MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 4282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017583	TCA	2	6	2376460	2376465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017583	AGA	2	6	2376568	2376573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017583	TGG	2	6	2376577	2376582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017583	AGG	2	6	2376604	2376609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017583	AC	3	6	2376615	2376620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_017583	GCT	2	6	2376623	2376628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017583	CGAG	2	8	2376657	2376664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_017583	GAG	2	6	2376705	2376710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017583	TGG	3	9	2376718	2376726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017583	GAA	2	6	2376857	2376862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017583	AGG	2	6	2376923	2376928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017583	AGG	3	9	2376931	2376939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017583	GAA	2	6	2376965	2376970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017583	GCC	2	6	2376999	2377004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_017583	GAA	3	9	2377058	2377066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017583	GAG	2	6	2377109	2377114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017583	GGT	2	6	2377163	2377168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017583	GTG	2	6	2377179	2377184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017583	GCTT	2	8	2377277	2377284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_017583	T	6	6	2377283	2377288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017583	TAT	3	9	2377296	2377304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017583	CATC	2	8	2377328	2377335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_017583	GCATA	2	10	2377341	2377350	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4024	NC_017583	GGC	2	6	2377355	2377360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017583	CCT	2	6	2378796	2378801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_017583	ATG	2	6	2380083	2380088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017583	CCT	3	9	2380115	2380123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_017583	TCC	2	6	2380132	2380137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_017583	GCG	2	6	2380217	2380222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017583	TCGG	2	8	2381930	2381937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_017583	GCA	2	6	2381943	2381948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017583	TC	4	8	2381961	2381968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_017583	CCG	2	6	2381998	2382003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_017583	CCT	2	6	2382803	2382808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_017583	CT	3	6	2382807	2382812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_017583	CCCT	2	8	2383401	2383408	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4037	NC_017583	TG	3	6	2383409	2383414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017583	TAA	2	6	2383425	2383430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017583	AGGA	2	8	2383438	2383445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017583	CCT	2	6	2385245	2385250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_017583	GAG	2	6	2385278	2385283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017583	AAG	2	6	2385298	2385303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017583	CCT	2	6	2387430	2387435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_017583	CAG	2	6	2387524	2387529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017583	ACGAC	2	10	2388055	2388064	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4046	NC_017583	AGG	2	6	2388065	2388070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017583	AGGG	2	8	2389044	2389051	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017583	CAC	2	6	2390873	2390878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_017583	ATCCC	2	10	2390898	2390907	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4050	NC_017583	GTA	2	6	2390992	2390997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017583	C	6	6	2392177	2392182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4052	NC_017583	TC	3	6	2392185	2392190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_017583	ATT	2	6	2392226	2392231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017583	CTAT	2	8	2395334	2395341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_017583	ACG	2	6	2397013	2397018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017583	TCCGC	2	10	2397019	2397028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4057	NC_017583	GA	3	6	2397962	2397967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017583	C	6	6	2401860	2401865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4059	NC_017583	A	6	6	2401873	2401878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017583	CGG	2	6	2401885	2401890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017583	CCG	2	6	2401893	2401898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_017583	TCC	2	6	2403664	2403669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_017583	AC	3	6	2403670	2403675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_017583	TCC	2	6	2403710	2403715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_017583	GTG	3	9	2403717	2403725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017583	TCGT	2	8	2404819	2404826	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_017583	TCA	2	6	2404898	2404903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017583	CCT	2	6	2409543	2409548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_017583	TCC	2	6	2410901	2410906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_017583	GAT	2	6	2410957	2410962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017583	AC	3	6	2413906	2413911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_017583	ACC	2	6	2415837	2415842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_017583	CCG	2	6	2415878	2415883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_017583	GAG	2	6	2416563	2416568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017583	CGG	2	6	2417959	2417964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017583	CTA	2	6	2417970	2417975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_017583	TTC	2	6	2421231	2421236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017583	GCC	2	6	2422782	2422787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_017583	CTG	2	6	2422788	2422793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017583	CCT	2	6	2423031	2423036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_017583	TC	3	6	2428237	2428242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_017583	GAA	2	6	2430967	2430972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017583	TCCC	2	8	2432628	2432635	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4084	NC_017583	TCG	2	6	2432645	2432650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017583	A	7	7	2432654	2432660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017583	TC	3	6	2432753	2432758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_017583	GCC	2	6	2432769	2432774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_017583	CCG	2	6	2432781	2432786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_017583	TC	3	6	2432791	2432796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_017583	GTG	2	6	2432801	2432806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017583	TCA	2	6	2432807	2432812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017583	CCCT	2	8	2432815	2432822	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4093	NC_017583	CTC	3	9	2432836	2432844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_017583	TCA	2	6	2432867	2432872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017583	AGGGA	2	10	2432873	2432882	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017583	TCC	2	6	2434351	2434356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_017583	CAG	2	6	2434372	2434377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017583	CTG	2	6	2434485	2434490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017583	CCG	2	6	2434520	2434525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_017583	CTC	2	6	2434536	2434541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_017583	CCTG	2	8	2434551	2434558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_017583	CCCGG	2	10	2437114	2437123	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4103	NC_017583	TCC	2	6	2440040	2440045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_017583	A	6	6	2440103	2440108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017583	CAC	2	6	2440125	2440130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_017583	T	6	6	2440139	2440144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017583	AGG	2	6	2440147	2440152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017583	GTAC	2	8	2441448	2441455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_017583	T	7	7	2441546	2441552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017583	GAT	2	6	2441569	2441574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017583	TCC	2	6	2443939	2443944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_017583	CA	3	6	2446583	2446588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_017583	GCG	2	6	2447617	2447622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017583	GTCT	2	8	2447645	2447652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_017583	CAC	2	6	2448410	2448415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_017583	GTACG	2	10	2448447	2448456	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4117	NC_017583	GAA	2	6	2448492	2448497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017583	GAA	2	6	2448514	2448519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017583	ACC	2	6	2450562	2450567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_017583	T	6	6	2450605	2450610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017583	GT	3	6	2450617	2450622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017583	GGA	3	9	2450633	2450641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017583	TCC	2	6	2452396	2452401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_017583	TCC	2	6	2454103	2454108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_017583	CCA	2	6	2454116	2454121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_017583	CCGC	2	8	2454161	2454168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4127	NC_017583	T	6	6	2454178	2454183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017583	CAA	2	6	2454215	2454220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017583	AAAG	2	8	2454454	2454461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017583	TTC	2	6	2457556	2457561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_017583	A	7	7	2458068	2458074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017583	TCC	2	6	2458097	2458102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4256	NC_017583	GA	3	6	2545377	2545382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_017583	CCT	2	6	2545838	2545843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4262	NC_017583	CTC	2	6	2545862	2545867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_017583	TA	3	6	2545875	2545880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_017583	ACA	2	6	2545929	2545934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_017583	CCT	2	6	2549594	2549599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4266	NC_017583	CCT	2	6	2552364	2552369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4267	NC_017583	CAGA	2	8	2552382	2552389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4268	NC_017583	AGAGAA	2	12	2554019	2554030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_017583	GTCC	2	8	2554061	2554068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4270	NC_017583	TA	3	6	2554085	2554090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_017583	GGA	2	6	2554105	2554110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_017583	ACG	2	6	2554112	2554117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4273	NC_017583	AGA	2	6	2554383	2554388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_017583	CGG	2	6	2555531	2555536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4275	NC_017583	CTC	2	6	2557974	2557979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4276	NC_017583	AAG	3	9	2559938	2559946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4277	NC_017583	CAATAA	2	12	2560011	2560022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4278	NC_017583	A	6	6	2560028	2560033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4279	NC_017583	A	7	7	2560039	2560045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4280	NC_017583	TTC	2	6	2560053	2560058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4281	NC_017583	TCGT	2	8	2560165	2560172	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4282	NC_017583	GTTT	2	8	2560213	2560220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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