MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans LJ23

Total Repeats: 7036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017768	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017768	ATC	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017768	T	6	6	122	127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017768	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017768	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017768	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017768	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017768	ACT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017768	TTA	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017768	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017768	GTT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017768	T	6	6	2868	2873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017768	A	7	7	2945	2951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017768	ATTA	2	8	2956	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017768	A	6	6	2988	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017768	TAT	2	6	3375	3380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017768	A	6	6	4608	4613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017768	CTT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017768	GGAAA	2	10	4662	4671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017768	TTA	2	6	8738	8743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017768	TGT	2	6	8785	8790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017768	ATAAA	2	10	8831	8840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017768	TAAT	2	8	12683	12690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017768	ACCA	2	8	14679	14686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017768	GGAATA	2	12	14696	14707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017768	TTA	2	6	14738	14743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017768	CATT	2	8	14759	14766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017768	TAAC	2	8	14775	14782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017768	TAA	2	6	14788	14793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017768	TGT	2	6	14840	14845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017768	T	7	7	14897	14903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017768	TTAA	2	8	14924	14931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017768	TTCA	2	8	14974	14981	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017768	TCGC	2	8	14991	14998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017768	AAT	2	6	15015	15020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017768	A	6	6	15039	15044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017768	T	6	6	15077	15082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017768	TAA	2	6	15122	15127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017768	TAA	2	6	15134	15139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017768	TAT	2	6	16617	16622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017768	AAG	2	6	16775	16780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017768	AACC	2	8	16784	16791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017768	GAAC	2	8	16830	16837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017768	GGC	2	6	16918	16923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017768	AC	3	6	16956	16961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017768	ATA	2	6	17066	17071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017768	ATT	2	6	17075	17080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017768	ATTG	2	8	17089	17096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017768	TAG	2	6	17116	17121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017768	GGTAA	2	10	17148	17157	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017768	CGA	2	6	17171	17176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017768	GCA	2	6	17245	17250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017768	CGC	2	6	17292	17297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017768	GTGA	2	8	17298	17305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017768	TGT	2	6	17331	17336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017768	GT	3	6	17348	17353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017768	CA	3	6	17368	17373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017768	CAG	2	6	17414	17419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017768	AT	3	6	17598	17603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017768	GGA	2	6	17604	17609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017768	CT	3	6	17629	17634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017768	GAA	2	6	17868	17873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017768	GGT	2	6	17942	17947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017768	GTC	2	6	17956	17961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017768	TCGTG	2	10	17965	17974	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017768	CAT	2	6	18024	18029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017768	TAA	2	6	18059	18064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017768	GGA	2	6	18068	18073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017768	ATC	2	6	18092	18097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017768	AC	3	6	18119	18124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017768	CGC	2	6	18258	18263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017768	AC	3	6	18288	18293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017768	CAC	2	6	18303	18308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017768	GCC	2	6	18356	18361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017768	GATG	2	8	18370	18377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017768	CCT	2	6	18430	18435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017768	CTT	2	6	18469	18474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017768	AGG	2	6	18537	18542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017768	AGA	2	6	18615	18620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017768	AGTC	2	8	18640	18647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017768	AAGA	2	8	18782	18789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017768	GTTAA	2	10	18828	18837	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017768	ACGA	2	8	18887	18894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017768	GTAA	2	8	18914	18921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017768	GAAG	2	8	18996	19003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017768	GCG	2	6	19067	19072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017768	AGG	2	6	19084	19089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017768	AGC	2	6	19134	19139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017768	AGA	3	9	19149	19157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017768	AG	4	8	19175	19182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017768	CGG	2	6	19233	19238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017768	AAG	2	6	19385	19390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017768	TTACGT	2	12	19443	19454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017768	GGA	2	6	19583	19588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017768	TC	3	6	19669	19674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017768	GTCG	2	8	19696	19703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017768	TTGA	2	8	19730	19737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017768	ACC	2	6	19848	19853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017768	AAT	2	6	19868	19873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017768	AGC	2	6	19928	19933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017768	ATTC	2	8	19935	19942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017768	GA	3	6	20206	20211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017768	AGG	2	6	20270	20275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017768	GCA	2	6	20279	20284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017768	GTGAG	2	10	20325	20334	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017768	CCA	2	6	20361	20366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017768	TAG	2	6	20389	20394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017768	CT	3	6	20618	20623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017768	CGG	2	6	20729	20734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017768	GA	3	6	20827	20832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017768	TAGG	2	8	20945	20952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017768	GTT	2	6	20989	20994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017768	TAC	2	6	20999	21004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017768	TG	3	6	21008	21013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017768	ATC	2	6	21039	21044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017768	CCT	2	6	21087	21092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017768	GACA	2	8	21180	21187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017768	GGT	2	6	21223	21228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017768	TCG	2	6	21338	21343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017768	CGT	2	6	21418	21423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017768	GTT	2	6	21521	21526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017768	AGGG	2	8	21556	21563	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017768	C	6	6	21594	21599	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_017768	GA	3	6	21642	21647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017768	T	6	6	21808	21813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017768	T	6	6	21837	21842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017768	AAAG	2	8	21843	21850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017768	TAGC	2	8	21872	21879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017768	GTGA	2	8	21889	21896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017768	TGA	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017768	CAG	2	6	21956	21961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017768	AGT	2	6	21982	21987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017768	GTC	2	6	22013	22018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017768	TTAG	2	8	22123	22130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017768	GTG	2	6	22138	22143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017768	AG	3	6	22218	22223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017768	ATC	2	6	22226	22231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017768	TCA	2	6	22302	22307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017768	CGT	2	6	22553	22558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017768	AGG	2	6	22566	22571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017768	ATAA	2	8	22656	22663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017768	ATG	2	6	22777	22782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017768	ATT	2	6	22869	22874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017768	CGC	2	6	22941	22946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017768	ATTA	2	8	22952	22959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017768	GGA	2	6	23060	23065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017768	GCGT	2	8	23119	23126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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149	NC_017768	TCG	2	6	23186	23191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017768	CGG	2	6	23292	23297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017768	TGT	2	6	23363	23368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017768	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_017768	GTA	2	6	23599	23604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017768	TAAA	2	8	25011	25018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017768	AT	3	6	25036	25041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017768	TCA	2	6	26449	26454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_017768	T	8	8	27533	27540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_017768	A	7	7	29561	29567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017768	A	6	6	38955	38960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_017768	GGA	2	6	52729	52734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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