MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 14448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017623	TAA	2	6	4565945	4565950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_017623	TGC	2	6	4565957	4565962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_017623	CG	4	8	4565965	4565972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14004	NC_017623	T	6	6	4565973	4565978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_017623	CAATA	2	10	4565982	4565991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14006	NC_017623	TGTGC	2	10	4567504	4567513	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14007	NC_017623	CGT	2	6	4567535	4567540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_017623	CGC	2	6	4567805	4567810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14009	NC_017623	CTT	2	6	4567826	4567831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_017623	A	8	8	4568322	4568329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_017623	CTTT	2	8	4568367	4568374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14012	NC_017623	TCT	2	6	4568377	4568382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_017623	GTA	2	6	4568406	4568411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_017623	ATT	2	6	4568422	4568427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_017623	A	6	6	4568467	4568472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_017623	GGCTAC	2	12	4568497	4568508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_017623	GAA	2	6	4568512	4568517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_017623	CAG	2	6	4568518	4568523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_017623	A	6	6	4573491	4573496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_017623	CCAT	2	8	4573615	4573622	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_017623	ACTC	2	8	4573720	4573727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14022	NC_017623	GCC	2	6	4573732	4573737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14023	NC_017623	ATT	2	6	4573752	4573757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_017623	TA	3	6	4573763	4573768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_017623	ATC	2	6	4573839	4573844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14027	NC_017623	CGG	2	6	4576221	4576226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_017623	GCA	2	6	4576241	4576246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_017623	TGG	3	9	4576289	4576297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_017623	TTG	2	6	4579254	4579259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_017623	AT	3	6	4581717	4581722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_017623	AT	3	6	4581748	4581753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_017623	AAT	2	6	4581756	4581761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_017623	ATC	2	6	4581780	4581785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_017623	AGTC	2	8	4582616	4582623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14036	NC_017623	TTAAA	2	10	4582630	4582639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14038	NC_017623	T	6	6	4582703	4582708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_017623	TC	3	6	4582737	4582742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_017623	ATT	2	6	4582745	4582750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_017623	CTT	2	6	4583469	4583474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_017623	ATC	2	6	4585566	4585571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_017623	CG	3	6	4585622	4585627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14047	NC_017623	T	6	6	4585742	4585747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_017623	GC	3	6	4585766	4585771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14049	NC_017623	GCT	2	6	4585796	4585801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_017623	AAT	2	6	4585857	4585862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_017623	AAAT	2	8	4585902	4585909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_017623	GGC	3	9	4585981	4585989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14054	NC_017623	ACT	2	6	4586079	4586084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_017623	GAT	2	6	4586093	4586098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_017623	T	6	6	4586127	4586132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_017623	TTTC	2	8	4586184	4586191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14058	NC_017623	TTTC	2	8	4586252	4586259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14059	NC_017623	CGA	2	6	4586293	4586298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_017623	TAA	2	6	4586444	4586449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_017623	AT	3	6	4586503	4586508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_017623	TC	3	6	4586598	4586603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14063	NC_017623	TAT	2	6	4586633	4586638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_017623	AT	3	6	4586652	4586657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_017623	CTG	2	6	4586666	4586671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14068	NC_017623	CTT	2	6	4589941	4589946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14071	NC_017623	T	7	7	4589986	4589992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14073	NC_017623	GGC	2	6	4590066	4590071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14098	NC_017623	TTA	2	6	4601344	4601349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_017623	TTTA	2	8	4601449	4601456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14103	NC_017623	AAT	2	6	4603882	4603887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14108	NC_017623	TA	3	6	4612028	4612033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_017623	T	6	6	4612050	4612055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_017623	TCGC	2	8	4612071	4612078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14111	NC_017623	CCA	2	6	4612123	4612128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14112	NC_017623	AATT	2	8	4612204	4612211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_017623	CGCC	2	8	4612227	4612234	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14114	NC_017623	ATTG	2	8	4613660	4613667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_017623	GTG	2	6	4613703	4613708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14119	NC_017623	A	6	6	4619390	4619395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_017623	GC	4	8	4619437	4619444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14124	NC_017623	TC	3	6	4619569	4619574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14125	NC_017623	CCA	2	6	4619579	4619584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14126	NC_017623	TTA	3	9	4619616	4619624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_017623	ATA	2	6	4619641	4619646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14129	NC_017623	ATT	2	6	4619678	4619683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14253	NC_017623	ATCA	2	8	4650528	4650535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14254	NC_017623	TGC	2	6	4651704	4651709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14389	NC_017623	CGT	3	9	4716666	4716674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.