MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 8248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017582	ATG	2	6	1609203	1609208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017582	T	6	6	1609239	1609244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017582	CTTTT	2	10	1609301	1609310	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6004	NC_017582	AAG	2	6	1609329	1609334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017582	TGA	2	6	1609384	1609389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017582	ACC	2	6	1609402	1609407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_017582	CTC	2	6	1609416	1609421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_017582	CTT	2	6	1609452	1609457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_017582	AT	3	6	1609462	1609467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017582	ATC	2	6	1609496	1609501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_017582	A	6	6	1609506	1609511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017582	ATTA	2	8	1610153	1610160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017582	CGA	2	6	1610161	1610166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_017582	GT	3	6	1610187	1610192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017582	ATC	2	6	1610198	1610203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_017582	ATA	2	6	1610214	1610219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017582	TCT	2	6	1610326	1610331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_017582	TAGT	2	8	1610419	1610426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017582	ACC	2	6	1610437	1610442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_017582	TTC	2	6	1610540	1610545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_017582	CCT	2	6	1610560	1610565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_017582	ACC	2	6	1610576	1610581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_017582	TC	3	6	1610621	1610626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_017582	TCC	2	6	1611189	1611194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_017582	GTCA	2	8	1611254	1611261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_017582	TGG	2	6	1611272	1611277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017582	ATA	2	6	1611318	1611323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017582	A	6	6	1611323	1611328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017582	TA	3	6	1611366	1611371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017582	AAT	2	6	1611417	1611422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017582	CTG	2	6	1611460	1611465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_017582	CAAGG	2	10	1612411	1612420	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6033	NC_017582	AGC	2	6	1612425	1612430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_017582	TA	3	6	1613390	1613395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017582	CAT	2	6	1613396	1613401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017582	CAAA	2	8	1613431	1613438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_017582	CAT	2	6	1613485	1613490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_017582	TTTC	2	8	1613499	1613506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_017582	A	6	6	1613521	1613526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017582	AAG	2	6	1613559	1613564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017582	ATGAC	2	10	1613573	1613582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6042	NC_017582	GCT	2	6	1613599	1613604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017582	CTG	2	6	1613620	1613625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_017582	TAG	2	6	1613672	1613677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017582	A	6	6	1614387	1614392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017582	CTGT	2	8	1614415	1614422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_017582	TAT	2	6	1616179	1616184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017582	CTT	2	6	1616984	1616989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017582	A	6	6	1617020	1617025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017582	AGC	2	6	1617123	1617128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_017582	ACT	2	6	1617130	1617135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_017582	CA	3	6	1617149	1617154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_017582	CAA	2	6	1617167	1617172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017582	TGAT	2	8	1617176	1617183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017582	AGCT	2	8	1617229	1617236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_017582	TAG	2	6	1617258	1617263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017582	GA	3	6	1617291	1617296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017582	A	6	6	1618185	1618190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017582	AGC	2	6	1618206	1618211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017582	ATT	2	6	1618857	1618862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_017582	CAAAA	2	10	1619660	1619669	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6062	NC_017582	A	7	7	1619666	1619672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017582	AG	3	6	1619690	1619695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_017582	TGA	2	6	1619710	1619715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017582	AGC	2	6	1619738	1619743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6067	NC_017582	GTA	2	6	1619775	1619780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017582	AAT	2	6	1619785	1619790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017582	A	6	6	1619804	1619809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017582	ATTT	2	8	1619839	1619846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6073	NC_017582	CCT	2	6	1619951	1619956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6076	NC_017582	CAA	2	6	1620028	1620033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_017582	A	6	6	1620065	1620070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_017582	TGA	2	6	1620075	1620080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6082	NC_017582	A	7	7	1620239	1620245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017582	GA	3	6	1620296	1620301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017582	TC	3	6	1623491	1623496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_017582	TCAC	2	8	1623537	1623544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6086	NC_017582	CTC	2	6	1623551	1623556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_017582	AT	3	6	1625206	1625211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_017582	ATCT	2	8	1625214	1625221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_017582	TTAAT	2	10	1625258	1625267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017582	A	6	6	1625291	1625296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_017582	A	13	13	1625572	1625584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_017582	CGT	2	6	1625632	1625637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6094	NC_017582	GA	3	6	1625695	1625700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017582	T	6	6	1627659	1627664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_017582	GTA	2	6	1627677	1627682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_017582	AT	3	6	1627821	1627826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017582	A	6	6	1627846	1627851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_017582	A	7	7	1627874	1627880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017582	GACA	2	8	1627881	1627888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_017582	ATG	2	6	1627896	1627901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017582	TCT	2	6	1628643	1628648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_017582	GATTT	2	10	1628669	1628678	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017582	ATG	2	6	1628705	1628710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017582	TCC	2	6	1629178	1629183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_017582	TGT	2	6	1629184	1629189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017582	AAAT	2	8	1629266	1629273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017582	A	6	6	1629288	1629293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017582	AGC	2	6	1629329	1629334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017582	T	7	7	1629383	1629389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017582	CAA	2	6	1630229	1630234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_017582	TGC	2	6	1630238	1630243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_017582	TAGC	2	8	1630755	1630762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_017582	T	7	7	1630787	1630793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017582	AGCTT	2	10	1630865	1630874	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6117	NC_017582	GTTT	2	8	1630882	1630889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017582	ATG	2	6	1630891	1630896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017582	TTA	2	6	1633322	1633327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017582	T	6	6	1633333	1633338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017582	AATA	2	8	1633370	1633377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017582	GCT	2	6	1633384	1633389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_017582	ATAAA	2	10	1633664	1633673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017582	ACA	3	9	1634514	1634522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_017582	T	6	6	1634577	1634582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017582	TAAA	2	8	1634592	1634599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017582	ATCAT	2	10	1634615	1634624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6128	NC_017582	AGC	2	6	1634626	1634631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_017582	CAGC	2	8	1634642	1634649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_017582	ACAA	2	8	1636233	1636240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_017582	GCT	2	6	1636256	1636261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6133	NC_017582	TTAA	3	12	1637236	1637247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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