MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ST556 chromosome

Total Repeats: 7645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017769	ATC	2	6	208045	208050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017769	GGTG	2	8	208063	208070	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017769	TA	3	6	208103	208108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017769	TAA	2	6	208119	208124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017769	CAAA	2	8	208138	208145	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_017769	TAT	2	6	208165	208170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017769	GA	3	6	209062	209067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017769	AGA	2	6	209108	209113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017769	AG	3	6	209134	209139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017769	T	6	6	212881	212886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017769	TGG	2	6	212911	212916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017769	AGG	2	6	216597	216602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017769	A	6	6	217152	217157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017769	GTT	2	6	217183	217188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017769	T	6	6	217187	217192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017769	TCAT	2	8	217812	217819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_017769	CT	3	6	217822	217827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_017769	TCC	2	6	217875	217880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_017769	CTG	2	6	217902	217907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017769	CTC	2	6	217952	217957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017769	T	6	6	217976	217981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017769	CTTT	2	8	219353	219360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_017769	T	7	7	219366	219372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017769	T	6	6	219401	219406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017769	A	6	6	219414	219419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017769	A	6	6	219433	219438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017769	CTAAG	2	10	219454	219463	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_017769	AAT	2	6	219498	219503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017769	GGT	2	6	219527	219532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017769	GTT	2	6	219537	219542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017769	T	6	6	219549	219554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017769	A	6	6	219580	219585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017769	TGAAA	2	10	219656	219665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017769	AAT	2	6	220982	220987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017769	A	6	6	221012	221017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017769	A	6	6	221044	221049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017769	ATTTC	2	10	221182	221191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_017769	GCA	2	6	221205	221210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017769	TTTC	2	8	221232	221239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_017769	TTA	2	6	221250	221255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017769	CTT	2	6	222198	222203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017769	TTA	2	6	222212	222217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017769	TGG	2	6	222429	222434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017769	TTCT	2	8	222445	222452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_017769	A	6	6	224471	224476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017769	T	6	6	224571	224576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017769	ACG	2	6	224604	224609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017769	TCT	2	6	228341	228346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017769	ACC	2	6	228412	228417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_017769	CCCTG	2	10	228432	228441	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1051	NC_017769	GAT	2	6	228462	228467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017769	CTC	2	6	228548	228553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_017769	AG	3	6	228591	228596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017769	GTT	2	6	229220	229225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017769	TGA	2	6	230529	230534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017769	A	6	6	230557	230562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017769	TCC	2	6	231622	231627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_017769	AGA	2	6	231686	231691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017769	AGCT	2	8	231774	231781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_017769	A	6	6	231819	231824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017769	T	6	6	233537	233542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017769	TAT	2	6	233553	233558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017769	T	6	6	233573	233578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017769	GTT	2	6	233603	233608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017769	CAG	2	6	234862	234867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017769	TTAG	2	8	236494	236501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017769	T	7	7	236521	236527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017769	ATT	2	6	236536	236541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017769	TTG	2	6	236572	236577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017769	A	6	6	237355	237360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017769	A	7	7	237372	237378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017769	CAA	2	6	237389	237394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017769	A	7	7	237413	237419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017769	CAA	2	6	238338	238343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017769	A	6	6	238342	238347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017769	CACTAA	2	12	238381	238392	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1082	NC_017769	ACA	2	6	238715	238720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017769	ATGA	2	8	239357	239364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017769	TGG	2	6	239400	239405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017769	ATTG	2	8	239407	239414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017769	ACC	2	6	239433	239438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_017769	A	7	7	239447	239453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017769	GGA	2	6	239558	239563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017769	ATA	2	6	240199	240204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_017769	A	6	6	240294	240299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017769	AGA	2	6	241198	241203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017769	T	7	7	242719	242725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017769	ATA	2	6	242739	242744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017769	A	6	6	242757	242762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_017769	A	6	6	242786	242791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017769	AT	3	6	242817	242822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017769	TA	4	8	242871	242878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017769	TA	5	10	242896	242905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017769	GTG	2	6	242944	242949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017769	ACT	2	6	243269	243274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017769	AAT	2	6	243908	243913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017769	GATT	2	8	244004	244011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017769	TGAT	2	8	244024	244031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017769	TGG	2	6	244034	244039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017769	T	7	7	244091	244097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017769	GTATTT	2	12	244142	244153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017769	TAC	2	6	244218	244223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017769	AAG	2	6	244240	244245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017769	AT	3	6	244286	244291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017769	TTA	2	6	244360	244365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017769	GTA	2	6	244425	244430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017769	ACAAA	2	10	244442	244451	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_017769	TAC	2	6	244456	244461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017769	A	6	6	244483	244488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017769	AT	3	6	244494	244499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017769	TTAA	2	8	244507	244514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017769	A	7	7	244527	244533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017769	A	6	6	244552	244557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017769	A	6	6	244576	244581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017769	T	6	6	244643	244648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017769	T	6	6	244689	244694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017769	AT	3	6	244765	244770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017769	AG	3	6	244830	244835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017769	TG	3	6	244911	244916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017769	C	6	6	244953	244958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1128	NC_017769	CCT	2	6	244993	244998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_017769	GAC	2	6	245087	245092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017769	CTT	2	6	245100	245105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017769	GGAA	2	8	245180	245187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017769	ATTTTG	2	12	245212	245223	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017769	TTA	2	6	245256	245261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017769	TTG	2	6	245385	245390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017769	AT	3	6	246216	246221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017769	A	6	6	246240	246245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017769	CTG	2	6	246273	246278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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