MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 456

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	ATTA	2	8	42	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017577	CTTAT	2	10	87	96	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017577	AAC	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017577	AAT	2	6	1215	1220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017577	CAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017577	AAT	2	6	1293	1298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017577	AAAT	2	8	1377	1384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017577	AAC	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017577	TATC	2	8	1417	1424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017577	TAAA	2	8	1437	1444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017577	GA	3	6	1454	1459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017577	GT	3	6	1601	1606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017577	CAAT	2	8	1656	1663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017577	ATG	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017577	ATT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017577	TG	3	6	1767	1772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017577	T	6	6	1821	1826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017577	GATA	2	8	1840	1847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017577	CAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017577	A	6	6	3731	3736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017577	AT	3	6	3743	3748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017577	GAC	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017577	TCAA	2	8	3838	3845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017577	CT	3	6	11831	11836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017577	TG	3	6	11848	11853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017577	CAA	3	9	11858	11866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017577	ATGA	2	8	11918	11925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017577	AC	3	6	12020	12025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017577	A	6	6	12098	12103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017577	CA	3	6	16410	16415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017577	AT	3	6	16426	16431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017577	T	6	6	16469	16474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017577	A	8	8	16526	16533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017577	TCAT	2	8	16534	16541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017577	AAC	2	6	16555	16560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017577	CA	3	6	16604	16609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017577	AGT	2	6	16673	16678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017577	TGA	2	6	16703	16708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017577	CTTG	2	8	16709	16716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017577	TG	3	6	17413	17418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017577	A	7	7	17435	17441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017577	TA	3	6	17770	17775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017577	T	6	6	17817	17822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017577	CCA	2	6	18746	18751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017577	AAT	2	6	18752	18757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017577	TA	3	6	18759	18764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017577	TG	3	6	18782	18787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017577	TAA	2	6	18848	18853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017577	TA	3	6	19385	19390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017577	GTT	2	6	19443	19448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017577	AACC	2	8	24441	24448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017577	AT	3	6	24451	24456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017577	T	7	7	24509	24515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017577	TTGA	2	8	24539	24546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017577	ATG	2	6	24548	24553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017577	ACTC	2	8	24597	24604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017577	T	7	7	24627	24633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017577	ATAA	2	8	24697	24704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017577	A	7	7	24713	24719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017577	GTT	2	6	26040	26045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017577	CTA	2	6	26086	26091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017577	AC	3	6	26092	26097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017577	CTA	2	6	26124	26129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017577	CTA	2	6	26162	26167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017577	AC	3	6	26168	26173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017577	TTTAA	2	10	27195	27204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017577	AAT	2	6	27208	27213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017577	TAAC	2	8	27225	27232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017577	ACA	2	6	27278	27283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017577	TAT	2	6	27915	27920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017577	ACT	2	6	28476	28481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017577	CGC	2	6	28511	28516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017577	CGT	2	6	28536	28541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017577	ATT	2	6	28602	28607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017577	TTA	2	6	29449	29454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017577	AAG	2	6	29517	29522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017577	CAA	2	6	30245	30250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017577	CGC	2	6	30382	30387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017577	TA	3	6	30393	30398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017577	TGA	2	6	30434	30439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017577	TGCT	2	8	30470	30477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017577	GCAA	2	8	30500	30507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017577	CAT	2	6	30521	30526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017577	TAAA	2	8	30561	30568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017577	TA	3	6	30604	30609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017577	CAG	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017577	ATC	2	6	31058	31063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017577	ATAA	2	8	31079	31086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017577	TAAT	2	8	31102	31109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017577	ATTA	2	8	31618	31625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017577	A	6	6	32332	32337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017577	AGA	2	6	32341	32346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017577	AC	3	6	32353	32358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017577	CGT	2	6	32359	32364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017577	AC	3	6	32605	32610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017577	TAGA	2	8	32693	32700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017577	A	9	9	32722	32730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017577	CTT	2	6	32986	32991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017577	TG	3	6	35308	35313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017577	CAC	3	9	35323	35331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017577	A	6	6	35334	35339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017577	CTA	2	6	35373	35378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017577	TTG	2	6	35399	35404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017577	TAT	3	9	35503	35511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017577	ATC	2	6	35515	35520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017577	AATT	2	8	36581	36588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017577	ACTT	2	8	36632	36639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017577	TCTA	2	8	36645	36652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017577	ACT	2	6	36682	36687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017577	A	6	6	36742	36747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017577	GATT	2	8	36820	36827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017577	AGTT	2	8	36843	36850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017577	T	6	6	36860	36865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017577	AC	3	6	36925	36930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017577	A	6	6	37007	37012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017577	CAA	2	6	37017	37022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017577	A	6	6	37030	37035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017577	T	6	6	37071	37076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017577	T	6	6	37092	37097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017577	TTGA	2	8	37127	37134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017577	TTG	2	6	37175	37180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017577	ACC	2	6	37193	37198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017577	T	6	6	37199	37204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017577	AGT	2	6	37268	37273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017577	CTT	2	6	37313	37318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017577	T	6	6	37335	37340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017577	TA	4	8	37346	37353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017577	AGA	2	6	37393	37398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017577	ACC	2	6	37436	37441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017577	T	6	6	37442	37447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017577	ACA	2	6	37508	37513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017577	ATCCA	2	10	38868	38877	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017577	TTAA	2	8	38934	38941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017577	ACC	2	6	38950	38955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017577	GCT	2	6	38995	39000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017577	TAT	2	6	39058	39063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017577	TAAA	2	8	39065	39072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017577	TA	3	6	39108	39113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017577	T	6	6	39124	39129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017577	CTGAT	2	10	39144	39153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017577	AGT	2	6	39191	39196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017577	A	8	8	39204	39211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017577	TCA	2	6	39214	39219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017577	TA	3	6	39239	39244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017577	ATAA	2	8	39263	39270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017577	TG	3	6	39299	39304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017577	GT	3	6	39326	39331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017577	GGC	2	6	39351	39356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017577	T	7	7	39405	39411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017577	ATT	2	6	39989	39994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017577	GCG	2	6	40024	40029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_017577	A	7	7	119272	119278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017577	TTG	2	6	119297	119302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017577	CAA	2	6	119315	119320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_017577	AAT	2	6	119324	119329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017577	GCA	2	6	119337	119342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_017577	TCA	2	6	119366	119371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_017577	A	6	6	120113	120118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.