MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 8248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017582	T	6	6	349700	349705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017582	GCT	2	6	350876	350881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017582	AGG	2	6	350889	350894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017582	AAT	2	6	351382	351387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017582	TAA	2	6	351456	351461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017582	AGAA	2	8	352047	352054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017582	CTT	2	6	352914	352919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_017582	GTA	2	6	352944	352949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017582	CTA	2	6	352957	352962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_017582	CATCT	2	10	352995	353004	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_017582	TAT	2	6	353048	353053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017582	TAT	2	6	353081	353086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017582	GACA	2	8	353100	353107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_017582	CAA	2	6	354664	354669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017582	GAT	2	6	354677	354682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017582	TGC	2	6	354742	354747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017582	ACA	2	6	354756	354761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017582	TCTG	2	8	354836	354843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_017582	CGG	2	6	354948	354953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017582	ATC	2	6	355009	355014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017582	GAA	2	6	355084	355089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017582	TTA	2	6	355114	355119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017582	ATG	2	6	355120	355125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017582	TCT	2	6	355145	355150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017582	TTTC	2	8	355173	355180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_017582	CGA	2	6	355278	355283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017582	AT	3	6	355313	355318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017582	AT	3	6	355326	355331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017582	AG	3	6	355340	355345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017582	CTA	2	6	355460	355465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017582	AGA	2	6	355521	355526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017582	TAG	2	6	355586	355591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017582	GTA	2	6	355599	355604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017582	TTG	2	6	355696	355701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017582	TGG	2	6	355753	355758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017582	TGTA	2	8	355805	355812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017582	TGG	2	6	355862	355867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017582	GGA	2	6	355928	355933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017582	AGA	3	9	355948	355956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017582	CTA	2	6	355958	355963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017582	T	6	6	358402	358407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017582	TC	3	6	358427	358432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_017582	T	6	6	358444	358449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017582	ATT	2	6	358451	358456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017582	AAACA	2	10	358459	358468	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_017582	A	6	6	358488	358493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017582	AAG	2	6	358515	358520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017582	TAG	2	6	358537	358542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017582	CAG	2	6	358567	358572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_017582	A	6	6	358633	358638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017582	TGA	2	6	360550	360555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017582	TTTTA	2	10	360628	360637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017582	CTA	2	6	360672	360677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017582	TGC	2	6	360810	360815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017582	CTA	2	6	363841	363846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017582	CAG	2	6	363899	363904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017582	TGG	2	6	363922	363927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017582	CCT	2	6	363947	363952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_017582	CAG	2	6	364036	364041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017582	T	6	6	364110	364115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017582	AAGAC	2	10	364135	364144	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1562	NC_017582	CAT	2	6	364146	364151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017582	A	6	6	365148	365153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017582	ATT	2	6	365162	365167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017582	ATT	2	6	365179	365184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017582	CAT	2	6	365190	365195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1568	NC_017582	CTTT	2	8	366160	366167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_017582	GAA	2	6	366196	366201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017582	A	6	6	366200	366205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017582	AGAAA	2	10	366271	366280	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017582	TTC	2	6	366390	366395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1574	NC_017582	TCGA	2	8	366469	366476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_017582	GAG	2	6	369048	369053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017582	A	6	6	370777	370782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017582	ATTTT	2	10	370789	370798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017582	AGAA	2	8	370832	370839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017582	ATT	2	6	370869	370874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017582	TCT	2	6	372272	372277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_017582	A	6	6	372313	372318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017582	T	7	7	372340	372346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017582	A	7	7	372362	372368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017582	ACA	2	6	372397	372402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1586	NC_017582	AAT	2	6	372427	372432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017582	AG	3	6	376228	376233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017582	TCA	2	6	376274	376279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017582	TG	3	6	377396	377401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017582	GA	3	6	377438	377443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017582	TTG	2	6	377445	377450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017582	TGT	2	6	377464	377469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017582	CT	3	6	377599	377604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1596	NC_017582	A	6	6	377829	377834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_017582	GCTG	2	8	377916	377923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_017582	GTG	2	6	377924	377929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017582	AGA	2	6	377976	377981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017582	CAG	3	9	377989	377997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017582	CAG	2	6	378109	378114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017582	ATC	2	6	378179	378184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017582	A	6	6	380033	380038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017582	GATA	2	8	380044	380051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017582	CGA	2	6	380061	380066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_017582	T	6	6	386282	386287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017582	AGCA	2	8	386345	386352	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_017582	T	6	6	386375	386380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017582	ATA	2	6	386489	386494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017582	AAAG	2	8	386500	386507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017582	AGT	2	6	388626	388631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_017582	TTTC	2	8	389610	389617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_017582	CTT	2	6	389632	389637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_017582	AGA	2	6	389671	389676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017582	GA	3	6	389675	389680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017582	TCACT	2	10	391167	391176	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1620	NC_017582	TAGAC	2	10	391202	391211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1621	NC_017582	CTAG	2	8	391238	391245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_017582	AGT	2	6	391267	391272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017582	AGC	2	6	391278	391283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_017582	GA	3	6	391350	391355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017582	TCC	2	6	391826	391831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_017582	TAT	2	6	391853	391858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017582	T	6	6	391862	391867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017582	GAG	2	6	391868	391873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017582	TGT	2	6	391905	391910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017582	TGAGG	2	10	391935	391944	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017582	AGCT	2	8	391960	391967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_017582	TTA	2	6	391977	391982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017582	GCT	3	9	391986	391994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_017582	GCTT	2	8	391997	392004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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