MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ST556 chromosome

Total Repeats: 7645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017769	ACC	2	6	2097479	2097484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7502	NC_017769	ACT	2	6	2097501	2097506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_017769	CCT	2	6	2097507	2097512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7504	NC_017769	ACT	2	6	2097528	2097533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_017769	AAT	2	6	2097568	2097573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_017769	TTTC	2	8	2097579	2097586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7507	NC_017769	T	6	6	2097622	2097627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_017769	TA	3	6	2097662	2097667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_017769	CTTT	2	8	2098220	2098227	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7510	NC_017769	TA	3	6	2098244	2098249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_017769	AAT	2	6	2098253	2098258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_017769	TAA	2	6	2098286	2098291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_017769	A	6	6	2098290	2098295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_017769	CTA	2	6	2100299	2100304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_017769	ATC	2	6	2100360	2100365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_017769	AATGG	2	10	2100372	2100381	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_017769	CAA	3	9	2100407	2100415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_017769	TCAT	2	8	2100432	2100439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7519	NC_017769	CT	4	8	2103832	2103839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7520	NC_017769	ACCTTG	2	12	2103844	2103855	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_017769	TAT	2	6	2103862	2103867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_017769	CTTTT	2	10	2105686	2105695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7523	NC_017769	A	8	8	2106752	2106759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_017769	AT	3	6	2106885	2106890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_017769	TA	3	6	2106897	2106902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_017769	A	6	6	2108337	2108342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_017769	GAT	2	6	2108354	2108359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_017769	ATT	2	6	2108373	2108378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_017769	A	6	6	2108384	2108389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_017769	AAG	2	6	2110064	2110069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_017769	ATT	3	9	2112405	2112413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_017769	AAT	2	6	2112420	2112425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_017769	CAAT	2	8	2112449	2112456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7534	NC_017769	CTA	2	6	2112458	2112463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_017769	T	6	6	2112492	2112497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_017769	ATA	2	6	2112528	2112533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_017769	ACCT	2	8	2112613	2112620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7538	NC_017769	CTT	2	6	2113193	2113198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_017769	TAT	2	6	2113225	2113230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_017769	T	6	6	2113256	2113261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_017769	TCA	2	6	2113850	2113855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_017769	ACT	2	6	2113873	2113878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_017769	GAT	2	6	2115252	2115257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_017769	T	6	6	2115257	2115262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_017769	AAT	2	6	2115919	2115924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_017769	ACT	2	6	2115950	2115955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_017769	AT	3	6	2116100	2116105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_017769	AGA	2	6	2117286	2117291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_017769	GATA	2	8	2117295	2117302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_017769	GAT	2	6	2117724	2117729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_017769	AAAG	2	8	2118018	2118025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_017769	TGA	2	6	2118055	2118060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7554	NC_017769	ATT	2	6	2118499	2118504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_017769	T	6	6	2118503	2118508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_017769	GATA	2	8	2118538	2118545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_017769	TTA	2	6	2118605	2118610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_017769	ATT	2	6	2118628	2118633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_017769	A	6	6	2118689	2118694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_017769	TAT	2	6	2118716	2118721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_017769	T	6	6	2119777	2119782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_017769	CCT	2	6	2119812	2119817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7563	NC_017769	T	7	7	2120638	2120644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_017769	CTT	2	6	2120648	2120653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_017769	TCA	2	6	2120697	2120702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7567	NC_017769	CTT	2	6	2122037	2122042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_017769	A	7	7	2122065	2122071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_017769	TAA	2	6	2122076	2122081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7572	NC_017769	TAC	2	6	2127338	2127343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7575	NC_017769	CCT	2	6	2129877	2129882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7576	NC_017769	TA	3	6	2129883	2129888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_017769	TAT	2	6	2129897	2129902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_017769	TC	4	8	2129974	2129981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7581	NC_017769	TATC	2	8	2133076	2133083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7589	NC_017769	T	7	7	2138673	2138679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7598	NC_017769	TCTCA	2	10	2138998	2139007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7599	NC_017769	CTC	2	6	2139036	2139041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7601	NC_017769	CT	3	6	2139116	2139121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7602	NC_017769	GTA	2	6	2139154	2139159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_017769	GACT	2	8	2139184	2139191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7605	NC_017769	GATT	2	8	2139289	2139296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_017769	TTG	2	6	2139405	2139410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7609	NC_017769	GTT	2	6	2139463	2139468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7611	NC_017769	CTT	2	6	2139528	2139533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_017769	TCCT	2	8	2139534	2139541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7613	NC_017769	ATT	2	6	2139645	2139650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_017769	TGA	2	6	2139699	2139704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7616	NC_017769	GGTT	2	8	2139765	2139772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_017769	T	8	8	2139771	2139778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_017769	T	6	6	2139815	2139820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_017769	ATA	2	6	2139845	2139850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7621	NC_017769	A	6	6	2139883	2139888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7627	NC_017769	TAG	2	6	2142517	2142522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7629	NC_017769	AT	3	6	2142635	2142640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_017769	AAT	2	6	2142692	2142697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7631	NC_017769	TATT	2	8	2142705	2142712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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