MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 4282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017583	ATGTG	2	10	8	17	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017583	GGT	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017583	TA	3	6	1437	1442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017583	A	7	7	1491	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017583	T	6	6	1504	1509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017583	CTA	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017583	ACT	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017583	TGGAG	2	10	4292	4301	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017583	AGG	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017583	CGA	2	6	10607	10612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017583	CCT	2	6	11820	11825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017583	AGG	2	6	11831	11836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017583	TTG	2	6	14052	14057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017583	GGA	2	6	15065	15070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017583	AAGGG	2	10	16343	16352	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017583	AGT	2	6	16400	16405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017583	GAGG	2	8	16411	16418	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017583	TAT	2	6	17502	17507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017583	TCC	2	6	21359	21364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017583	AT	3	6	23857	23862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017583	CT	3	6	25312	25317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017583	GTGCG	2	10	25339	25348	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017583	ATC	2	6	26148	26153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017583	TC	3	6	27556	27561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017583	GAA	2	6	27568	27573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017583	AAT	2	6	27579	27584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017583	GA	3	6	27599	27604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017583	T	8	8	27621	27628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017583	GGAT	2	8	27660	27667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017583	A	6	6	27709	27714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017583	TCC	2	6	30041	30046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017583	TCA	2	6	33118	33123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017583	T	6	6	33130	33135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017583	A	6	6	33143	33148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017583	T	6	6	33158	33163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017583	TCCTT	2	10	35545	35554	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017583	GGT	2	6	40115	40120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017583	G	6	6	42025	42030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017583	CT	3	6	44414	44419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017583	GATAG	2	10	44427	44436	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017583	GAG	2	6	44443	44448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017583	CATA	2	8	45226	45233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017583	TAT	2	6	45240	45245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017583	GGA	2	6	45837	45842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017583	GGA	2	6	49843	49848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017583	GGA	2	6	53314	53319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017583	GTA	2	6	58954	58959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017583	CAA	2	6	58970	58975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017583	A	6	6	58974	58979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017583	GTA	2	6	59068	59073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017583	TCT	2	6	59074	59079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017583	GATTT	2	10	60270	60279	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017583	TAC	2	6	60281	60286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017583	AGG	2	6	60291	60296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017583	GGGGA	2	10	61885	61894	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017583	ACG	2	6	64790	64795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017583	AGG	2	6	64796	64801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017583	CCT	2	6	67467	67472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017583	TAG	3	9	67491	67499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017583	GAA	2	6	67511	67516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017583	AAG	2	6	67517	67522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017583	CTCC	2	8	67533	67540	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017583	GTG	2	6	67575	67580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017583	CAAGG	2	10	70369	70378	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017583	ATG	2	6	71592	71597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017583	A	6	6	78706	78711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017583	AGG	2	6	78770	78775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017583	T	7	7	86899	86905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017583	AGC	2	6	86934	86939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017583	CATA	2	8	87955	87962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017583	GA	3	6	87966	87971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017583	GAG	2	6	89271	89276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017583	AGG	2	6	91105	91110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017583	AGG	2	6	91771	91776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017583	CTT	2	6	93608	93613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017583	GT	3	6	94701	94706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017583	CAT	2	6	94735	94740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017583	ACA	2	6	94765	94770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017583	AGA	2	6	94775	94780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017583	CCT	2	6	97189	97194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017583	TA	3	6	97205	97210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017583	TACTGG	2	12	97273	97284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017583	TAC	2	6	97291	97296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017583	CCG	2	6	97316	97321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017583	TCC	2	6	97339	97344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017583	GCC	2	6	104216	104221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017583	AGG	2	6	105320	105325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017583	TCC	2	6	105834	105839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017583	T	6	6	105857	105862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017583	A	6	6	105867	105872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017583	CGA	2	6	105878	105883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017583	GA	3	6	106729	106734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017583	GGTGA	2	10	106747	106756	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017583	AGG	2	6	111567	111572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017583	GCC	2	6	112264	112269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017583	CTA	2	6	113293	113298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017583	AGT	2	6	123912	123917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017583	TTC	2	6	123955	123960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017583	AGT	2	6	123961	123966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017583	TCC	2	6	125594	125599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017583	CCT	3	9	127209	127217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017583	ACC	2	6	127244	127249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017583	AGA	2	6	127287	127292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017583	TTTTC	2	10	127309	127318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017583	ACA	2	6	127333	127338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017583	GAG	2	6	128832	128837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017583	C	6	6	131179	131184	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_017583	GAGG	2	8	131203	131210	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017583	AGG	2	6	133834	133839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017583	AGGA	2	8	138369	138376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017583	GAA	3	9	140427	140435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017583	G	6	6	142861	142866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017583	GGGAA	2	10	142883	142892	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017583	GTC	3	9	142964	142972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017583	GT	4	8	144655	144662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017583	T	6	6	150829	150834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017583	GGA	2	6	152482	152487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017583	AAC	2	6	154321	154326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017583	GT	3	6	154354	154359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017583	CTA	2	6	158706	158711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017583	G	6	6	160981	160986	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017583	CCT	2	6	167571	167576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017583	GAAA	2	8	167601	167608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017583	A	6	6	167606	167611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017583	AGA	2	6	170894	170899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017583	AGC	2	6	170913	170918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017583	ATGTT	2	10	170932	170941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017583	GGA	2	6	171000	171005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017583	ATA	2	6	171008	171013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017583	GAA	2	6	171053	171058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017583	AG	3	6	171061	171066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017583	CTT	2	6	179675	179680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017583	GAA	2	6	179702	179707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017583	GTA	2	6	180774	180779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017583	CCT	2	6	185717	185722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017583	TGA	2	6	185822	185827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017583	TC	3	6	185833	185838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017583	GAG	2	6	185878	185883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017583	GAG	2	6	185900	185905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017583	GAGG	2	8	190969	190976	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017583	TCC	2	6	194592	194597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017583	GAT	2	6	194625	194630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017583	TC	3	6	196157	196162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017583	CTT	2	6	196181	196186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017583	AGG	2	6	199377	199382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017583	GC	3	6	201478	201483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017583	GGA	2	6	201490	201495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017583	CGG	2	6	201506	201511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017583	GTC	2	6	201536	201541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017583	GAC	2	6	201585	201590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017583	GAG	2	6	201630	201635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017583	CCCT	2	8	201890	201897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
153	NC_017583	GAC	2	6	201926	201931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017583	AGG	2	6	202041	202046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017583	TA	3	6	202088	202093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017583	TCC	3	9	207058	207066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_017583	GGT	2	6	207069	207074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017583	A	7	7	207085	207091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017583	TGG	2	6	208216	208221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017583	A	6	6	208248	208253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_017583	CTT	2	6	209750	209755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017583	CCA	2	6	209764	209769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_017583	TTC	2	6	209798	209803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_017583	GTA	2	6	209822	209827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017583	TA	3	6	216303	216308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017583	ACA	2	6	216332	216337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_017583	ATC	2	6	222165	222170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_017583	TAC	2	6	222229	222234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_017583	GGA	2	6	229844	229849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017583	AGG	2	6	230906	230911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017583	GTG	2	6	232572	232577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017583	AGGGG	2	10	233900	233909	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017583	TTCCCC	2	12	236559	236570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_017583	TCC	2	6	239747	239752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
194	NC_017583	TCC	2	6	242420	242425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_017583	G	6	6	266012	266017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017583	GGA	2	6	266021	266026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_017583	GTC	2	6	266137	266142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_017583	GGTG	2	8	269586	269593	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017583	CGAGG	2	10	269614	269623	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
273	NC_017583	CGGGGT	2	12	269634	269645	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
274	NC_017583	AG	3	6	269915	269920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017583	GGA	2	6	269968	269973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017583	GCG	2	6	270004	270009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_017583	GTG	2	6	270030	270035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017583	TGG	2	6	270075	270080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017583	AGGGG	2	10	270081	270090	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017583	TC	3	6	270187	270192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_017583	TA	3	6	270215	270220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_017583	AGG	2	6	270757	270762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017583	AG	3	6	272103	272108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017583	CGTC	2	8	274421	274428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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