MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 14448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017623	GCC	2	6	3221434	3221439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_017623	CA	3	6	3222728	3222733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_017623	TGA	2	6	3222846	3222851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017623	GGC	2	6	3222904	3222909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017623	ATT	2	6	3222948	3222953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017623	TCA	2	6	3223064	3223069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_017623	CG	3	6	3223091	3223096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_017623	CTGGCG	2	12	3223102	3223113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_017623	AGC	2	6	3223148	3223153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_017623	GCCGCT	2	12	3223167	3223178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_017623	GACC	2	8	3223254	3223261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_017623	A	6	6	3223324	3223329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_017623	CGG	2	6	3223410	3223415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_017623	TTCG	2	8	3223418	3223425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_017623	AAC	2	6	3223509	3223514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_017623	GGC	3	9	3223586	3223594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_017623	GC	3	6	3223602	3223607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_017623	GAC	2	6	3223661	3223666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_017623	GCCC	2	8	3223669	3223676	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10020	NC_017623	GC	3	6	3223701	3223706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_017623	CGC	2	6	3223732	3223737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_017623	ATG	2	6	3223785	3223790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_017623	GCG	2	6	3223821	3223826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_017623	GGATG	2	10	3223838	3223847	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_017623	CAG	2	6	3223856	3223861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_017623	CCG	2	6	3223893	3223898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_017623	GAC	2	6	3223948	3223953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_017623	GGA	2	6	3223961	3223966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_017623	GGC	2	6	3223982	3223987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_017623	GCCA	2	8	3224129	3224136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_017623	CGT	2	6	3224143	3224148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_017623	G	6	6	3224213	3224218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_017623	GTCA	2	8	3224222	3224229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_017623	CAC	2	6	3224236	3224241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_017623	ACG	2	6	3224277	3224282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_017623	CGC	2	6	3224292	3224297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_017623	CAG	2	6	3224312	3224317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_017623	CGA	2	6	3224347	3224352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_017623	GAA	2	6	3224369	3224374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_017623	GCG	2	6	3224466	3224471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_017623	TGG	2	6	3224502	3224507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_017623	CCACG	2	10	3224524	3224533	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10043	NC_017623	CGG	2	6	3224571	3224576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_017623	CGCCTG	2	12	3224577	3224588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_017623	GGC	2	6	3224665	3224670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_017623	GGC	2	6	3224713	3224718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_017623	GTCA	2	8	3224780	3224787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_017623	GGC	2	6	3224797	3224802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_017623	CG	3	6	3224884	3224889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_017623	TGA	2	6	3225210	3225215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_017623	CGC	2	6	3228513	3228518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_017623	TCC	2	6	3229492	3229497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_017623	GAG	2	6	3229564	3229569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_017623	GCA	2	6	3230181	3230186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_017623	TCA	2	6	3230258	3230263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_017623	TGAA	2	8	3230779	3230786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_017623	T	6	6	3230793	3230798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_017623	ATT	3	9	3230830	3230838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_017623	AGG	2	6	3230848	3230853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_017623	A	7	7	3234465	3234471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_017623	GAT	2	6	3234488	3234493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_017623	CGT	2	6	3234502	3234507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_017623	TGG	2	6	3234892	3234897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_017623	CG	3	6	3234950	3234955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_017623	CCG	2	6	3234974	3234979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_017623	GCCA	2	8	3234985	3234992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_017623	A	6	6	3235018	3235023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_017623	AAT	2	6	3235152	3235157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_017623	TCGCAG	2	12	3235208	3235219	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_017623	ATC	2	6	3235225	3235230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_017623	CAA	2	6	3237448	3237453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_017623	ATTTTT	2	12	3237499	3237510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_017623	TTA	2	6	3237554	3237559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_017623	CAG	2	6	3237572	3237577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_017623	ATC	2	6	3237580	3237585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_017623	ACG	2	6	3237599	3237604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_017623	GAA	2	6	3237646	3237651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_017623	CCT	2	6	3238633	3238638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_017623	AATT	2	8	3238699	3238706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_017623	ATT	2	6	3238763	3238768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_017623	T	6	6	3238824	3238829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_017623	TGC	2	6	3238839	3238844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_017623	CTC	2	6	3238919	3238924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_017623	GCA	2	6	3238938	3238943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_017623	GAT	2	6	3238984	3238989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_017623	ATA	2	6	3241888	3241893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_017623	ACA	2	6	3241904	3241909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_017623	A	6	6	3241934	3241939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_017623	GCTT	2	8	3241993	3242000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10090	NC_017623	AAG	2	6	3242005	3242010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_017623	CTT	2	6	3242013	3242018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_017623	A	7	7	3242035	3242041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_017623	ATT	2	6	3242102	3242107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_017623	TAT	2	6	3242110	3242115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_017623	T	7	7	3243611	3243617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_017623	T	6	6	3243698	3243703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_017623	GTA	2	6	3243718	3243723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_017623	TAAT	2	8	3243763	3243770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_017623	GT	3	6	3243776	3243781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_017623	ATA	2	6	3243829	3243834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_017623	CAGC	2	8	3243924	3243931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_017623	AC	3	6	3244334	3244339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_017623	T	6	6	3244342	3244347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_017623	CAGT	2	8	3244362	3244369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10105	NC_017623	GAA	2	6	3244389	3244394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017623	GAT	2	6	3244457	3244462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_017623	AC	3	6	3244506	3244511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_017623	TC	3	6	3247563	3247568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_017623	AAC	2	6	3247591	3247596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_017623	GTT	2	6	3247605	3247610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_017623	TCA	3	9	3248567	3248575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_017623	CGT	2	6	3248632	3248637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_017623	GCA	2	6	3248714	3248719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_017623	TGC	2	6	3248770	3248775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_017623	CATTT	2	10	3248821	3248830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10116	NC_017623	TGA	2	6	3248862	3248867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_017623	AAAT	2	8	3248884	3248891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017623	TCC	2	6	3248893	3248898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_017623	CT	3	6	3248935	3248940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_017623	TTAC	2	8	3248994	3249001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_017623	ACT	2	6	3249195	3249200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_017623	AC	3	6	3249230	3249235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_017623	CGG	2	6	3249243	3249248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_017623	CA	3	6	3249317	3249322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_017623	TGC	2	6	3249335	3249340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_017623	TC	3	6	3249356	3249361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_017623	TTG	2	6	3249473	3249478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_017623	TC	3	6	3249595	3249600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10249	NC_017623	GTT	2	6	3271852	3271857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10255	NC_017623	GGC	2	6	3272323	3272328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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