MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 8248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017582	AGG	2	6	1362117	1362122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017582	CAT	2	6	1363478	1363483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017582	T	6	6	1363486	1363491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017582	AG	3	6	1363632	1363637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017582	A	6	6	1365909	1365914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017582	GGGA	2	8	1365927	1365934	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017582	T	6	6	1365935	1365940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017582	GA	3	6	1366800	1366805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017582	AAT	2	6	1367655	1367660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017582	CT	3	6	1368985	1368990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_017582	TCC	2	6	1369009	1369014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_017582	CCT	2	6	1371190	1371195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_017582	TCA	2	6	1372929	1372934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017582	TTA	2	6	1372951	1372956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017582	ACAAG	2	10	1372971	1372980	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5016	NC_017582	ACT	3	9	1372987	1372995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_017582	TAT	3	9	1372999	1373007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017582	CTC	2	6	1373008	1373013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017582	CCT	2	6	1374354	1374359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_017582	TAAA	2	8	1374372	1374379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017582	TAA	2	6	1374393	1374398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017582	ATT	2	6	1374439	1374444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017582	AACTT	2	10	1374484	1374493	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5024	NC_017582	TAAGT	2	10	1374501	1374510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017582	TTA	2	6	1374511	1374516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017582	T	6	6	1374556	1374561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017582	A	6	6	1374593	1374598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017582	CAA	2	6	1374663	1374668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017582	A	7	7	1374667	1374673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017582	TCAA	2	8	1374706	1374713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_017582	CT	3	6	1374805	1374810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_017582	GCAA	2	8	1374823	1374830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_017582	TGA	2	6	1378607	1378612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017582	CTT	2	6	1380323	1380328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017582	AAT	2	6	1380339	1380344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017582	ATT	2	6	1380396	1380401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017582	ATTT	2	8	1380411	1380418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017582	ACT	2	6	1380438	1380443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017582	AATC	2	8	1380472	1380479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_017582	AGT	2	6	1380497	1380502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017582	TAG	2	6	1380510	1380515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017582	AGAC	2	8	1380581	1380588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_017582	GTT	2	6	1382733	1382738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017582	AGA	2	6	1382763	1382768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017582	A	7	7	1382786	1382792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017582	T	6	6	1382812	1382817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017582	TTA	2	6	1382822	1382827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017582	GCT	2	6	1383261	1383266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017582	CTT	2	6	1383272	1383277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017582	A	6	6	1383288	1383293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017582	T	6	6	1387447	1387452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017582	CAGC	2	8	1387473	1387480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_017582	TCC	2	6	1390598	1390603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_017582	CTTT	2	8	1390622	1390629	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_017582	CT	3	6	1390631	1390636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_017582	A	6	6	1390658	1390663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017582	CAT	2	6	1390669	1390674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017582	ACA	2	6	1393358	1393363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017582	CAG	2	6	1393378	1393383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_017582	GAA	2	6	1393511	1393516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017582	ATTG	2	8	1393521	1393528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017582	TTTCT	2	10	1393627	1393636	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5063	NC_017582	T	6	6	1393703	1393708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017582	A	6	6	1394787	1394792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017582	TCT	2	6	1396134	1396139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017582	A	7	7	1396158	1396164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017582	T	6	6	1396333	1396338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017582	GCA	3	9	1396396	1396404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017582	T	6	6	1396415	1396420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017582	TAA	2	6	1396434	1396439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017582	AGC	2	6	1396440	1396445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017582	AGA	2	6	1396458	1396463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017582	ACA	2	6	1396505	1396510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_017582	T	6	6	1397803	1397808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017582	CAG	2	6	1397819	1397824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017582	CTT	3	9	1398574	1398582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017582	TA	3	6	1398698	1398703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017582	TAA	2	6	1398707	1398712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017582	AGG	2	6	1398720	1398725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017582	CTA	2	6	1399154	1399159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017582	TTGTC	2	10	1400542	1400551	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5082	NC_017582	CAT	2	6	1400571	1400576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_017582	AGTT	2	8	1400610	1400617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017582	GCT	2	6	1400676	1400681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017582	AGA	3	9	1400683	1400691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017582	T	6	6	1402281	1402286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017582	TCA	2	6	1402714	1402719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017582	TTA	2	6	1402725	1402730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017582	AAAG	2	8	1402758	1402765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017582	ACGCAT	2	12	1402797	1402808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_017582	ATT	2	6	1403099	1403104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017582	TTA	2	6	1403147	1403152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017582	AAT	2	6	1403180	1403185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017582	ATAA	2	8	1403191	1403198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017582	A	7	7	1403231	1403237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017582	AAG	2	6	1403248	1403253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017582	CTG	2	6	1403328	1403333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_017582	CAGA	2	8	1403369	1403376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_017582	T	6	6	1403384	1403389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017582	GCT	2	6	1403465	1403470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017582	CA	3	6	1403478	1403483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_017582	TTAC	2	8	1404065	1404072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_017582	CTG	2	6	1404129	1404134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_017582	GAT	2	6	1404197	1404202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017582	TAA	2	6	1404233	1404238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017582	CCT	2	6	1404905	1404910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_017582	TTCTA	2	10	1404916	1404925	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5108	NC_017582	T	6	6	1404990	1404995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017582	TTCT	2	8	1405006	1405013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_017582	AAG	2	6	1405507	1405512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017582	CTT	2	6	1405553	1405558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017582	CTA	2	6	1405580	1405585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017582	C	6	6	1405598	1405603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5114	NC_017582	G	6	6	1405620	1405625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017582	TTA	2	6	1405634	1405639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017582	GCT	2	6	1405680	1405685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_017582	ACC	2	6	1405751	1405756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_017582	ACC	2	6	1405778	1405783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_017582	AGT	2	6	1406093	1406098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017582	CAT	2	6	1406112	1406117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_017582	CCT	2	6	1406130	1406135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_017582	TGT	2	6	1406178	1406183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017582	GTA	2	6	1406210	1406215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017582	GT	3	6	1406227	1406232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017582	CTT	2	6	1406290	1406295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017582	CAA	2	6	1406370	1406375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017582	T	6	6	1406441	1406446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017582	TGT	2	6	1406488	1406493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017582	TTG	2	6	1406636	1406641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017582	GTA	2	6	1406683	1406688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_017582	TCC	2	6	1406756	1406761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5259	NC_017582	AT	4	8	1432239	1432246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_017582	GCTA	2	8	1432409	1432416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5265	NC_017582	TAT	2	6	1432446	1432451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_017582	GCTA	2	8	1435644	1435651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5267	NC_017582	GA	3	6	1435712	1435717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_017582	GCT	2	6	1435718	1435723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5283	NC_017582	AAGT	2	8	1438916	1438923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5292	NC_017582	CT	4	8	1440700	1440707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5293	NC_017582	CTG	2	6	1440715	1440720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5344	NC_017582	TCAA	2	8	1444915	1444922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5390	NC_017582	AGTT	2	8	1450681	1450688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_017582	T	6	6	1450691	1450696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_017582	AGC	2	6	1450715	1450720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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