MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus HO 5096 0412

Total Repeats: 13694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017763	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017763	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017763	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017763	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017763	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017763	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017763	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017763	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017763	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017763	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017763	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017763	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017763	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017763	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017763	CAT	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017763	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017763	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017763	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017763	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017763	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017763	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017763	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017763	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017763	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017763	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017763	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017763	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017763	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017763	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017763	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017763	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017763	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017763	A	7	7	9676	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017763	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017763	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017763	ATT	3	9	10673	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017763	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017763	ACA	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017763	ATA	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017763	AAG	2	6	10858	10863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017763	TAA	2	6	12484	12489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017763	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017763	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017763	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017763	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017763	T	7	7	12716	12722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017763	A	6	6	12730	12735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017763	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017763	ATA	2	6	12755	12760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017763	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017763	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017763	ATA	2	6	14148	14153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017763	GTG	2	6	14163	14168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017763	T	7	7	14185	14191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017763	AAC	2	6	14227	14232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017763	CAA	2	6	14280	14285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017763	ATG	2	6	14298	14303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017763	TAT	2	6	14343	14348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017763	A	6	6	14364	14369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017763	GTA	2	6	14384	14389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017763	GTAGG	2	10	14407	14416	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017763	GAT	3	9	14424	14432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017763	TCA	2	6	14468	14473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017763	A	6	6	14482	14487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017763	AAC	2	6	14508	14513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017763	TAAA	2	8	14545	14552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017763	A	7	7	14550	14556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017763	TAT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017763	T	6	6	14683	14688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017763	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017763	AGG	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017763	AAC	2	6	15890	15895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017763	TCA	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017763	CTT	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017763	T	8	8	16088	16095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017763	AGG	2	6	16101	16106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017763	TA	3	6	17091	17096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017763	A	6	6	17102	17107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017763	TAAATC	2	12	17175	17186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017763	AAT	2	6	17214	17219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017763	CA	3	6	17237	17242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017763	TTA	2	6	17288	17293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017763	AAT	2	6	22190	22195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017763	AT	3	6	22245	22250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017763	TGA	2	6	22272	22277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017763	A	6	6	22351	22356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017763	TA	3	6	23740	23745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017763	AGG	2	6	23794	23799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017763	TCGAT	2	10	23823	23832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017763	GAT	2	6	23893	23898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017763	AAG	2	6	23912	23917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017763	TAA	2	6	23931	23936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017763	ATT	2	6	24024	24029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017763	ATA	2	6	24030	24035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017763	TTC	2	6	24075	24080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017763	A	6	6	24081	24086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017763	A	6	6	24104	24109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017763	ATCT	2	8	24142	24149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017763	CGG	2	6	24200	24205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017763	T	6	6	24238	24243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017763	GCCT	2	8	24270	24277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017763	T	7	7	24346	24352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017763	ATATT	2	10	24360	24369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017763	AT	3	6	24378	24383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017763	TTC	2	6	24532	24537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017763	CCA	2	6	24549	24554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017763	TCC	2	6	24556	24561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017763	AAT	2	6	24586	24591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017763	AAT	2	6	24593	24598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017763	ATTT	2	8	24602	24609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017763	TAT	2	6	24654	24659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017763	TCA	2	6	24673	24678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017763	CCG	2	6	24704	24709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017763	TAA	2	6	24718	24723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017763	A	6	6	24722	24727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017763	AT	3	6	24733	24738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017763	TA	3	6	24784	24789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017763	T	6	6	24858	24863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017763	A	6	6	24888	24893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017763	ATA	2	6	24901	24906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017763	TAA	2	6	29603	29608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017763	TCA	2	6	29624	29629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017763	TAT	2	6	29668	29673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017763	AGT	2	6	29727	29732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017763	TAA	2	6	29797	29802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017763	ATA	2	6	29871	29876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017763	AG	3	6	29961	29966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017763	CTG	2	6	30816	30821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017763	GAC	2	6	30825	30830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017763	T	6	6	30843	30848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017763	TGT	2	6	30850	30855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017763	TGG	2	6	30856	30861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017763	TGT	2	6	30870	30875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017763	AAT	2	6	30906	30911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017763	AAT	2	6	30934	30939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017763	ATCA	2	8	30949	30956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017763	AT	3	6	33335	33340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017763	TAC	2	6	33350	33355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017763	T	7	7	33386	33392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017763	A	6	6	33397	33402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017763	TAA	2	6	33446	33451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017763	A	7	7	33607	33613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017763	TAA	2	6	33621	33626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017763	TAA	2	6	33648	33653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017763	GGA	2	6	33686	33691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017763	T	6	6	34186	34191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017763	AAG	2	6	34263	34268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017763	TTTCA	2	10	34322	34331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017763	ATA	2	6	34337	34342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017763	TTCT	2	8	34401	34408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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