MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 6122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017622	ATT	2	6	119952	119957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017622	A	6	6	119963	119968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017622	GAG	2	6	120006	120011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017622	AACT	2	8	125913	125920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_017622	AC	3	6	126183	126188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_017622	T	6	6	126199	126204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017622	T	6	6	126217	126222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017622	AG	3	6	126818	126823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017622	A	8	8	128087	128094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017622	CATGA	2	10	129206	129215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
511	NC_017622	TAC	2	6	129217	129222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017622	AG	3	6	129337	129342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017622	TTA	2	6	129393	129398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017622	AG	3	6	129516	129521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017622	TTA	2	6	129572	129577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017622	TTTG	2	8	129700	129707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017622	CAA	2	6	129718	129723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017622	TTG	2	6	129833	129838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017622	CAA	2	6	129940	129945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017622	TTG	2	6	129960	129965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017622	TCTA	2	8	130073	130080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_017622	GTG	2	6	130100	130105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017622	GAAAG	2	10	130814	130823	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017622	AGA	2	6	132430	132435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017622	AGG	2	6	133279	133284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017622	CTATA	2	10	133732	133741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
527	NC_017622	CGA	2	6	133780	133785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017622	AGG	2	6	134236	134241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017622	T	7	7	136197	136203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017622	TC	3	6	136282	136287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017622	AC	3	6	136327	136332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_017622	A	6	6	136370	136375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017622	TA	3	6	136376	136381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017622	TAAGAT	2	12	137410	137421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017622	GAAGC	2	10	137456	137465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
536	NC_017622	CAAT	2	8	137477	137484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017622	T	6	6	137607	137612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017622	TCTA	2	8	139937	139944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_017622	ACCT	2	8	139946	139953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_017622	T	7	7	139965	139971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017622	ACG	2	6	139975	139980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017622	CA	3	6	139988	139993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_017622	AGT	2	6	140115	140120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017622	CGA	2	6	140137	140142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017622	AAAC	2	8	140308	140315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_017622	TA	3	6	140329	140334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017622	A	6	6	140392	140397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017622	TGT	2	6	140474	140479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017622	ACT	2	6	140510	140515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017622	CAA	2	6	140562	140567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017622	TTG	2	6	140582	140587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017622	AAAT	2	8	140639	140646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017622	ATT	2	6	140654	140659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017622	TTTG	2	8	140669	140676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017622	A	6	6	140688	140693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017622	ATAG	2	8	140705	140712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017622	AGA	2	6	140718	140723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017622	AGT	2	6	140771	140776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017622	AGG	2	6	140797	140802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017622	TGA	2	6	140815	140820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017622	AAAG	2	8	140850	140857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017622	A	6	6	142913	142918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017622	A	6	6	142947	142952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017622	TTAAG	2	10	142976	142985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017622	ACC	2	6	143002	143007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017622	T	6	6	143042	143047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017622	T	6	6	143057	143062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017622	TA	3	6	143107	143112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017622	AGG	2	6	143211	143216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017622	T	6	6	144269	144274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017622	GTT	2	6	144331	144336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017622	A	7	7	144410	144416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017622	A	6	6	144431	144436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017622	GTAAA	2	10	144458	144467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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576	NC_017622	AGA	2	6	146141	146146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017622	A	7	7	146297	146303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017622	T	6	6	146311	146316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017622	TTTG	2	8	146327	146334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_017622	CTATT	2	10	146462	146471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
586	NC_017622	A	9	9	147046	147054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_017622	ATAAA	2	10	149015	149024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017622	GTA	2	6	150974	150979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017622	CTTT	2	8	150986	150993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_017622	A	6	6	151010	151015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017622	GTCT	2	8	151031	151038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_017622	GT	3	6	151218	151223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017622	ACTAAG	2	12	151231	151242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
596	NC_017622	CTA	2	6	151325	151330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017622	ATT	2	6	151354	151359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017622	AG	3	6	151388	151393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017622	TAA	2	6	151538	151543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017622	T	6	6	151709	151714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017622	GGCGGG	2	12	151799	151810	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
605	NC_017622	C	6	6	151813	151818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_017622	TGG	2	6	151853	151858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017622	TCC	2	6	151884	151889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_017622	TGG	2	6	151904	151909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017622	CCG	2	6	151926	151931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017622	CAG	2	6	152156	152161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017622	AGA	2	6	152208	152213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_017622	A	6	6	154660	154665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017622	GTTATA	2	12	154725	154736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017622	TCG	2	6	154753	154758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017622	AAAAG	2	10	154770	154779	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017622	TAT	2	6	154783	154788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017622	TTC	2	6	156087	156092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017622	CTT	2	6	156100	156105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017622	GAA	2	6	156114	156119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017622	GA	3	6	160306	160311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017622	TTC	2	6	160316	160321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017622	CAT	2	6	162418	162423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017622	AAC	2	6	162501	162506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017622	TA	3	6	162704	162709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017622	ATAA	2	8	162741	162748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017622	AGG	2	6	162783	162788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017622	ATG	2	6	162823	162828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017622	AGG	2	6	162848	162853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017622	GCT	2	6	165462	165467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017622	AGA	2	6	166598	166603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017622	TAG	2	6	166604	166609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017622	GGTA	2	8	166652	166659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017622	TTA	2	6	166664	166669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017622	T	7	7	166710	166716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017622	A	6	6	166740	166745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017622	A	6	6	169147	169152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017622	A	7	7	169154	169160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017622	TAG	2	6	169202	169207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_017622	TAGA	2	8	169305	169312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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