MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae INV200

Total Repeats: 7963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017593	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017593	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017593	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017593	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017593	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017593	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017593	T	6	6	1566	1571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017593	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017593	T	6	6	1588	1593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017593	A	6	6	1603	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017593	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017593	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017593	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017593	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017593	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017593	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017593	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017593	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017593	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017593	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017593	TAA	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017593	GA	3	6	14322	14327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017593	CT	3	6	14337	14342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017593	T	6	6	14342	14347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017593	A	8	8	14929	14936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017593	A	7	7	14939	14945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017593	AGT	2	6	14954	14959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017593	AAC	2	6	15003	15008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017593	CGG	2	6	15049	15054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017593	TGA	2	6	15107	15112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017593	A	7	7	15112	15118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017593	A	7	7	15123	15129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017593	A	6	6	15143	15148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017593	GA	3	6	15197	15202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017593	ACA	2	6	15259	15264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017593	GTA	2	6	15271	15276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017593	A	7	7	15287	15293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017593	TGAG	2	8	15318	15325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017593	GGC	2	6	15373	15378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017593	AGG	2	6	15408	15413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017593	GCTT	2	8	15415	15422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017593	CCTG	2	8	15463	15470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017593	TGG	2	6	15592	15597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017593	CGA	2	6	15616	15621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017593	GCA	2	6	15690	15695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017593	CGC	2	6	15737	15742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017593	GTGA	2	8	15743	15750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017593	TGT	2	6	15776	15781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017593	AGA	2	6	15785	15790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017593	CAG	2	6	15859	15864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017593	AGCG	2	8	15914	15921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017593	TAG	2	6	15966	15971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017593	AT	3	6	16043	16048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017593	GGA	2	6	16049	16054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017593	CT	3	6	16074	16079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017593	GAA	2	6	16313	16318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017593	GGT	2	6	16387	16392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017593	GTC	2	6	16401	16406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017593	TCGTG	2	10	16410	16419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017593	CAT	2	6	16469	16474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017593	TAA	2	6	16504	16509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017593	GGA	2	6	16513	16518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017593	ATC	2	6	16537	16542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017593	AC	3	6	16564	16569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017593	CGC	2	6	16703	16708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017593	AC	3	6	16733	16738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017593	CAC	2	6	16748	16753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017593	AGCC	2	8	16795	16802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017593	GAT	2	6	16818	16823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017593	CCT	2	6	16874	16879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017593	TAAGGA	2	12	16883	16894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017593	AGG	2	6	16973	16978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017593	GA	3	6	17011	17016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017593	GTA	2	6	17088	17093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017593	TAA	2	6	17095	17100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017593	GTTAA	2	10	17131	17140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017593	CGA	2	6	17176	17181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017593	ACG	2	6	17194	17199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017593	GTAA	2	8	17217	17224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017593	GAT	2	6	17227	17232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017593	GTA	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017593	GAG	2	6	17297	17302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017593	TAG	2	6	17365	17370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017593	GCGA	2	8	17373	17380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017593	AGA	2	6	17452	17457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017593	AG	3	6	17480	17485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017593	CGG	2	6	17536	17541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017593	GGA	2	6	17568	17573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017593	GGGAG	2	10	17649	17658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017593	ACA	2	6	17686	17691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017593	ATG	2	6	17753	17758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017593	GGA	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017593	TC	3	6	17972	17977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017593	ACC	2	6	18152	18157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017593	AAT	2	6	18172	18177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017593	AGC	2	6	18232	18237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017593	ATTC	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017593	TG	3	6	18361	18366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017593	GAG	2	6	18382	18387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017593	GA	3	6	18512	18517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017593	ACA	2	6	18538	18543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017593	CTAA	2	8	18593	18600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017593	GTCT	2	8	18618	18625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017593	TAG	2	6	18695	18700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017593	GA	3	6	18808	18813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017593	CT	3	6	18924	18929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017593	GAT	2	6	18942	18947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017593	CGG	2	6	19033	19038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017593	GA	3	6	19131	19136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017593	TAGG	2	8	19249	19256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017593	TAC	2	6	19303	19308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017593	GGT	2	6	19527	19532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017593	TCG	2	6	19642	19647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017593	CGT	2	6	19722	19727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017593	AGGGA	2	10	19860	19869	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017593	TA	3	6	19926	19931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017593	GA	3	6	19946	19951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017593	GAAGTG	2	12	19971	19982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017593	ACTAAT	2	12	20001	20012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017593	AGT	2	6	20180	20185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017593	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017593	ATG	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017593	T	6	6	20329	20334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017593	TAA	3	9	20341	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017593	GAA	2	6	21308	21313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017593	CTTT	2	8	21344	21351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017593	T	6	6	21349	21354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017593	TGA	2	6	21402	21407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017593	ATT	2	6	21409	21414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017593	GTG	2	6	21530	21535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017593	TTA	2	6	21579	21584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017593	TTG	2	6	21644	21649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017593	GAT	2	6	21697	21702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017593	AGTTGA	2	12	21888	21899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017593	TGA	2	6	21910	21915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017593	TGAT	2	8	21964	21971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017593	TGA	2	6	21985	21990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017593	TTC	2	6	21991	21996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017593	AAG	2	6	22062	22067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017593	T	6	6	22082	22087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017593	ATA	2	6	22107	22112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017593	TA	3	6	22115	22120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017593	TTG	2	6	22243	22248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017593	T	6	6	22295	22300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017593	A	6	6	22317	22322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017593	ATA	2	6	22624	22629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017593	T	6	6	22658	22663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017593	TCT	2	6	22696	22701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017593	T	6	6	22716	22721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017593	TAA	2	6	22726	22731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017593	ATGT	2	8	22766	22773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017593	AAG	2	6	24146	24151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017593	CCT	2	6	24153	24158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_017593	TTG	2	6	24162	24167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017593	CTTTT	2	10	24184	24193	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_017593	ATA	2	6	24196	24201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017593	T	7	7	24233	24239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017593	ATA	3	9	24257	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017593	ATA	2	6	24793	24798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017593	GGA	2	6	24836	24841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017593	T	7	7	24877	24883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017593	AATA	2	8	24896	24903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017593	AAT	2	6	24910	24915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017593	ATA	2	6	24928	24933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017593	A	6	6	25931	25936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017593	TCT	2	6	26012	26017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_017593	GAA	2	6	27880	27885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017593	TATTT	2	10	27892	27901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017593	TTATT	2	10	27902	27911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017593	CTA	2	6	27942	27947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_017593	CT	3	6	28007	28012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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178	NC_017593	AAG	2	6	28072	28077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017593	GGGA	2	8	28098	28105	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017593	A	6	6	28186	28191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017593	ATT	2	6	29685	29690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017593	TTGTTT	2	12	29696	29707	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017593	GTA	2	6	29902	29907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017593	ATG	2	6	30149	30154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_017593	T	6	6	31282	31287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017593	AATA	2	8	31291	31298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017593	TAG	2	6	31301	31306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017593	ATA	2	6	31343	31348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017593	AGA	2	6	31354	31359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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