MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 6122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017622	AT	3	6	1407884	1407889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017622	T	7	7	1407904	1407910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017622	A	6	6	1407912	1407917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017622	T	6	6	1408229	1408234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017622	A	6	6	1408243	1408248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017622	AGG	2	6	1409818	1409823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017622	AGA	2	6	1409875	1409880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017622	TA	3	6	1409903	1409908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017622	T	6	6	1409911	1409916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017622	TC	3	6	1409976	1409981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_017622	ATA	2	6	1409982	1409987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017622	AAG	2	6	1409996	1410001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017622	T	7	7	1412096	1412102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017622	TAA	2	6	1412119	1412124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017622	A	6	6	1412169	1412174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017622	CAT	2	6	1412206	1412211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_017622	CTT	2	6	1412259	1412264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017622	TC	3	6	1412277	1412282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_017622	CTC	2	6	1412290	1412295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_017622	A	6	6	1412302	1412307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017622	TTCTA	2	10	1412969	1412978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4522	NC_017622	ATTT	2	8	1413001	1413008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017622	A	6	6	1414178	1414183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017622	TAG	2	6	1414839	1414844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017622	TA	3	6	1414868	1414873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017622	A	6	6	1414896	1414901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017622	AAACT	2	10	1414916	1414925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4528	NC_017622	CATT	2	8	1415706	1415713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_017622	ATAG	2	8	1415737	1415744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017622	TAA	2	6	1415745	1415750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017622	AAC	2	6	1415916	1415921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_017622	A	7	7	1415999	1416005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017622	CTGC	2	8	1416006	1416013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_017622	AG	3	6	1419515	1419520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017622	AACC	2	8	1419548	1419555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_017622	TCTT	2	8	1420829	1420836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_017622	CAA	2	6	1420881	1420886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_017622	A	6	6	1420885	1420890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017622	A	7	7	1420892	1420898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017622	TAAAA	2	10	1420902	1420911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017622	A	6	6	1420908	1420913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017622	ATAC	2	8	1420924	1420931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_017622	TCT	2	6	1421219	1421224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_017622	TAT	2	6	1421246	1421251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017622	TA	4	8	1421969	1421976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017622	A	6	6	1421998	1422003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017622	CAG	2	6	1422031	1422036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_017622	CT	3	6	1422692	1422697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_017622	T	6	6	1422697	1422702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017622	T	6	6	1422704	1422709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017622	A	7	7	1422720	1422726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017622	A	6	6	1422730	1422735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017622	TGAT	2	8	1424378	1424385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017622	TTA	2	6	1424401	1424406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017622	TA	3	6	1424437	1424442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017622	CTTTT	2	10	1425918	1425927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4557	NC_017622	T	6	6	1425924	1425929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017622	AGG	2	6	1427772	1427777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017622	TCT	2	6	1431249	1431254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_017622	TTTA	2	8	1431285	1431292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017622	AGG	2	6	1431331	1431336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017622	AATA	2	8	1434611	1434618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017622	ATTT	2	8	1434633	1434640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017622	ATA	2	6	1434644	1434649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017622	AAAG	2	8	1434650	1434657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017622	AG	3	6	1434656	1434661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017622	TTTC	2	8	1435643	1435650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_017622	TTCA	2	8	1435667	1435674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_017622	TC	3	6	1437688	1437693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_017622	TTA	2	6	1437706	1437711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017622	ATT	2	6	1437715	1437720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017622	AT	3	6	1437726	1437731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017622	TTTGA	2	10	1437741	1437750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017622	T	6	6	1437799	1437804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017622	T	6	6	1438243	1438248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017622	TCC	2	6	1438292	1438297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4578	NC_017622	TTGT	2	8	1439264	1439271	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017622	ATT	2	6	1439286	1439291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017622	A	8	8	1439307	1439314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017622	T	6	6	1440937	1440942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4583	NC_017622	AAT	2	6	1441042	1441047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017622	GAG	2	6	1441058	1441063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017622	CAT	2	6	1441066	1441071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4588	NC_017622	A	7	7	1441953	1441959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017622	T	6	6	1441988	1441993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017622	CTA	2	6	1442422	1442427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4592	NC_017622	ATTTT	2	10	1445093	1445102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017622	A	6	6	1445116	1445121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017622	TTCCA	2	10	1445152	1445161	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4598	NC_017622	TAATA	2	10	1445235	1445244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017622	A	7	7	1445296	1445302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4602	NC_017622	CAAA	2	8	1445382	1445389	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_017622	A	7	7	1446183	1446189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017622	AAT	2	6	1446231	1446236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017622	AAAT	2	8	1446239	1446246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017622	TGA	2	6	1446292	1446297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017622	ATG	2	6	1446302	1446307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017622	A	6	6	1446352	1446357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017622	AGAT	2	8	1446400	1446407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017622	TGA	2	6	1446420	1446425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017622	CTA	2	6	1446462	1446467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_017622	ACA	2	6	1446476	1446481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_017622	TCA	2	6	1446569	1446574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_017622	CCT	2	6	1446618	1446623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_017622	GTTT	2	8	1446624	1446631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017622	T	6	6	1446660	1446665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017622	CCT	2	6	1448081	1448086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_017622	ATT	2	6	1448089	1448094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017622	ATT	2	6	1448197	1448202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017622	CAA	2	6	1448218	1448223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_017622	TTG	2	6	1448254	1448259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017622	TCT	2	6	1448962	1448967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_017622	TC	3	6	1451242	1451247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_017622	TAT	2	6	1451265	1451270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_017622	TAAA	2	8	1451320	1451327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017622	A	6	6	1451325	1451330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017622	AAAC	2	8	1451375	1451382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_017622	ACT	2	6	1452122	1452127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_017622	ATT	2	6	1453100	1453105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_017622	TTAT	2	8	1453113	1453120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_017622	CCTA	2	8	1454471	1454478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4634	NC_017622	ATAAAA	2	12	1454501	1454512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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