MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 chromosome

Total Repeats: 16669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017579	A	6	6	201	206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017579	CAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017579	AGTA	2	8	251	258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017579	TAG	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017579	TAA	2	6	409	414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017579	TGA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017579	CA	3	6	479	484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017579	T	6	6	509	514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017579	T	6	6	556	561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017579	GAT	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017579	CGG	2	6	3154	3159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017579	GCA	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017579	TAGCCT	2	12	3208	3219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017579	GA	3	6	4383	4388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017579	T	6	6	6871	6876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017579	CTA	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017579	TTCG	2	8	7750	7757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017579	TCG	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017579	TGA	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017579	TGAA	2	8	10065	10072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017579	GAT	2	6	10119	10124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017579	CGT	2	6	11066	11071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017579	ATG	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017579	T	6	6	11172	11177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017579	GCA	2	6	11215	11220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017579	TGAAT	2	10	11246	11255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017579	AAGC	2	8	11267	11274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017579	TA	4	8	11298	11305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017579	ATG	2	6	11330	11335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017579	ATT	2	6	11362	11367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017579	A	6	6	12458	12463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017579	T	6	6	12480	12485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017579	T	6	6	15582	15587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017579	CTT	2	6	15590	15595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017579	TA	3	6	15613	15618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017579	A	6	6	16309	16314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017579	AAT	2	6	16370	16375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017579	TCAT	2	8	16473	16480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017579	TGT	2	6	16611	16616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017579	TGG	2	6	16645	16650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017579	GCC	2	6	16679	16684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017579	AT	3	6	16855	16860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017579	CGG	2	6	16861	16866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017579	ACAT	2	8	16869	16876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017579	CA	3	6	16896	16901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017579	AGT	2	6	16918	16923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017579	GCC	2	6	16937	16942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017579	AG	3	6	17028	17033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017579	TG	3	6	17045	17050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017579	CAT	2	6	17108	17113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017579	TGC	2	6	17142	17147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017579	GGTT	2	8	17163	17170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017579	T	6	6	17198	17203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017579	CAT	2	6	17227	17232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017579	TGT	2	6	17331	17336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017579	GTG	2	6	17385	17390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017579	TGT	2	6	17427	17432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017579	TCA	2	6	17442	17447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017579	TGCT	2	8	17450	17457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017579	GAT	2	6	17513	17518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017579	CGA	2	6	17638	17643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017579	TAA	2	6	17692	17697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017579	GTTG	2	8	17782	17789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017579	TTG	2	6	17850	17855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017579	TAC	2	6	17977	17982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017579	GAT	2	6	18021	18026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017579	GCT	2	6	18047	18052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017579	A	6	6	18059	18064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017579	TTTG	2	8	18124	18131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017579	TA	3	6	18148	18153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017579	GCT	2	6	18274	18279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017579	GTG	2	6	18338	18343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017579	TTC	2	6	18385	18390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017579	ATT	2	6	18397	18402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017579	GA	3	6	18492	18497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017579	AGA	2	6	18657	18662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017579	GTAG	2	8	18786	18793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017579	TGA	2	6	18796	18801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017579	ATC	2	6	18808	18813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017579	TA	3	6	18820	18825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017579	TCAA	2	8	18881	18888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017579	ATC	2	6	18982	18987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017579	AGTT	2	8	19063	19070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017579	CGC	2	6	19080	19085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017579	CAA	2	6	19152	19157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017579	AGC	2	6	19193	19198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017579	TGC	2	6	19230	19235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017579	TGT	2	6	19257	19262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017579	CGC	2	6	19263	19268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017579	CATTC	2	10	19509	19518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017579	CTG	2	6	19533	19538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017579	GAA	2	6	19704	19709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017579	TGA	2	6	19734	19739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017579	AG	3	6	19773	19778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017579	AATT	2	8	19836	19843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017579	AG	3	6	19845	19850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017579	ATG	2	6	20759	20764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017579	TTA	2	6	20795	20800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017579	GA	3	6	20814	20819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017579	TGC	2	6	20863	20868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017579	TGC	2	6	20882	20887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017579	CTT	2	6	20949	20954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017579	AAT	2	6	20977	20982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017579	T	6	6	21021	21026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017579	TGA	2	6	21039	21044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017579	TTC	2	6	21061	21066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017579	ATG	2	6	21083	21088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017579	CCA	2	6	21101	21106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017579	ATC	2	6	21217	21222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017579	GGC	2	6	21265	21270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017579	TTC	2	6	21346	21351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017579	CTG	2	6	21355	21360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017579	GT	4	8	21573	21580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017579	TAAA	2	8	21678	21685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017579	TCT	2	6	21697	21702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017579	CAG	2	6	21744	21749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017579	CGA	2	6	21791	21796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017579	ATG	2	6	21817	21822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017579	AGA	2	6	21866	21871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017579	AAC	2	6	21963	21968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017579	TGA	2	6	22005	22010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017579	TTGC	2	8	22011	22018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017579	TGT	2	6	22020	22025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017579	CAG	2	6	22088	22093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017579	AATATT	2	12	22105	22116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017579	A	6	6	22140	22145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017579	ATT	2	6	22171	22176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017579	CCA	2	6	25556	25561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017579	CT	3	6	25584	25589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017579	CAG	2	6	25596	25601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017579	CAT	2	6	25609	25614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017579	TG	3	6	25624	25629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017579	ACA	2	6	25657	25662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017579	ATG	2	6	25855	25860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017579	TGT	2	6	25935	25940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017579	AGATTA	2	12	25949	25960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017579	ATT	2	6	25981	25986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017579	TG	3	6	27362	27367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017579	GAA	2	6	27407	27412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017579	ATT	2	6	27519	27524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017579	TGA	2	6	27577	27582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017579	TGT	2	6	27658	27663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017579	TTA	2	6	27670	27675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017579	AGGC	2	8	27898	27905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017579	TG	3	6	27921	27926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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