MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 6693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017596	TTG	2	6	3	8	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017596	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017596	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017596	A	6	6	42	47	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017596	ATTT	2	8	123	130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017596	ACTA	2	8	149	156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017596	AAG	2	6	219	224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017596	AAC	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017596	TC	3	6	1658	1663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017596	TTTA	2	8	1665	1672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017596	TA	3	6	1684	1689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017596	CTA	4	12	1698	1709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017596	TTA	3	9	1711	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017596	TTA	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017596	T	7	7	2906	2912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017596	TTA	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017596	ATA	2	6	2932	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017596	TAAA	2	8	3162	3169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017596	A	6	6	3204	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017596	AGA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017596	AAT	2	6	3333	3338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017596	TCT	2	6	3405	3410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017596	TCT	2	6	3427	3432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017596	T	6	6	3434	3439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017596	TAA	2	6	3444	3449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017596	TTGA	2	8	3452	3459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017596	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017596	ATT	2	6	5253	5258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017596	ACC	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017596	AAC	2	6	8751	8756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017596	GAAC	2	8	8786	8793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017596	TGC	2	6	8830	8835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017596	A	6	6	8861	8866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017596	A	6	6	14790	14795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017596	T	6	6	14821	14826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017596	T	7	7	14901	14907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017596	TTA	2	6	14910	14915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017596	A	6	6	14971	14976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017596	AAT	2	6	14996	15001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017596	AGA	2	6	15002	15007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017596	AGA	2	6	15010	15015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017596	ACTA	2	8	15061	15068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017596	TAG	2	6	15078	15083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017596	ATA	2	6	16511	16516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017596	ACATT	2	10	16524	16533	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017596	TACT	2	8	16579	16586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017596	AT	3	6	16692	16697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017596	A	6	6	16711	16716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017596	A	6	6	16794	16799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017596	TAA	2	6	16832	16837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017596	AG	3	6	16845	16850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017596	AC	3	6	16860	16865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017596	A	6	6	16872	16877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017596	AGT	2	6	16886	16891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017596	AAG	2	6	16921	16926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017596	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017596	AG	3	6	17072	17077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017596	GGC	2	6	17104	17109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017596	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017596	AG	3	6	17247	17252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017596	CGA	2	6	17349	17354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017596	GCA	2	6	17423	17428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017596	CGC	2	6	17470	17475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017596	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017596	TGT	2	6	17509	17514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017596	AGA	2	6	17518	17523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017596	ATG	2	6	17524	17529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017596	CCA	2	6	17545	17550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017596	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017596	CAG	2	6	17592	17597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017596	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017596	T	6	6	17662	17667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017596	AT	3	6	17776	17781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017596	GGA	2	6	17782	17787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017596	CT	3	6	17807	17812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017596	GAA	2	6	18046	18051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017596	GGT	2	6	18120	18125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017596	GTC	2	6	18134	18139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017596	TCGTG	2	10	18143	18152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017596	CAT	2	6	18202	18207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017596	TAA	2	6	18237	18242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017596	GGA	2	6	18246	18251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017596	ATC	2	6	18270	18275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017596	AC	3	6	18297	18302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017596	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017596	CGC	2	6	18436	18441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017596	AC	3	6	18466	18471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017596	CAC	2	6	18481	18486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017596	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017596	GAT	2	6	18552	18557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017596	CCT	2	6	18608	18613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017596	AGG	2	6	18707	18712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017596	CTA	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017596	TG	3	6	18821	18826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017596	CA	3	6	18832	18837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017596	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017596	TA	3	6	18896	18901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017596	ATT	2	6	18995	19000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017596	TAA	2	6	19001	19006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017596	A	7	7	19019	19025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017596	TAA	2	6	19032	19037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017596	GTTAA	2	10	19039	19048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017596	GAA	2	6	19085	19090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017596	ACG	2	6	19102	19107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017596	GTAA	2	8	19125	19132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017596	ACTA	2	8	19167	19174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017596	GAAG	2	8	19207	19214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017596	TAG	2	6	19273	19278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017596	GCGA	2	8	19281	19288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017596	AGG	2	6	19295	19300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017596	AGA	2	6	19361	19366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017596	AG	3	6	19389	19394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017596	GGA	2	6	19477	19482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017596	CT	3	6	19503	19508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017596	GGGAG	2	10	19558	19567	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017596	ACA	2	6	19595	19600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017596	ATG	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017596	TGT	2	6	19732	19737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017596	GGA	2	6	19795	19800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017596	TC	3	6	19881	19886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017596	ATC	2	6	20002	20007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017596	ACC	2	6	20060	20065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017596	AGC	2	6	20140	20145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017596	ATTC	2	8	20147	20154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017596	TG	3	6	20271	20276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017596	AAG	2	6	20277	20282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017596	GAG	2	6	20292	20297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017596	GA	3	6	20422	20427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017596	TA	3	6	20476	20481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017596	CTAA	2	8	20503	20510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017596	TAG	2	6	20605	20610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017596	GA	3	6	20718	20723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017596	CT	3	6	20833	20838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017596	GAT	2	6	20851	20856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017596	AGG	2	6	20896	20901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017596	CGG	2	6	20942	20947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017596	GA	3	6	21040	21045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017596	TAGG	2	8	21158	21165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017596	GTT	2	6	21202	21207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017596	TAC	2	6	21212	21217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017596	CCT	2	6	21300	21305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017596	TTGG	2	8	21341	21348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017596	AATC	2	8	21350	21357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017596	GGT	2	6	21436	21441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017596	TCG	2	6	21551	21556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017596	CGT	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017596	AGGGA	2	10	21769	21778	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017596	C	6	6	21807	21812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_017596	GA	3	6	21855	21860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017596	AGTGTA	2	12	21882	21893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017596	ACTAAT	2	12	21910	21921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_017596	CAG	2	6	22072	22077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017596	GCTTA	2	10	22135	22144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_017596	AC	3	6	22148	22153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_017596	T	6	6	22339	22344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017596	T	6	6	22777	22782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017596	TGT	2	6	23510	23515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017596	ATG	2	6	23525	23530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017596	CCA	2	6	23546	23551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_017596	AT	3	6	23777	23782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017596	GGA	2	6	23783	23788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_017596	AT	4	8	29595	29602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017596	TAAA	2	8	29749	29756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017596	T	9	9	29780	29788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_017596	AAT	2	6	30038	30043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017596	CTTTT	2	10	30075	30084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_017596	GTTA	2	8	30089	30096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017596	TAT	2	6	30126	30131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017596	TGA	2	6	30132	30137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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