MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 chromosome

Total Repeats: 42920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017765	CGCC	2	8	349802	349809	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3502	NC_017765	CCG	2	6	349835	349840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_017765	CCT	2	6	349862	349867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_017765	GACG	2	8	350008	350015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_017765	CGGC	2	8	350016	350023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_017765	GCC	2	6	350117	350122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_017765	GTC	2	6	350123	350128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_017765	CGT	2	6	350178	350183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017765	GCT	2	6	350189	350194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_017765	CGC	2	6	350259	350264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_017765	CA	4	8	350280	350287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_017765	GT	3	6	350630	350635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017765	GCT	2	6	350662	350667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017765	CAG	2	6	350675	350680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_017765	AGC	2	6	350778	350783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017765	CAGC	3	12	350780	350791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_017765	G	6	6	350795	350800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017765	TGGA	2	8	350824	350831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017765	GCC	2	6	350887	350892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_017765	CTG	2	6	350961	350966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_017765	ACCTG	2	10	350981	350990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3522	NC_017765	GGC	2	6	351002	351007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_017765	GCA	2	6	352226	352231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017765	GGCC	2	8	352345	352352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_017765	AGT	2	6	352376	352381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017765	T	6	6	352460	352465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017765	GATGCA	2	12	352487	352498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3528	NC_017765	GGC	2	6	352581	352586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_017765	CTT	3	9	352592	352600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_017765	TTC	2	6	352631	352636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_017765	GGA	2	6	352719	352724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017765	CTG	2	6	352740	352745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_017765	GCT	2	6	352751	352756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_017765	G	6	6	352769	352774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017765	CAA	2	6	352775	352780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_017765	TCA	2	6	352882	352887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_017765	GCT	2	6	352917	352922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_017765	GCC	2	6	352947	352952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_017765	GAT	3	9	353010	353018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017765	CGA	2	6	353048	353053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017765	GA	3	6	353101	353106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017765	CT	3	6	353248	353253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_017765	AGC	2	6	353292	353297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017765	CCG	2	6	353302	353307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_017765	TCCC	2	8	353338	353345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3546	NC_017765	AGTG	2	8	353371	353378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017765	ACCGG	2	10	353510	353519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3548	NC_017765	CAC	2	6	353528	353533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_017765	CTCAC	2	10	353622	353631	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3550	NC_017765	TCC	2	6	353661	353666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_017765	CGA	2	6	353707	353712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017765	GGCT	2	8	353853	353860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_017765	CAG	2	6	354057	354062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_017765	CTG	2	6	354083	354088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_017765	GCC	2	6	355308	355313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_017765	CAGGT	2	10	355325	355334	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3557	NC_017765	GCA	2	6	355348	355353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017765	GTCCC	2	10	355354	355363	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3559	NC_017765	GCG	2	6	355385	355390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_017765	TGCT	2	8	355391	355398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_017765	GTGGG	2	10	355400	355409	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017765	CGA	2	6	355516	355521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_017765	GATCA	2	10	355538	355547	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3564	NC_017765	GC	3	6	355700	355705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_017765	ACCA	2	8	355758	355765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_017765	TGG	3	9	355771	355779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017765	CAG	2	6	355780	355785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_017765	CCT	2	6	355799	355804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_017765	CAA	2	6	355876	355881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_017765	GCT	2	6	355884	355889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_017765	TAGT	2	8	355930	355937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017765	CGC	2	6	356059	356064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_017765	AGG	2	6	356065	356070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017765	GTA	2	6	356118	356123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017765	TTG	2	6	356159	356164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017765	GGGT	2	8	356194	356201	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017765	CGA	2	6	356224	356229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_017765	GAG	2	6	356266	356271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017765	GGC	2	6	356319	356324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_017765	TGG	2	6	356388	356393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017765	CTG	2	6	356411	356416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_017765	TGC	2	6	356420	356425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_017765	CTC	2	6	357680	357685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_017765	CAG	2	6	357765	357770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3588	NC_017765	GCC	2	6	357897	357902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_017765	AGC	2	6	357923	357928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3591	NC_017765	TGG	2	6	358043	358048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_017765	CGG	2	6	359319	359324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_017765	CGT	2	6	359458	359463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3597	NC_017765	CCA	2	6	359539	359544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_017765	CGG	2	6	359578	359583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_017765	CGA	2	6	359590	359595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017765	TG	3	6	359672	359677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017765	GC	3	6	359693	359698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_017765	CGT	2	6	359745	359750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_017765	CGG	2	6	359816	359821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017765	CGG	2	6	359851	359856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_017765	GAT	2	6	359893	359898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017765	CGC	2	6	359899	359904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_017765	TCA	2	6	359915	359920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017765	CCG	2	6	359936	359941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_017765	GTCC	2	8	359994	360001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_017765	CAC	2	6	360053	360058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_017765	CTC	2	6	360967	360972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_017765	GA	3	6	360996	361001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017765	CAG	2	6	361024	361029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_017765	ACG	2	6	361079	361084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017765	ACCG	2	8	361118	361125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_017765	TCGT	2	8	361810	361817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_017765	GC	3	6	361883	361888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_017765	ACG	2	6	361925	361930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_017765	TCG	2	6	362044	362049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017765	GGCG	2	8	362092	362099	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_017765	GTG	2	6	362105	362110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017765	CGAG	3	12	362128	362139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_017765	CCT	2	6	362180	362185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_017765	CT	3	6	362184	362189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_017765	CGGA	2	8	362211	362218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_017765	GCG	2	6	362259	362264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_017765	GTTC	2	8	362304	362311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_017765	TTC	2	6	362326	362331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_017765	CTGA	2	8	362340	362347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_017765	CTG	2	6	362352	362357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_017765	GCC	2	6	362405	362410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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