MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 6122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017622	TA	3	6	1978247	1978252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017622	AT	3	6	1978329	1978334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017622	A	7	7	1978337	1978343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017622	T	7	7	1978352	1978358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017622	A	7	7	1978365	1978371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017622	CA	3	6	1978464	1978469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_017622	GAA	2	6	1978490	1978495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017622	TTA	2	6	1979799	1979804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017622	TAA	2	6	1979905	1979910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017622	TA	3	6	1979955	1979960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017622	TCT	2	6	1982202	1982207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_017622	T	8	8	1986119	1986126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017622	A	7	7	1986135	1986141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017622	TAA	2	6	1986639	1986644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017622	TTC	2	6	1989379	1989384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_017622	ATTC	2	8	1989407	1989414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_017622	TCT	2	6	1990849	1990854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_017622	TTA	2	6	1990880	1990885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017622	TC	3	6	1991932	1991937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_017622	TATCA	2	10	1994403	1994412	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6021	NC_017622	TTC	2	6	1994437	1994442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017622	A	6	6	1994476	1994481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017622	CTT	2	6	1994518	1994523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_017622	AAAATC	2	12	1994534	1994545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6025	NC_017622	TAT	2	6	1994641	1994646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017622	TCA	2	6	1994688	1994693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6029	NC_017622	CTTTT	2	10	1998199	1998208	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6030	NC_017622	TTC	2	6	1998252	1998257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_017622	AAT	2	6	1998299	1998304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017622	ATC	2	6	2001816	2001821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_017622	AAG	2	6	2001844	2001849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017622	CTT	2	6	2001856	2001861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_017622	GTATTA	2	12	2003428	2003439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6039	NC_017622	TAAAA	2	10	2004679	2004688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017622	A	8	8	2004939	2004946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017622	TA	3	6	2004962	2004967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6044	NC_017622	CTGC	2	8	2009048	2009055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_017622	A	6	6	2009076	2009081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6049	NC_017622	A	6	6	2012461	2012466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017622	CAT	2	6	2012492	2012497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6052	NC_017622	CAA	2	6	2012921	2012926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_017622	ACT	2	6	2012954	2012959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017622	A	7	7	2012982	2012988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6059	NC_017622	TAT	2	6	2014653	2014658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017622	ATA	2	6	2014742	2014747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6062	NC_017622	TTA	2	6	2016386	2016391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017622	ACT	2	6	2016431	2016436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6072	NC_017622	CT	4	8	2021339	2021346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_017622	TCA	2	6	2021352	2021357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_017622	GAA	2	6	2025703	2025708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6083	NC_017622	A	7	7	2025784	2025790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017622	GAA	2	6	2025795	2025800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_017622	CGT	2	6	2027524	2027529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6093	NC_017622	ATA	2	6	2028627	2028632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6095	NC_017622	TTGT	2	8	2028790	2028797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_017622	ACCA	2	8	2028802	2028809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6100	NC_017622	GATT	2	8	2028846	2028853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017622	TAT	2	6	2028856	2028861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017622	A	6	6	2028868	2028873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017622	ATA	2	6	2028922	2028927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017622	TTCT	2	8	2029853	2029860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_017622	CT	3	6	2031551	2031556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_017622	T	6	6	2034419	2034424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017622	A	6	6	2034430	2034435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017622	A	6	6	2034437	2034442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017622	CAT	2	6	2034504	2034509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6114	NC_017622	T	6	6	2034702	2034707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017622	TAAAA	2	10	2034737	2034746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017622	CTG	2	6	2034816	2034821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6119	NC_017622	AAGA	2	8	2036150	2036157	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017622	T	8	8	2037419	2037426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017622	ATTT	2	8	2038219	2038226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017622	T	6	6	2038361	2038366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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