MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 10270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017568	A	7	7	240371	240377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017568	T	6	6	240442	240447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017568	TGA	2	6	240484	240489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017568	AAT	2	6	240549	240554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017568	AGG	2	6	240626	240631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017568	TAA	2	6	242287	242292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017568	TCT	2	6	242316	242321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017568	GGT	2	6	242340	242345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017568	CAA	2	6	242366	242371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017568	CTT	2	6	242399	242404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017568	T	7	7	242426	242432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017568	T	6	6	242483	242488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017568	ATC	2	6	242501	242506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017568	TGTA	2	8	242517	242524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017568	AAT	2	6	242580	242585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017568	TAAAA	2	10	242671	242680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017568	TCA	2	6	242693	242698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017568	TCC	2	6	243671	243676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_017568	AAATG	2	10	243725	243734	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017568	A	6	6	243751	243756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017568	GAA	2	6	243818	243823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017568	A	6	6	243842	243847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017568	CAC	2	6	243854	243859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017568	TTG	2	6	243863	243868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017568	CAG	2	6	243883	243888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017568	CATTT	2	10	243918	243927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_017568	TGA	2	6	243952	243957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017568	TGG	2	6	243994	243999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017568	TCTT	2	8	244007	244014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017568	ATTT	2	8	244018	244025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017568	CCT	2	6	244764	244769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_017568	TCG	2	6	244852	244857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017568	AT	3	6	244875	244880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017568	TTGC	2	8	244885	244892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_017568	A	7	7	244920	244926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017568	A	7	7	244943	244949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017568	A	6	6	245017	245022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017568	TA	3	6	245023	245028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017568	TG	3	6	245041	245046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017568	AG	3	6	245130	245135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017568	A	6	6	245137	245142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017568	TAA	2	6	245143	245148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017568	A	7	7	245184	245190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017568	CCT	2	6	246192	246197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_017568	TA	3	6	246198	246203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017568	TAT	2	6	246281	246286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017568	TGA	2	6	246290	246295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017568	TCA	2	6	246406	246411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017568	T	7	7	247877	247883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017568	ACG	2	6	247952	247957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017568	TCA	2	6	247991	247996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017568	TGAA	2	8	247998	248005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017568	GTG	2	6	248006	248011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017568	GTATT	2	10	251298	251307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017568	ATTT	2	8	251320	251327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017568	A	7	7	251339	251345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017568	GAT	2	6	251374	251379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017568	TGG	2	6	251392	251397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017568	AAG	2	6	251495	251500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017568	TTA	2	6	251538	251543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017568	A	6	6	251543	251548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017568	TGA	2	6	251610	251615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017568	TAAA	2	8	251620	251627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017568	TAA	2	6	252537	252542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017568	ATT	2	6	252550	252555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017568	AAT	2	6	252589	252594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017568	ATG	2	6	252595	252600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017568	GAA	2	6	252695	252700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017568	AT	3	6	254099	254104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017568	TCC	2	6	255365	255370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_017568	TAT	2	6	255390	255395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017568	TA	3	6	255428	255433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017568	AATT	2	8	255441	255448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017568	ATA	2	6	255449	255454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017568	A	6	6	255477	255482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017568	TGTT	2	8	255499	255506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017568	TTA	2	6	255532	255537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017568	GTA	2	6	255561	255566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017568	A	6	6	255598	255603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017568	TGT	2	6	255671	255676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017568	GAT	2	6	255698	255703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017568	TAA	2	6	255756	255761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017568	A	7	7	255851	255857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017568	AAG	2	6	255861	255866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017568	GAG	2	6	257269	257274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017568	T	6	6	257279	257284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017568	CTCC	2	8	260311	260318	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1088	NC_017568	A	6	6	260332	260337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017568	GGAG	2	8	260348	260355	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017568	TTA	2	6	260381	260386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017568	GTC	2	6	261369	261374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017568	AAG	2	6	261452	261457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017568	A	6	6	261458	261463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017568	GAT	2	6	261464	261469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017568	ATG	2	6	261483	261488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017568	CCT	2	6	262388	262393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_017568	AATAAC	2	12	262420	262431	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1098	NC_017568	AT	3	6	262463	262468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017568	TGA	2	6	262469	262474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017568	TGAT	2	8	262478	262485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017568	AT	3	6	262489	262494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017568	AGG	2	6	262512	262517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017568	TCA	2	6	264051	264056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017568	TA	3	6	264343	264348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017568	AT	3	6	264355	264360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017568	TCAA	2	8	264413	264420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017568	GATAC	2	10	264456	264465	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_017568	TGT	2	6	264466	264471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017568	TGAC	2	8	264588	264595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_017568	ACAT	2	8	264634	264641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_017568	TTCG	2	8	264675	264682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_017568	ATT	2	6	264702	264707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017568	TAT	2	6	264730	264735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017568	GTT	2	6	264743	264748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017568	ATTTT	2	10	266571	266580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017568	GGTA	2	8	266590	266597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017568	TA	3	6	266612	266617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017568	A	6	6	266617	266622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017568	ATT	2	6	266627	266632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017568	TAT	2	6	266701	266706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017568	AAATAG	2	12	266711	266722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017568	A	7	7	267754	267760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017568	AGAC	2	8	267779	267786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_017568	CTC	2	6	269085	269090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_017568	TA	3	6	269121	269126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017568	ATG	2	6	269147	269152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017568	ACG	2	6	270446	270451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017568	GTT	2	6	270488	270493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017568	T	6	6	270510	270515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017568	CCT	2	6	271226	271231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_017568	AGT	2	6	271258	271263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017568	AAC	2	6	271276	271281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017568	A	6	6	271303	271308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017568	GCA	2	6	271398	271403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017568	A	7	7	271428	271434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017568	T	6	6	271468	271473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017568	ATG	2	6	271492	271497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017568	GTTT	2	8	271517	271524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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