MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 8248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017582	A	7	7	2087640	2087646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017582	AGAA	2	8	2087731	2087738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017582	AT	3	6	2087777	2087782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017582	AACC	2	8	2087841	2087848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_017582	CAT	2	6	2087937	2087942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_017582	TTA	2	6	2088544	2088549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017582	TAT	2	6	2092427	2092432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017582	A	6	6	2092492	2092497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017582	AT	3	6	2095864	2095869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017582	TAA	2	6	2097839	2097844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017582	T	6	6	2097877	2097882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017582	T	6	6	2099418	2099423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017582	CTACA	2	10	2100433	2100442	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8014	NC_017582	TTA	2	6	2104177	2104182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017582	CCCA	2	8	2104204	2104211	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8016	NC_017582	T	6	6	2104302	2104307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017582	ATT	2	6	2105602	2105607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017582	TA	3	6	2105626	2105631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017582	ACC	2	6	2106509	2106514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_017582	T	6	6	2106532	2106537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017582	TAA	2	6	2106566	2106571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017582	ACTTT	2	10	2106587	2106596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8023	NC_017582	AGA	2	6	2106601	2106606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017582	TATGA	2	10	2106607	2106616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017582	GGA	2	6	2106747	2106752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017582	A	6	6	2107018	2107023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017582	A	6	6	2107055	2107060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017582	TGT	2	6	2107084	2107089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017582	T	6	6	2107150	2107155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017582	GTTTTG	2	12	2107156	2107167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017582	A	6	6	2108633	2108638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017582	CTA	2	6	2108677	2108682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_017582	CAA	2	6	2108745	2108750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_017582	TCA	2	6	2108820	2108825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_017582	ATCA	2	8	2108853	2108860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8036	NC_017582	CAT	2	6	2108861	2108866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_017582	ATT	2	6	2108885	2108890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017582	A	13	13	2108897	2108909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017582	T	6	6	2108970	2108975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017582	GGA	2	6	2108976	2108981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017582	CGA	2	6	2109002	2109007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_017582	AGG	2	6	2110979	2110984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017582	T	6	6	2110985	2110990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017582	ATT	2	6	2111080	2111085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017582	ATTT	2	8	2111091	2111098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017582	TAT	2	6	2111130	2111135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017582	A	6	6	2111140	2111145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017582	TAT	2	6	2111146	2111151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017582	A	6	6	2113558	2113563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017582	CAGA	2	8	2113566	2113573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8051	NC_017582	T	6	6	2113597	2113602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017582	GA	3	6	2113644	2113649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017582	CT	4	8	2118343	2118350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_017582	CAT	2	6	2118363	2118368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_017582	AGG	2	6	2118387	2118392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017582	AAC	2	6	2118401	2118406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_017582	TGCTAA	2	12	2118490	2118501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8058	NC_017582	AGC	2	6	2118540	2118545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_017582	ATT	2	6	2118558	2118563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017582	TTAA	2	8	2118653	2118660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017582	A	12	12	2118659	2118670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017582	GA	3	6	2118681	2118686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017582	TCT	2	6	2118731	2118736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_017582	A	6	6	2118754	2118759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017582	GA	3	6	2118780	2118785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017582	TA	3	6	2120885	2120890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017582	CAA	2	6	2120898	2120903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_017582	GTT	2	6	2120927	2120932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017582	AGG	2	6	2121013	2121018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017582	CAG	2	6	2121876	2121881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_017582	AGT	2	6	2121896	2121901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017582	GTA	2	6	2121904	2121909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017582	A	6	6	2121918	2121923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017582	CCA	2	6	2122426	2122431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8075	NC_017582	C	6	6	2122462	2122467	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8076	NC_017582	G	6	6	2122495	2122500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017582	GA	3	6	2123886	2123891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017582	CTC	2	6	2123971	2123976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_017582	AAT	2	6	2124004	2124009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017582	CT	3	6	2124104	2124109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_017582	AT	3	6	2124113	2124118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017582	TA	4	8	2124127	2124134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017582	AT	3	6	2124171	2124176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017582	TA	4	8	2124185	2124192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017582	AGGA	2	8	2124203	2124210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017582	AG	3	6	2124977	2124982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017582	A	7	7	2126057	2126063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017582	T	6	6	2126101	2126106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017582	TAT	2	6	2126145	2126150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017582	T	6	6	2128433	2128438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_017582	AT	3	6	2128475	2128480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017582	A	6	6	2128509	2128514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017582	T	6	6	2128519	2128524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017582	ATG	2	6	2129106	2129111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_017582	A	6	6	2129126	2129131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017582	A	6	6	2129257	2129262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017582	TGT	2	6	2129269	2129274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017582	TCC	2	6	2129922	2129927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8099	NC_017582	A	6	6	2129931	2129936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017582	AGG	2	6	2129978	2129983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017582	CTG	2	6	2130049	2130054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_017582	CA	3	6	2130061	2130066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_017582	T	7	7	2130104	2130110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017582	ATATC	2	10	2130120	2130129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8105	NC_017582	GAT	2	6	2130158	2130163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017582	CAAA	2	8	2130177	2130184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8107	NC_017582	ACA	2	6	2130192	2130197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_017582	TAT	2	6	2130317	2130322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017582	TTCA	2	8	2130333	2130340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_017582	AT	4	8	2130373	2130380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017582	CAA	2	6	2130395	2130400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_017582	T	6	6	2132106	2132111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017582	TAT	2	6	2134568	2134573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017582	TGA	2	6	2134627	2134632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017582	CAT	2	6	2137096	2137101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_017582	GTC	2	6	2137164	2137169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_017582	GAA	2	6	2138364	2138369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017582	T	7	7	2138428	2138434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017582	TAT	2	6	2138502	2138507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017582	CAA	2	6	2138529	2138534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_017582	T	6	6	2138539	2138544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017582	TAA	2	6	2138578	2138583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017582	GAG	2	6	2140189	2140194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017582	ATC	2	6	2140853	2140858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_017582	TG	3	6	2140860	2140865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017582	TAAA	2	8	2141508	2141515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017582	ATT	2	6	2141552	2141557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017582	AT	3	6	2141573	2141578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017582	T	6	6	2141632	2141637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017582	AAG	2	6	2141644	2141649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017582	GAT	2	6	2141691	2141696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_017582	TTA	3	9	2141707	2141715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_017582	GCT	2	6	2141748	2141753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8134	NC_017582	TAA	2	6	2145806	2145811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8232	NC_017582	T	7	7	2163889	2163895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8233	NC_017582	CTG	2	6	2163977	2163982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8247	NC_017582	T	6	6	2167168	2167173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8248	NC_017582	AAT	2	6	2167241	2167246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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