MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 14448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017623	GC	3	6	2599705	2599710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_017623	CCT	2	6	2599714	2599719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_017623	GAG	3	9	2599734	2599742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017623	TA	4	8	2599750	2599757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017623	AAATT	2	10	2599777	2599786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017623	CAA	2	6	2599813	2599818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_017623	TC	3	6	2599882	2599887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8008	NC_017623	TGT	2	6	2599904	2599909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017623	A	8	8	2599924	2599931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017623	CGC	2	6	2599943	2599948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_017623	TTTTTA	2	12	2599971	2599982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017623	TAA	2	6	2600008	2600013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017623	AAGA	2	8	2600036	2600043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017623	GTC	2	6	2601445	2601450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_017623	TTA	2	6	2601472	2601477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017623	A	6	6	2601503	2601508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017623	TGTC	2	8	2601531	2601538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_017623	CT	3	6	2601561	2601566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_017623	T	7	7	2601656	2601662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017623	T	6	6	2601669	2601674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017623	GAA	2	6	2601690	2601695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017623	GCC	2	6	2605777	2605782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_017623	ATT	2	6	2605797	2605802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017623	TGCGC	2	10	2605824	2605833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8025	NC_017623	CGGA	2	8	2605992	2605999	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_017623	T	6	6	2606184	2606189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017623	ATC	2	6	2606202	2606207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_017623	CCG	2	6	2606234	2606239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_017623	TG	3	6	2606252	2606257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017623	GAAA	2	8	2606559	2606566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017623	A	7	7	2606564	2606570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017623	A	6	6	2606594	2606599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017623	A	7	7	2606605	2606611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017623	CTT	2	6	2606634	2606639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_017623	ATC	2	6	2607875	2607880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_017623	TGA	2	6	2613256	2613261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017623	GGC	2	6	2613295	2613300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017623	ATT	2	6	2613419	2613424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017623	TCA	2	6	2613446	2613451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_017623	TGAA	2	8	2615024	2615031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017623	CCA	2	6	2615159	2615164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_017623	TTC	2	6	2615183	2615188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_017623	GAT	2	6	2616234	2616239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017623	ATT	2	6	2616257	2616262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017623	ATT	2	6	2616271	2616276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017623	TGCT	2	8	2616313	2616320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8047	NC_017623	GAAA	2	8	2616322	2616329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017623	CCA	2	6	2618047	2618052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_017623	TAA	2	6	2618432	2618437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017623	ATT	2	6	2618450	2618455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017623	CAGA	2	8	2618495	2618502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_017623	A	6	6	2618540	2618545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017623	ATTG	2	8	2618558	2618565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017623	CGCGA	2	10	2618597	2618606	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8055	NC_017623	ATT	2	6	2619219	2619224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017623	TCG	2	6	2619267	2619272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_017623	T	6	6	2620419	2620424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017623	ATA	2	6	2620430	2620435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017623	TTCTT	2	10	2620485	2620494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8060	NC_017623	GCG	2	6	2620547	2620552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_017623	CAT	2	6	2620571	2620576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_017623	ATC	2	6	2620578	2620583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_017623	CTT	2	6	2620661	2620666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_017623	TTC	2	6	2620667	2620672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_017623	TAA	2	6	2620707	2620712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017623	CTT	2	6	2620721	2620726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017623	ACC	2	6	2620765	2620770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_017623	A	6	6	2620834	2620839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017623	T	7	7	2620842	2620848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017623	ATT	2	6	2620869	2620874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017623	T	6	6	2620891	2620896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017623	A	7	7	2620918	2620924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017623	TAT	2	6	2620941	2620946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017623	CT	3	6	2621003	2621008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8075	NC_017623	TTC	2	6	2621034	2621039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_017623	TCT	2	6	2621093	2621098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_017623	CAC	2	6	2621121	2621126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_017623	AAATC	2	10	2621144	2621153	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8079	NC_017623	ATT	2	6	2621209	2621214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017623	TCA	2	6	2621321	2621326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_017623	ATT	2	6	2621365	2621370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017623	AT	3	6	2621386	2621391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017623	T	6	6	2621454	2621459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017623	ACC	2	6	2621525	2621530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_017623	GTG	2	6	2621641	2621646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017623	ATT	2	6	2621650	2621655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017623	AAAT	2	8	2621675	2621682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017623	A	8	8	2621713	2621720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017623	AAT	2	6	2621728	2621733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_017623	TA	3	6	2621825	2621830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017623	ATC	2	6	2621834	2621839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8094	NC_017623	TCC	2	6	2621873	2621878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8095	NC_017623	C	6	6	2621877	2621882	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8096	NC_017623	CA	3	6	2622049	2622054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8097	NC_017623	T	6	6	2622089	2622094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017623	ATT	2	6	2622098	2622103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017623	CG	3	6	2622152	2622157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_017623	GTG	2	6	2622229	2622234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017623	A	6	6	2622245	2622250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017623	CAA	2	6	2630610	2630615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_017623	CCG	2	6	2630693	2630698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_017623	GAC	2	6	2630703	2630708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_017623	AATT	2	8	2630806	2630813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017623	AT	3	6	2630826	2630831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017623	CTGC	2	8	2630889	2630896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_017623	A	6	6	2630922	2630927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017623	CTA	2	6	2630957	2630962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_017623	AGC	2	6	2631040	2631045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_017623	TACC	2	8	2631060	2631067	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_017623	CAA	2	6	2631070	2631075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_017623	TGTT	2	8	2632392	2632399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017623	TTGGCT	2	12	2632468	2632479	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8115	NC_017623	TGA	2	6	2632499	2632504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017623	GTTCT	2	10	2632523	2632532	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8117	NC_017623	GCT	2	6	2632569	2632574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8119	NC_017623	CAC	2	6	2634324	2634329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_017623	ATTT	2	8	2634622	2634629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017623	TTCT	2	8	2634642	2634649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_017623	A	8	8	2634726	2634733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017623	TAAA	2	8	2634766	2634773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017623	CAA	2	6	2635515	2635520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_017623	AT	3	6	2636178	2636183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017623	TGC	2	6	2637245	2637250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_017623	ATT	2	6	2637255	2637260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017623	TATT	2	8	2637265	2637272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017623	CAG	2	6	2637293	2637298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_017623	CG	3	6	2639056	2639061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8131	NC_017623	TGCC	2	8	2639095	2639102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8133	NC_017623	ATG	2	6	2641593	2641598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8256	NC_017623	A	6	6	2681746	2681751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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