MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 6122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017622	A	7	7	1226257	1226263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017622	CAT	2	6	1227629	1227634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017622	CAA	2	6	1227765	1227770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017622	CGC	2	6	1227802	1227807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_017622	GAC	2	6	1227822	1227827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017622	AAATC	2	10	1227829	1227838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4007	NC_017622	TTG	2	6	1227843	1227848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017622	T	6	6	1229431	1229436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017622	CT	3	6	1229515	1229520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_017622	TAT	2	6	1229521	1229526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017622	GAA	2	6	1229557	1229562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017622	TAT	2	6	1229587	1229592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017622	TA	3	6	1229624	1229629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017622	AAAG	2	8	1229636	1229643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017622	A	6	6	1232786	1232791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017622	TC	3	6	1232798	1232803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_017622	A	6	6	1234188	1234193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017622	TAT	2	6	1234210	1234215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017622	TGAG	2	8	1234234	1234241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017622	TTC	2	6	1234276	1234281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017622	A	6	6	1234731	1234736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017622	ATA	2	6	1234759	1234764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017622	TCCT	2	8	1235819	1235826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_017622	CTATC	2	10	1235874	1235883	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4025	NC_017622	CTT	2	6	1238624	1238629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_017622	A	6	6	1238644	1238649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017622	T	6	6	1238652	1238657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017622	CCT	2	6	1238666	1238671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_017622	AGCT	2	8	1240144	1240151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_017622	TTC	2	6	1240403	1240408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017622	A	6	6	1240444	1240449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017622	CAC	2	6	1240547	1240552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_017622	TAA	2	6	1240569	1240574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017622	ATT	2	6	1240583	1240588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017622	TCT	2	6	1243527	1243532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017622	A	6	6	1243551	1243556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017622	ACA	2	6	1243605	1243610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017622	TA	3	6	1243641	1243646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017622	A	6	6	1243671	1243676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017622	AGG	2	6	1246023	1246028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017622	A	6	6	1246734	1246739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017622	CTT	2	6	1246754	1246759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017622	TCC	3	9	1249057	1249065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_017622	ACG	2	6	1249076	1249081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017622	CGT	2	6	1249096	1249101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017622	A	6	6	1249133	1249138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4048	NC_017622	AGT	2	6	1249202	1249207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017622	ATCCT	2	10	1249212	1249221	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4050	NC_017622	CACC	2	8	1249233	1249240	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4051	NC_017622	CT	3	6	1249246	1249251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_017622	TAT	2	6	1249287	1249292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017622	T	6	6	1252030	1252035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017622	T	6	6	1252039	1252044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017622	AT	3	6	1252114	1252119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017622	A	6	6	1252128	1252133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017622	T	6	6	1252175	1252180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017622	AGA	2	6	1252181	1252186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017622	A	6	6	1252312	1252317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017622	TATT	2	8	1254310	1254317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017622	T	6	6	1254316	1254321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017622	TATT	2	8	1254912	1254919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017622	T	6	6	1254918	1254923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017622	CTCG	2	8	1254999	1255006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4066	NC_017622	TAA	2	6	1255066	1255071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017622	T	7	7	1256209	1256215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017622	ATA	2	6	1256217	1256222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017622	T	7	7	1256230	1256236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017622	T	6	6	1256239	1256244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017622	TA	3	6	1256257	1256262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017622	T	7	7	1256280	1256286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017622	CCT	2	6	1257408	1257413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_017622	AGG	2	6	1257424	1257429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017622	TTTA	2	8	1258584	1258591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017622	CCAT	2	8	1258655	1258662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_017622	TCT	2	6	1258762	1258767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017622	ATAG	2	8	1258784	1258791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017622	CAA	2	6	1258800	1258805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017622	A	7	7	1258840	1258846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017622	AGG	2	6	1258887	1258892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017622	TA	3	6	1259771	1259776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017622	A	8	8	1259799	1259806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017622	TAA	2	6	1259812	1259817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017622	GAG	2	6	1259854	1259859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017622	TTC	2	6	1259901	1259906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017622	T	6	6	1259914	1259919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017622	GTA	2	6	1259929	1259934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017622	CTC	2	6	1259955	1259960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_017622	GCT	2	6	1259995	1260000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017622	A	6	6	1260010	1260015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017622	CCT	2	6	1260482	1260487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_017622	TAT	2	6	1264007	1264012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017622	ATGG	2	8	1264016	1264023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017622	AG	3	6	1264042	1264047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017622	CAGT	2	8	1264067	1264074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_017622	GAT	2	6	1265387	1265392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017622	T	7	7	1265445	1265451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017622	CTT	2	6	1269644	1269649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017622	TAC	2	6	1269672	1269677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017622	TTA	2	6	1269678	1269683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017622	CCT	2	6	1270064	1270069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_017622	A	6	6	1270117	1270122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017622	AT	3	6	1270657	1270662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017622	AAAATC	2	12	1273251	1273262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4106	NC_017622	GTT	2	6	1273267	1273272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017622	TTGAT	2	10	1273276	1273285	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017622	TCTA	2	8	1273347	1273354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_017622	CAT	2	6	1273355	1273360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_017622	A	6	6	1273450	1273455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017622	GA	3	6	1273463	1273468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017622	A	7	7	1275503	1275509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017622	TC	3	6	1276376	1276381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_017622	ATA	2	6	1276483	1276488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017622	ATCA	2	8	1276495	1276502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_017622	TAA	2	6	1276517	1276522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017622	GT	3	6	1276529	1276534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017622	ATAA	2	8	1277587	1277594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017622	A	6	6	1277645	1277650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017622	TTA	2	6	1280579	1280584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017622	TCA	2	6	1280635	1280640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017622	CAA	2	6	1280756	1280761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017622	TTG	2	6	1280770	1280775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017622	GCAAA	2	10	1280795	1280804	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4125	NC_017622	A	7	7	1280905	1280911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017622	T	7	7	1281178	1281184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017622	TG	3	6	1284037	1284042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017622	CA	3	6	1284048	1284053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_017622	CTAT	2	8	1284061	1284068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_017622	CTTTC	2	10	1284226	1284235	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4131	NC_017622	CTG	2	6	1284397	1284402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017622	T	6	6	1284468	1284473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017622	CT	3	6	1284554	1284559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4134	NC_017622	T	6	6	1286448	1286453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017622	CAA	2	6	1287328	1287333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4261	NC_017622	A	7	7	1326062	1326068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_017622	T	6	6	1328022	1328027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4272	NC_017622	A	6	6	1330388	1330393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_017622	T	7	7	1330394	1330400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_017622	CT	3	6	1393651	1393656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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