MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 6693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4004	NC_017596	A	6	6	1112036	1112041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017596	CTT	2	6	1112060	1112065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4013	NC_017596	TCA	2	6	1116159	1116164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4023	NC_017596	T	6	6	1119819	1119824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4102	NC_017596	TTA	2	6	1131859	1131864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_017596	T	7	7	1149818	1149824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4132	NC_017596	TAC	2	6	1149931	1149936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4401	NC_017596	AGC	2	6	1231387	1231392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_017596	ATG	2	6	1231395	1231400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_017596	TTA	2	6	1231414	1231419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4404	NC_017596	AT	3	6	1231420	1231425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_017596	CTTA	2	8	1231436	1231443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4406	NC_017596	TAA	2	6	1232377	1232382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4407	NC_017596	T	6	6	1232397	1232402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_017596	TCA	2	6	1232425	1232430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4409	NC_017596	TCT	2	6	1232449	1232454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4410	NC_017596	AGGTC	2	10	1232510	1232519	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4411	NC_017596	ATC	2	6	1232566	1232571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4412	NC_017596	GAA	2	6	1232572	1232577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4413	NC_017596	TG	3	6	1232689	1232694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4414	NC_017596	T	6	6	1232757	1232762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_017596	ATTG	2	8	1232855	1232862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4416	NC_017596	T	6	6	1232944	1232949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4417	NC_017596	AAG	2	6	1232993	1232998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4419	NC_017596	T	6	6	1233010	1233015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4420	NC_017596	TG	3	6	1233149	1233154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4421	NC_017596	TTG	2	6	1233181	1233186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4423	NC_017596	TAA	2	6	1233355	1233360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4424	NC_017596	CAA	2	6	1233433	1233438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4425	NC_017596	AGC	2	6	1233727	1233732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4426	NC_017596	GT	3	6	1233758	1233763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4427	NC_017596	CCTT	2	8	1233792	1233799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4428	NC_017596	GCA	2	6	1233851	1233856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4430	NC_017596	GGT	2	6	1233937	1233942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4431	NC_017596	ATA	2	6	1233973	1233978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4432	NC_017596	ACA	2	6	1234049	1234054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4433	NC_017596	AAT	2	6	1234092	1234097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4434	NC_017596	CAA	2	6	1234125	1234130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4435	NC_017596	T	7	7	1234231	1234237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4436	NC_017596	TAA	2	6	1234247	1234252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4437	NC_017596	CTG	2	6	1234256	1234261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4438	NC_017596	ACA	2	6	1234290	1234295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4439	NC_017596	CTC	2	6	1234309	1234314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4440	NC_017596	AAG	2	6	1234387	1234392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4441	NC_017596	CTT	2	6	1234434	1234439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4442	NC_017596	AGC	2	6	1234483	1234488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4443	NC_017596	TTGTC	2	10	1234504	1234513	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4444	NC_017596	TGAC	2	8	1234526	1234533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4445	NC_017596	CAGAC	2	10	1234602	1234611	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4446	NC_017596	ATACT	2	10	1234622	1234631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4447	NC_017596	CTT	2	6	1234761	1234766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4448	NC_017596	A	6	6	1234774	1234779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4449	NC_017596	ACT	2	6	1234813	1234818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4451	NC_017596	ATG	2	6	1234924	1234929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4452	NC_017596	CAAA	2	8	1234930	1234937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4453	NC_017596	CAAT	2	8	1235027	1235034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4454	NC_017596	GACCT	2	10	1235035	1235044	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4455	NC_017596	TTC	2	6	1235107	1235112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4462	NC_017596	ATC	2	6	1235740	1235745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4465	NC_017596	CAG	2	6	1239754	1239759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4468	NC_017596	TGA	2	6	1239930	1239935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4470	NC_017596	TCA	2	6	1239950	1239955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4471	NC_017596	GAA	2	6	1239956	1239961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4472	NC_017596	AATG	2	8	1240002	1240009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4473	NC_017596	CCT	2	6	1241466	1241471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4474	NC_017596	A	6	6	1241472	1241477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4479	NC_017596	TAA	2	6	1243601	1243606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4480	NC_017596	CT	3	6	1244617	1244622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4481	NC_017596	TGA	2	6	1244625	1244630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4482	NC_017596	CTCA	2	8	1244767	1244774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4483	NC_017596	AACA	2	8	1244804	1244811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4484	NC_017596	GAAA	2	8	1244855	1244862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4487	NC_017596	CAT	2	6	1245070	1245075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4489	NC_017596	AT	3	6	1249470	1249475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_017596	GGA	2	6	1249482	1249487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4500	NC_017596	A	6	6	1255376	1255381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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