	14327	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018069	GAAT	2	8	14347	14354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018069	TTTTG	2	10	14365	14374	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018069	ATCA	2	8	14411	14418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018069	A	6	6	14481	14486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018069	TAA	2	6	14553	14558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018069	ATA	2	6	14598	14603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018069	ACA	3	9	14640	14648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018069	CAT	2	6	14669	14674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018069	CAA	2	6	14817	14822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018069	A	6	6	14821	14826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.