MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ST556 chromosome

Total Repeats: 7645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017769	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017769	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017769	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017769	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017769	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017769	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017769	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017769	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017769	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017769	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017769	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017769	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017769	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017769	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017769	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017769	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017769	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017769	A	7	7	3281	3287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017769	CAG	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017769	T	7	7	3351	3357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017769	TAT	2	6	3379	3384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017769	CCT	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017769	ATA	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017769	AG	3	6	4036	4041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017769	T	6	6	4051	4056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017769	A	6	6	4101	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017769	AAG	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017769	GTC	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017769	AGG	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017769	TTA	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017769	TGT	2	6	4945	4950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017769	GTA	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017769	GTT	2	6	5048	5053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017769	T	7	7	5145	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017769	T	7	7	5190	5196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017769	GT	3	6	5509	5514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017769	TCTG	2	8	5518	5525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017769	A	7	7	5534	5540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017769	TAG	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017769	T	6	6	6387	6392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017769	A	6	6	6420	6425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017769	CTA	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017769	TA	3	6	6503	6508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017769	TA	4	8	6514	6521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017769	T	6	6	6525	6530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017769	CTA	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017769	T	6	6	6632	6637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017769	T	6	6	6675	6680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017769	AGG	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017769	CT	3	6	8170	8175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017769	TTC	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017769	CGG	2	6	9154	9159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017769	TATT	2	8	9240	9247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017769	T	6	6	9926	9931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017769	TCCC	2	8	9970	9977	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_017769	AT	3	6	10002	10007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017769	T	7	7	10081	10087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017769	GGT	2	6	10096	10101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017769	TAAA	2	8	10103	10110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017769	CAG	2	6	10141	10146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017769	TG	3	6	10149	10154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017769	GTT	2	6	10438	10443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017769	CATTG	2	10	10592	10601	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017769	T	6	6	11297	11302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017769	T	6	6	11352	11357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017769	GTT	2	6	11360	11365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017769	T	7	7	11376	11382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017769	TTGC	2	8	11484	11491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017769	TTCGT	2	10	11518	11527	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017769	CCT	2	6	12557	12562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017769	GAC	2	6	12568	12573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017769	ATT	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017769	ATT	2	6	12587	12592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017769	GTC	2	6	12593	12598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017769	A	7	7	12621	12627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017769	TTATT	2	10	12650	12659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017769	TAT	2	6	12685	12690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017769	GCTT	2	8	12736	12743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017769	T	8	8	12770	12777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017769	CTTT	2	8	14332	14339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017769	T	7	7	14402	14408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017769	TATTT	2	10	14410	14419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017769	T	9	9	14422	14430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017769	AATTA	2	10	14464	14473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017769	A	7	7	15249	15255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017769	ACC	2	6	15937	15942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017769	T	6	6	15958	15963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017769	GAA	2	6	15995	16000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017769	ACA	2	6	16735	16740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017769	A	9	9	16740	16748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017769	AGCT	2	8	16753	16760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017769	GCT	3	9	16758	16766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017769	CTGAA	2	10	16784	16793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017769	TAG	2	6	16817	16822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017769	GA	3	6	16829	16834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017769	TAT	3	9	16897	16905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017769	TGAC	2	8	16927	16934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017769	TCA	2	6	16949	16954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017769	A	8	8	17051	17058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017769	T	6	6	17166	17171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017769	CT	3	6	17661	17666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017769	CTTTT	2	10	17704	17713	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017769	TAT	2	6	17723	17728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017769	G	7	7	17755	17761	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017769	CGA	2	6	17863	17868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017769	C	6	6	17872	17877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_017769	T	6	6	17878	17883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017769	GTA	2	6	17905	17910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017769	A	6	6	17920	17925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017769	GTT	2	6	17964	17969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017769	AATA	2	8	17972	17979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017769	T	7	7	18174	18180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017769	GTA	2	6	18229	18234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017769	TAG	2	6	18250	18255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017769	A	6	6	18441	18446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017769	T	7	7	18475	18481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017769	TAT	3	9	18495	18503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017769	ATTT	2	8	18524	18531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017769	AG	3	6	18532	18537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017769	T	6	6	18638	18643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017769	GTTTT	2	10	18748	18757	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017769	AT	3	6	18806	18811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017769	A	6	6	18833	18838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017769	T	6	6	18856	18861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017769	TAG	2	6	18875	18880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017769	TAC	2	6	18932	18937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017769	A	7	7	18951	18957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017769	T	6	6	18968	18973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017769	GTT	2	6	18995	19000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017769	A	6	6	19004	19009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017769	CTA	2	6	19419	19424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017769	TTG	2	6	19428	19433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017769	CAA	2	6	19438	19443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017769	GAA	2	6	20154	20159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017769	T	7	7	20165	20171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017769	A	6	6	20222	20227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017769	A	6	6	20246	20251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017769	CAAA	2	8	20252	20259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017769	ATA	2	6	20281	20286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017769	TGA	2	6	20303	20308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017769	TAT	2	6	20360	20365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017769	ATT	3	9	21660	21668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017769	TGAAA	2	10	21740	21749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017769	TAA	2	6	22886	22891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017769	A	6	6	22911	22916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017769	TCT	2	6	27037	27042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017769	AAT	2	6	27065	27070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017769	TAA	2	6	27080	27085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017769	GA	3	6	32902	32907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017769	CT	3	6	32917	32922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017769	T	6	6	32922	32927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017769	A	8	8	33509	33516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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