MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 14993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017571	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017571	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017571	GAT	2	6	54	59	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017571	CGG	2	6	2646	2651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017571	GCA	2	6	2667	2672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017571	TAGCCT	2	12	2700	2711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017571	GA	3	6	3875	3880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017571	T	6	6	6363	6368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017571	CTA	2	6	7091	7096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017571	TA	3	6	9544	9549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017571	GT	3	6	9550	9555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017571	GTT	2	6	10563	10568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017571	ATG	2	6	10650	10655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017571	T	6	6	10668	10673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017571	TGG	2	6	10718	10723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017571	AGA	2	6	10727	10732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017571	TGAAT	2	10	10742	10751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017571	CT	3	6	10778	10783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017571	ATG	2	6	10826	10831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017571	ATT	2	6	10858	10863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017571	A	6	6	11954	11959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017571	T	6	6	11976	11981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017571	T	6	6	15078	15083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017571	CTT	2	6	15086	15091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017571	TA	3	6	15109	15114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017571	TGATG	2	10	15733	15742	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017571	A	7	7	15809	15815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017571	AAT	2	6	15871	15876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017571	TATTAA	2	12	19150	19161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017571	AAG	2	6	19207	19212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017571	TGA	2	6	19236	19241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017571	CGAG	2	8	19243	19250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017571	GCA	2	6	19285	19290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017571	GAG	2	6	19324	19329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017571	ATG	2	6	20260	20265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017571	AAC	2	6	21465	21470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017571	TGA	2	6	21507	21512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017571	TTGC	2	8	21513	21520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017571	TGT	2	6	21522	21527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017571	CAG	2	6	21590	21595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017571	AATATT	2	12	21607	21618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017571	A	6	6	21642	21647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017571	ATT	2	6	21672	21677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017571	CCA	2	6	25057	25062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017571	CT	3	6	25085	25090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017571	CAG	2	6	25097	25102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017571	CAT	2	6	25110	25115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017571	TG	3	6	25125	25130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017571	ACA	2	6	25158	25163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017571	TGT	2	6	25436	25441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017571	ATT	2	6	25482	25487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017571	AGCT	2	8	29589	29596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017571	TCAC	2	8	29918	29925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017571	TTTA	2	8	30055	30062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017571	TAA	2	6	30679	30684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017571	A	6	6	30683	30688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017571	CTTA	2	8	32186	32193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017571	AGTT	2	8	36425	36432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017571	ACTG	2	8	36435	36442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017571	GTT	2	6	37672	37677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017571	CTGGG	2	10	37688	37697	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017571	CAA	2	6	37711	37716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017571	TTA	2	6	37717	37722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017571	GA	3	6	39243	39248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017571	AGG	2	6	39250	39255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017571	CCT	2	6	39262	39267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017571	T	6	6	39267	39272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017571	GGT	2	6	39327	39332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017571	ATA	2	6	39917	39922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017571	TTG	2	6	39924	39929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017571	ACCG	2	8	39958	39965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017571	GCG	2	6	39975	39980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017571	AAT	2	6	40605	40610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017571	AATA	2	8	43322	43329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017571	GGC	2	6	43336	43341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017571	GCC	2	6	43361	43366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017571	TA	3	6	43372	43377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017571	T	6	6	43977	43982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017571	GGTCA	2	10	44008	44017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017571	AAGC	2	8	44122	44129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017571	TTGAA	2	10	44142	44151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017571	AGC	2	6	44176	44181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017571	AAG	2	6	44182	44187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017571	TG	3	6	44328	44333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017571	GTTT	2	8	44435	44442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017571	A	7	7	44458	44464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017571	CAA	2	6	44503	44508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017571	GGC	2	6	44551	44556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017571	GCG	2	6	44617	44622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017571	AGG	2	6	44712	44717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017571	CGA	2	6	44792	44797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017571	GAT	2	6	44817	44822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017571	GCA	2	6	44866	44871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017571	GT	3	6	44919	44924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017571	GAA	2	6	44925	44930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017571	GGA	2	6	44961	44966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017571	AGC	2	6	44972	44977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017571	AGA	2	6	45008	45013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017571	CAG	2	6	45034	45039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017571	G	6	6	45181	45186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017571	GGA	2	6	45225	45230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017571	GGC	2	6	45245	45250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017571	GAA	2	6	45488	45493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017571	TGC	2	6	45564	45569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017571	GTC	2	6	45576	45581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017571	TGG	2	6	45654	45659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017571	GGA	2	6	45690	45695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017571	GAC	2	6	45703	45708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017571	TCA	2	6	45715	45720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017571	AC	3	6	45741	45746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017571	TCG	2	6	45808	45813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017571	AC	3	6	45910	45915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017571	AAG	2	6	45946	45951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017571	G	7	7	45969	45975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017571	CAC	2	6	45980	45985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017571	CCT	2	6	46051	46056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017571	TGTT	2	8	46077	46084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017571	CA	3	6	46092	46097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017571	TCT	2	6	46111	46116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017571	TGA	2	6	46199	46204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017571	TGTC	2	8	46205	46212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017571	TTAC	2	8	46219	46226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017571	CAT	2	6	46254	46259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017571	TTA	2	6	46275	46280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017571	ATT	2	6	46305	46310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017571	CTT	2	6	46345	46350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017571	GTGA	2	8	46400	46407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017571	GTA	2	6	46483	46488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017571	CAG	2	6	46555	46560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017571	GGA	2	6	46634	46639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017571	TAG	2	6	46663	46668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017571	GCGA	2	8	46671	46678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017571	TGA	2	6	46774	46779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017571	G	6	6	46820	46825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017571	TCC	2	6	46830	46835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017571	CTGA	2	8	46850	46857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017571	GGA	2	6	47140	47145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017571	TAC	2	6	47344	47349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017571	CGG	2	6	47362	47367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017571	CGTC	2	8	47375	47382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017571	AAC	2	6	47394	47399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017571	AGC	2	6	47484	47489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017571	CAT	2	6	47490	47495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017571	AAAG	2	8	47498	47505	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017571	AGTCG	2	10	47520	47529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017571	TGAAGG	2	12	47623	47634	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017571	GA	3	6	47835	47840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017571	AGGCT	2	10	47847	47856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017571	GCG	2	6	47860	47865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017571	GGT	2	6	47884	47889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017571	TGA	2	6	47946	47951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017571	AGT	2	6	47971	47976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017571	TCT	2	6	47999	48004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017571	GGT	2	6	48045	48050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017571	GA	3	6	48075	48080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017571	TGA	2	6	48144	48149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017571	CT	3	6	48156	48161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_017571	ATTG	2	8	48278	48285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017571	CGG	2	6	48326	48331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017571	ATG	2	6	48402	48407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017571	ATG	2	6	48575	48580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017571	GTC	2	6	48583	48588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017571	ACC	2	6	48597	48602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_017571	TGG	2	6	48657	48662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017571	TCC	2	6	48683	48688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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167	NC_017571	GGT	2	6	48820	48825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017571	CGG	2	6	48907	48912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017571	GCT	2	6	49069	49074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_017571	GT	3	6	49268	49273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017571	CAAA	2	8	49394	49401	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_017571	A	6	6	49399	49404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017571	ATT	3	9	49417	49425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017571	TCCGC	2	10	49683	49692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
182	NC_017571	CCGTC	2	10	49768	49777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
183	NC_017571	TCG	2	6	49815	49820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_017571	TCT	2	6	51459	51464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_017571	A	6	6	64262	64267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_017571	TAA	2	6	120375	120380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017571	TATCC	2	10	120383	120392	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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