MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11702

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017580	A	6	6	23	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017580	ACA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017580	GTA	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017580	ATT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017580	AGC	2	6	4188	4193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017580	ATA	2	6	4212	4217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017580	T	7	7	4226	4232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017580	T	6	6	4251	4256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017580	AAG	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017580	T	6	6	4344	4349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017580	A	6	6	4350	4355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017580	TTA	2	6	4380	4385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017580	AAT	2	6	4424	4429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017580	AAT	2	6	4568	4573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017580	CATC	2	8	4602	4609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017580	A	7	7	4624	4630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017580	TGA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017580	CAT	3	9	5977	5985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017580	CA	3	6	6628	6633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017580	AAC	2	6	8520	8525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017580	TTTA	2	8	9166	9173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017580	TAT	2	6	9896	9901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017580	GGT	2	6	10389	10394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017580	T	6	6	10452	10457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017580	C	7	7	10459	10465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_017580	GAA	2	6	10503	10508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017580	TAA	2	6	10553	10558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017580	A	6	6	10572	10577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017580	TAT	2	6	10611	10616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017580	TAT	2	6	10661	10666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017580	CTT	2	6	10675	10680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017580	GAT	2	6	11732	11737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017580	TCG	2	6	12266	12271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017580	TAA	2	6	12291	12296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017580	TAA	2	6	12321	12326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017580	CA	3	6	12332	12337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017580	AATA	2	8	12404	12411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017580	AAT	2	6	12451	12456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017580	GCT	2	6	16152	16157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017580	AAC	2	6	16212	16217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017580	AT	3	6	17045	17050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017580	AT	3	6	17156	17161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017580	ATG	2	6	17173	17178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017580	ATTT	2	8	17203	17210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017580	TGT	2	6	18146	18151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017580	GCG	2	6	18161	18166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017580	GTT	2	6	18262	18267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017580	CAA	2	6	18443	18448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017580	GCG	2	6	18494	18499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017580	CGT	2	6	18622	18627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017580	GAA	2	6	18689	18694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017580	ACG	2	6	18736	18741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017580	AAC	2	6	18865	18870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017580	T	6	6	18884	18889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017580	CGG	2	6	18937	18942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017580	GCT	2	6	19034	19039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017580	ATT	2	6	19063	19068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017580	CAA	2	6	19165	19170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017580	TGA	2	6	19254	19259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017580	CGT	2	6	19260	19265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017580	TAT	2	6	19284	19289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017580	TCG	2	6	19430	19435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017580	A	6	6	19465	19470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017580	AAT	2	6	19531	19536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017580	TCA	2	6	19542	19547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017580	AATT	2	8	19548	19555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017580	TGA	2	6	19577	19582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017580	A	6	6	19582	19587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017580	G	7	7	19601	19607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017580	GAA	2	6	19656	19661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017580	CTA	2	6	19672	19677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017580	TGA	2	6	19683	19688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017580	GGTTA	2	10	19704	19713	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017580	GAA	2	6	19741	19746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017580	GAA	2	6	19810	19815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017580	T	6	6	19818	19823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017580	ACA	3	9	19857	19865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017580	CAA	2	6	19991	19996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017580	GCG	2	6	20042	20047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017580	CGT	2	6	20170	20175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017580	GAA	2	6	20237	20242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017580	ACG	2	6	20284	20289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017580	AAC	2	6	20413	20418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017580	T	6	6	20432	20437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017580	CGG	2	6	20485	20490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017580	GCT	2	6	20582	20587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017580	ATT	2	6	20611	20616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017580	CAA	2	6	20713	20718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017580	TGA	2	6	20802	20807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017580	CGT	2	6	20808	20813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017580	TAT	2	6	20832	20837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017580	TCG	2	6	20978	20983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017580	A	6	6	21013	21018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017580	AAT	2	6	21079	21084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017580	TCA	2	6	21090	21095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017580	AATT	2	8	21096	21103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017580	TGA	2	6	21125	21130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017580	A	6	6	21130	21135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017580	G	7	7	21149	21155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017580	GAA	2	6	21204	21209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017580	CTA	2	6	21220	21225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017580	TGA	2	6	21231	21236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017580	GGTTA	2	10	21252	21261	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017580	GAA	2	6	21289	21294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017580	GAA	2	6	21358	21363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017580	ACA	3	9	21404	21412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017580	TGAA	2	8	21448	21455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017580	TGAA	2	8	22299	22306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017580	CGATAA	2	12	23190	23201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017580	GT	3	6	23431	23436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017580	AT	3	6	23448	23453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017580	TAA	2	6	23463	23468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017580	TCT	2	6	24454	24459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017580	GC	3	6	24507	24512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017580	GAAT	2	8	24619	24626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017580	TTA	2	6	24627	24632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017580	ATT	2	6	24647	24652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017580	TAA	2	6	24848	24853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017580	TGT	2	6	24860	24865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017580	ATG	2	6	24874	24879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017580	TAA	3	9	24948	24956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017580	GGAA	2	8	25834	25841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017580	GCT	2	6	25850	25855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017580	AGC	2	6	25891	25896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017580	TTTTG	2	10	25901	25910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017580	TG	3	6	26412	26417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017580	T	6	6	26501	26506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017580	T	7	7	26536	26542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017580	T	6	6	30046	30051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017580	TG	3	6	30065	30070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017580	A	6	6	30072	30077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017580	TC	3	6	30107	30112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017580	GT	3	6	30262	30267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017580	TGT	2	6	30287	30292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017580	ATC	2	6	30312	30317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017580	T	6	6	30831	30836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017580	TTTGG	2	10	31255	31264	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017580	AAC	2	6	31617	31622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017580	T	7	7	31650	31656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017580	T	6	6	31661	31666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017580	ATT	2	6	32472	32477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017580	T	7	7	32532	32538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017580	ATT	2	6	33319	33324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017580	C	7	7	36442	36448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_017580	ATA	2	6	43521	43526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017580	TTG	2	6	46326	46331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017580	AAT	2	6	47029	47034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017580	AT	3	6	47041	47046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017580	T	6	6	48106	48111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017580	AAT	2	6	48150	48155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017580	ATTT	2	8	48189	48196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017580	T	7	7	48227	48233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017580	CAAC	2	8	50632	50639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_017580	GAA	2	6	52692	52697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017580	TAC	2	6	52918	52923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017580	AAT	2	6	52934	52939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017580	ATC	2	6	52962	52967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017580	TTAT	2	8	58094	58101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017580	GAA	2	6	59375	59380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017580	ATC	2	6	59382	59387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_017580	ACTG	2	8	59555	59562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
182	NC_017580	ACTG	2	8	59577	59584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_017580	ACTG	2	8	59599	59606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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260	NC_017580	T	6	6	91698	91703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.