MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 6122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017622	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017622	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017622	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017622	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017622	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017622	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017622	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017622	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017622	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017622	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017622	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017622	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017622	A	8	8	4390	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017622	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017622	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017622	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017622	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017622	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017622	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017622	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017622	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017622	T	6	6	15720	15725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017622	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017622	A	6	6	15868	15873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017622	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017622	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017622	A	6	6	16551	16556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017622	A	6	6	16585	16590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017622	A	6	6	16594	16599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017622	ATA	2	6	16623	16628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017622	AAAT	2	8	16629	16636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017622	A	6	6	16673	16678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017622	A	6	6	16707	16712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017622	TAA	2	6	16721	16726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017622	A	7	7	16762	16768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017622	A	6	6	16774	16779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017622	A	6	6	16797	16802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017622	A	8	8	16859	16866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017622	CAAAC	2	10	16867	16876	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017622	ACAAA	2	10	16913	16922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017622	GGC	2	6	17006	17011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017622	GCA	2	6	17325	17330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017622	CGC	2	6	17372	17377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017622	GTGA	2	8	17378	17385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017622	TGT	2	6	17411	17416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017622	AGA	2	6	17420	17425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017622	AGA	2	6	17432	17437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017622	CAG	2	6	17494	17499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017622	AGCG	2	8	17549	17556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017622	AT	3	6	17678	17683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017622	GGA	2	6	17684	17689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017622	CT	3	6	17709	17714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017622	GAA	2	6	17948	17953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017622	GGT	2	6	18022	18027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017622	GTC	2	6	18036	18041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017622	TCGTG	2	10	18045	18054	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017622	CAT	2	6	18104	18109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017622	TAA	2	6	18139	18144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017622	GGA	2	6	18148	18153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017622	ATC	2	6	18172	18177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017622	AC	3	6	18199	18204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017622	CGC	2	6	18338	18343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017622	AC	3	6	18368	18373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017622	CAC	2	6	18383	18388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017622	AGCC	2	8	18431	18438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017622	GAT	2	6	18454	18459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017622	CCT	2	6	18510	18515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017622	TCT	2	6	18545	18550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017622	AGG	2	6	18611	18616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017622	AAC	2	6	18646	18651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017622	GTT	2	6	18656	18661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017622	A	6	6	18791	18796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017622	ATC	2	6	18849	18854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017622	AGT	2	6	18857	18862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017622	GTTAA	2	10	18924	18933	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017622	ACG	2	6	18987	18992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017622	GTAA	2	8	19010	19017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017622	TCAC	2	8	19067	19074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017622	TAG	2	6	19158	19163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017622	GCGA	2	8	19166	19173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017622	AGG	2	6	19180	19185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017622	GAG	2	6	19193	19198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017622	CTC	2	6	19203	19208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017622	AGA	2	6	19245	19250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017622	AG	3	6	19273	19278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017622	T	6	6	19301	19306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017622	TCG	2	6	19348	19353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017622	GGA	2	6	19361	19366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017622	CT	3	6	19387	19392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017622	ACA	2	6	19479	19484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017622	ATG	2	6	19546	19551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017622	TAT	2	6	19611	19616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017622	GGA	2	6	19679	19684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017622	TC	3	6	19765	19770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017622	ACC	2	6	19945	19950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017622	AAT	2	6	19965	19970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017622	AGC	2	6	20025	20030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017622	ATTC	2	8	20032	20039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017622	TG	3	6	20156	20161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017622	AAG	2	6	20162	20167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017622	GAG	2	6	20177	20182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017622	GA	3	6	20307	20312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017622	ACA	2	6	20332	20337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017622	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017622	GA	3	6	20602	20607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017622	CT	3	6	20718	20723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017622	GAT	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017622	AGG	2	6	20781	20786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017622	CGG	2	6	20827	20832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017622	GA	3	6	20925	20930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017622	TAGG	2	8	21043	21050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017622	TAC	2	6	21097	21102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017622	CCT	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017622	GGT	2	6	21321	21326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017622	TCG	2	6	21436	21441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017622	CGT	2	6	21516	21521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017622	GA	3	6	21740	21745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017622	TGGAAG	2	12	21763	21774	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017622	CAG	2	6	21958	21963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017622	AGT	2	6	21984	21989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017622	AATC	2	8	22189	22196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017622	ACC	2	6	22507	22512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017622	CGT	2	6	22544	22549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017622	ATTAT	2	10	22858	22867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017622	CGC	2	6	22937	22942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017622	TA	3	6	22943	22948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017622	AT	3	6	23034	23039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017622	GGA	2	6	23041	23046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017622	GCGT	2	8	23100	23107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017622	TCC	2	6	23124	23129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017622	TAT	2	6	23134	23139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017622	AGC	2	6	23150	23155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017622	TCG	2	6	23164	23169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017622	CGG	2	6	23276	23281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017622	TTAAT	2	10	23302	23311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017622	GA	3	6	23323	23328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017622	CGG	2	6	23347	23352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017622	TTCGGG	2	12	23369	23380	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017622	CT	4	8	23392	23399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017622	CTA	2	6	23447	23452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017622	AGC	2	6	23464	23469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017622	TCG	2	6	23478	23483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017622	CGG	2	6	23590	23595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017622	TAT	2	6	23638	23643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017622	GGT	2	6	23696	23701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017622	ATATT	2	10	23720	23729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017622	AT	3	6	23873	23878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017622	TAA	2	6	25227	25232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017622	T	7	7	25254	25260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017622	GA	3	6	25269	25274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017622	GAG	2	6	25288	25293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017622	ATTT	2	8	27668	27675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017622	TAT	2	6	27684	27689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017622	AATA	2	8	46526	46533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_017622	TA	3	6	100143	100148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017622	AGG	2	6	100155	100160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
438	NC_017622	GCTG	2	8	101246	101253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
439	NC_017622	ATT	2	6	101277	101282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017622	CAC	2	6	101319	101324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_017622	TTA	2	6	101340	101345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017622	TTTA	2	8	101464	101471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017622	T	6	6	101532	101537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017622	TACT	2	8	101575	101582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
445	NC_017622	T	7	7	101614	101620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017622	TTAA	2	8	101647	101654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017622	AAT	2	6	105149	105154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017622	ATT	2	6	105228	105233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_017622	A	6	6	107905	107910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017622	TCC	2	6	107912	107917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
455	NC_017622	TAT	2	6	107919	107924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017622	ATT	2	6	110439	110444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_017622	TCA	2	6	110612	110617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_017622	TA	3	6	110626	110631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_017622	CTT	2	6	110701	110706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_017622	TG	3	6	110841	110846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017622	CGT	2	6	110888	110893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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469	NC_017622	TTA	2	6	111020	111025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017622	ATGG	2	8	114619	114626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017622	CTG	2	6	114721	114726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_017622	ATT	2	6	114727	114732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017622	ATCC	2	8	114756	114763	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_017622	AAGAA	2	10	114770	114779	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017622	ATT	2	6	114784	114789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_017622	GAAA	2	8	118487	118494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
478	NC_017622	AT	4	8	118497	118504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_017622	TCC	2	6	119142	119147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
480	NC_017622	TCG	2	6	119247	119252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_017622	CCT	2	6	119260	119265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
482	NC_017622	AT	3	6	119277	119282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017622	GTCTG	2	10	119285	119294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
484	NC_017622	CAGT	2	8	119311	119318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_017622	CCA	2	6	119333	119338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
486	NC_017622	GGCCT	2	10	119353	119362	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
487	NC_017622	GGTA	2	8	119411	119418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
488	NC_017622	GTCAA	2	10	119450	119459	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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492	NC_017622	GCT	2	6	119726	119731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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494	NC_017622	AG	3	6	119803	119808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_017622	GGC	2	6	119839	119844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_017622	ACC	2	6	119860	119865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
497	NC_017622	AGA	2	6	119878	119883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_017622	T	6	6	119923	119928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017622	T	6	6	119946	119951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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