MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 14448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017623	CTT	2	6	155832	155837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017623	GCC	2	6	155902	155907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_017623	AAG	2	6	155936	155941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017623	CGT	2	6	156105	156110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017623	TTTGTT	2	12	156205	156216	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017623	TCA	2	6	156276	156281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017623	AAG	2	6	156371	156376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017623	TCA	2	6	156381	156386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017623	GAA	2	6	156394	156399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017623	AGT	2	6	156417	156422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017623	CAA	2	6	156436	156441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017623	GGTC	2	8	156477	156484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017623	CAG	2	6	156529	156534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017623	CGC	3	9	156585	156593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_017623	ATC	2	6	156626	156631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017623	GC	3	6	156651	156656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_017623	TGC	2	6	156665	156670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017623	CCAGC	2	10	156673	156682	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
519	NC_017623	ACG	2	6	156693	156698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017623	CGT	2	6	156927	156932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017623	CAT	2	6	156948	156953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017623	CACG	2	8	156969	156976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_017623	CAG	2	6	157033	157038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017623	AAG	2	6	157058	157063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017623	GATC	2	8	157131	157138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_017623	GCG	2	6	157208	157213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017623	CAC	2	6	157225	157230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_017623	TGGT	2	8	157262	157269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017623	GC	3	6	157359	157364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_017623	GGT	2	6	157426	157431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017623	CTTC	2	8	157491	157498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_017623	CTT	2	6	157524	157529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017623	GC	3	6	157563	157568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017623	GGC	2	6	157587	157592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017623	CCA	2	6	157611	157616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_017623	GC	3	6	157638	157643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_017623	GAT	2	6	157656	157661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017623	GCA	2	6	157785	157790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017623	GCC	3	9	157841	157849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_017623	GTG	2	6	157850	157855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017623	CTG	2	6	157895	157900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017623	GTT	2	6	157977	157982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017623	TCC	2	6	158031	158036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017623	GAG	2	6	158043	158048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017623	GT	5	10	158073	158082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017623	AAAG	2	8	158096	158103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017623	GAA	2	6	158121	158126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017623	CT	3	6	158167	158172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017623	TCC	2	6	158193	158198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017623	TGA	2	6	158204	158209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017623	AT	4	8	158966	158973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017623	CT	3	6	158991	158996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_017623	CGAA	2	8	159107	159114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_017623	A	6	6	159113	159118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017623	ATA	2	6	160254	160259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017623	A	8	8	160289	160296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017623	A	6	6	160320	160325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017623	TATCAA	2	12	160357	160368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
559	NC_017623	GC	3	6	161539	161544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_017623	T	6	6	161607	161612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017623	TTA	2	6	161677	161682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017623	GGC	2	6	161810	161815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017623	TCA	2	6	161823	161828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017623	CGAA	2	8	162863	162870	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_017623	TCGT	2	8	162918	162925	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_017623	GGC	2	6	163508	163513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017623	A	6	6	163536	163541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017623	A	7	7	165058	165064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017623	AGCGC	2	10	166054	166063	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
570	NC_017623	CTT	2	6	168876	168881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017623	A	6	6	168902	168907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017623	ACCT	2	8	168918	168925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017623	CAA	2	6	168957	168962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017623	CTA	2	6	168995	169000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017623	GTC	2	6	169016	169021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017623	A	7	7	169053	169059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017623	GC	3	6	169070	169075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_017623	AGG	2	6	169140	169145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017623	TCG	2	6	170011	170016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017623	GGC	2	6	170053	170058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017623	CGG	2	6	170077	170082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017623	TGC	2	6	170136	170141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017623	ATT	2	6	172035	172040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017623	T	6	6	172039	172044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017623	GCC	2	6	172113	172118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017623	A	6	6	172173	172178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017623	TCA	2	6	172248	172253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017623	ATT	2	6	172363	172368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017623	GTT	2	6	172371	172376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017623	AT	3	6	172398	172403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017623	AAATAT	2	12	172428	172439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017623	GTT	2	6	172460	172465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017623	TTTTA	2	10	172480	172489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017623	ATTT	2	8	172509	172516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017623	TTAAA	2	10	172546	172555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017623	TAT	2	6	172590	172595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017623	TTTTAA	2	12	172624	172635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017623	TAT	2	6	173339	173344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017623	T	8	8	173380	173387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017623	TGA	2	6	173394	173399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017623	ATT	2	6	173410	173415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017623	GATTA	2	10	175310	175319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017623	TAA	2	6	176317	176322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017623	CTT	2	6	176359	176364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017623	AAAG	2	8	176397	176404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017623	TCA	2	6	176445	176450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017623	A	6	6	176475	176480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017623	T	7	7	176484	176490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017623	TTAA	2	8	176558	176565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017623	AAT	2	6	176614	176619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017623	GAT	2	6	176623	176628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017623	TGA	2	6	177280	177285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017623	T	7	7	177291	177297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017623	AGC	2	6	177312	177317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017623	ATTA	2	8	178508	178515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017623	GAA	2	6	178567	178572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017623	GAG	2	6	178615	178620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017623	T	6	6	178647	178652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017623	TGA	2	6	178707	178712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017623	TCA	2	6	180887	180892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017623	GTT	2	6	180917	180922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017623	TC	3	6	180965	180970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_017623	ATG	2	6	181554	181559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017623	T	8	8	181566	181573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017623	TTA	2	6	181594	181599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017623	TAC	2	6	181625	181630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017623	AGA	2	6	181635	181640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017623	GCCAG	2	10	182576	182585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
629	NC_017623	CCTGA	2	10	182615	182624	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
630	NC_017623	CAG	2	6	182632	182637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017623	GC	3	6	183713	183718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_017623	GCC	2	6	183782	183787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_017623	T	7	7	183832	183838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017623	TCA	2	6	183877	183882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017623	CAACA	2	10	183883	183892	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
636	NC_017623	TAT	2	6	184920	184925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017623	T	6	6	184935	184940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017623	GTTA	2	8	185884	185891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_017623	TAT	3	9	219289	219297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_017623	CAT	2	6	225924	225929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_017623	A	7	7	227135	227141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_017623	AACGT	2	10	227150	227159	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
774	NC_017623	TTAT	2	8	227188	227195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_017623	GAA	2	6	228791	228796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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