MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 14448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017623	GTC	2	6	4164640	4164645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_017623	TCA	2	6	4164647	4164652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_017623	TCC	2	6	4164659	4164664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13004	NC_017623	CGC	2	6	4164744	4164749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_017623	GCC	2	6	4164811	4164816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_017623	ATA	2	6	4164835	4164840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_017623	GCA	2	6	4164906	4164911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_017623	TCA	2	6	4164920	4164925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_017623	GC	3	6	4164928	4164933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13010	NC_017623	CTG	2	6	4164952	4164957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_017623	GCGGCA	2	12	4165032	4165043	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_017623	TGC	2	6	4165076	4165081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_017623	GGTT	2	8	4165136	4165143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017623	CGC	2	6	4165160	4165165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_017623	CGG	2	6	4165215	4165220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_017623	CGG	2	6	4165254	4165259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_017623	CAG	2	6	4165273	4165278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_017623	CGA	2	6	4165293	4165298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_017623	GC	3	6	4165364	4165369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_017623	TAA	2	6	4165451	4165456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017623	CGTC	2	8	4165487	4165494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_017623	TCG	2	6	4165550	4165555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_017623	CCG	2	6	4165572	4165577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13024	NC_017623	A	6	6	4165692	4165697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_017623	TCCGCT	2	12	4165817	4165828	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_017623	TCGCGC	2	12	4165898	4165909	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13027	NC_017623	TCC	2	6	4165913	4165918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_017623	GTT	2	6	4165962	4165967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_017623	CAA	3	9	4165968	4165976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_017623	A	6	6	4166017	4166022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_017623	GCA	2	6	4166061	4166066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_017623	CAC	2	6	4166101	4166106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13033	NC_017623	TCA	3	9	4166151	4166159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_017623	CAC	2	6	4166212	4166217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_017623	ATA	2	6	4166228	4166233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_017623	TCA	2	6	4166285	4166290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_017623	CGCTA	2	10	4166291	4166300	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13038	NC_017623	GGT	2	6	4166303	4166308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_017623	TCAT	2	8	4167350	4167357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13040	NC_017623	TGA	2	6	4167366	4167371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_017623	T	6	6	4167392	4167397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_017623	A	6	6	4167480	4167485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_017623	AGC	2	6	4167557	4167562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_017623	A	6	6	4167571	4167576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_017623	TCA	2	6	4167713	4167718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_017623	ATG	2	6	4167803	4167808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_017623	CG	3	6	4167841	4167846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13048	NC_017623	TGT	2	6	4167895	4167900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_017623	ATGAC	2	10	4173984	4173993	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13050	NC_017623	TGA	2	6	4174018	4174023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_017623	CTG	2	6	4174055	4174060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_017623	ACA	2	6	4175218	4175223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_017623	GGC	2	6	4175249	4175254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_017623	T	7	7	4175301	4175307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_017623	TCTT	2	8	4175345	4175352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_017623	T	6	6	4177850	4177855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017623	TTC	2	6	4181497	4181502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_017623	GTT	2	6	4181508	4181513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_017623	TCA	2	6	4181546	4181551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_017623	T	6	6	4182524	4182529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_017623	T	7	7	4182533	4182539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_017623	GTGC	2	8	4182545	4182552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13063	NC_017623	ATT	2	6	4183415	4183420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_017623	TAC	2	6	4183422	4183427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_017623	CGG	2	6	4183452	4183457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_017623	GGC	2	6	4183459	4183464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_017623	TCA	2	6	4183468	4183473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_017623	ACT	2	6	4183476	4183481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_017623	GTC	2	6	4183482	4183487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_017623	A	6	6	4184670	4184675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_017623	GAT	2	6	4184708	4184713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_017623	ACA	2	6	4184772	4184777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_017623	A	7	7	4184816	4184822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_017623	CCG	2	6	4184824	4184829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_017623	T	6	6	4184837	4184842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_017623	GAC	3	9	4184895	4184903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_017623	A	6	6	4185844	4185849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_017623	CT	3	6	4185850	4185855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13079	NC_017623	TCGG	2	8	4185951	4185958	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13080	NC_017623	ATA	2	6	4185974	4185979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_017623	GCGCT	2	10	4185995	4186004	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13082	NC_017623	GACA	2	8	4186068	4186075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_017623	GTC	2	6	4187360	4187365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_017623	ATC	2	6	4187369	4187374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_017623	CAG	2	6	4187420	4187425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_017623	TTCA	2	8	4187858	4187865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13087	NC_017623	AGC	2	6	4187875	4187880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_017623	A	6	6	4187888	4187893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_017623	CCAGG	2	10	4187972	4187981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13090	NC_017623	CTT	2	6	4189415	4189420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_017623	CTT	2	6	4190535	4190540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_017623	CGCC	2	8	4191229	4191236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13093	NC_017623	CAG	2	6	4191287	4191292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_017623	GCG	2	6	4194229	4194234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_017623	ACC	2	6	4194501	4194506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_017623	TGA	2	6	4194539	4194544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_017623	TCA	2	6	4194565	4194570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_017623	CGA	2	6	4194572	4194577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_017623	TGTTC	2	10	4194605	4194614	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13100	NC_017623	ATT	2	6	4194621	4194626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_017623	GAA	2	6	4197517	4197522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017623	AAT	2	6	4197613	4197618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_017623	TCA	2	6	4197650	4197655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_017623	TTAT	2	8	4198963	4198970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_017623	TAA	2	6	4198971	4198976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_017623	T	6	6	4198999	4199004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_017623	AG	3	6	4200063	4200068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_017623	GGT	2	6	4200081	4200086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_017623	CTA	2	6	4200098	4200103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_017623	ACA	2	6	4200114	4200119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_017623	AATT	2	8	4200133	4200140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_017623	ATT	2	6	4200222	4200227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_017623	AAT	2	6	4200278	4200283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_017623	GTT	2	6	4200284	4200289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_017623	AAG	2	6	4200334	4200339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_017623	CTC	2	6	4200363	4200368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13117	NC_017623	AGA	2	6	4200371	4200376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017623	CAC	2	6	4200888	4200893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_017623	ATGA	2	8	4200894	4200901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_017623	A	7	7	4200908	4200914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_017623	T	6	6	4200931	4200936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_017623	GATT	2	8	4200941	4200948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_017623	T	6	6	4200957	4200962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_017623	GCG	2	6	4200971	4200976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_017623	A	6	6	4201008	4201013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_017623	ATTA	2	8	4201058	4201065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_017623	TGA	2	6	4201095	4201100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_017623	CGA	2	6	4201134	4201139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13259	NC_017623	CTTT	2	8	4241190	4241197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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