MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 7695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017563	TCA	2	6	1202350	1202355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017563	TTAT	2	8	1202373	1202380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017563	TAAG	2	8	1202429	1202436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017563	GCTT	2	8	1202484	1202491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_017563	T	6	6	1202500	1202505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017563	ATT	2	6	1202508	1202513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017563	AAAT	2	8	1202553	1202560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017563	AGG	2	6	1202589	1202594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017563	ATG	2	6	1202627	1202632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017563	AATT	2	8	1204550	1204557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017563	ATA	2	6	1205973	1205978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017563	CCT	2	6	1205988	1205993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_017563	TGT	2	6	1206015	1206020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017563	GA	3	6	1207324	1207329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017563	A	7	7	1207329	1207335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017563	AAAAC	2	10	1208719	1208728	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5018	NC_017563	TAA	2	6	1208760	1208765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017563	A	6	6	1208871	1208876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017563	TCTCG	2	10	1208893	1208902	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5021	NC_017563	ACA	2	6	1209629	1209634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017563	TCA	2	6	1209647	1209652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017563	TTA	2	6	1209687	1209692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017563	TCA	2	6	1209736	1209741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017563	A	6	6	1209743	1209748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017563	A	6	6	1209959	1209964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5028	NC_017563	T	6	6	1209997	1210002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017563	T	7	7	1210004	1210010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017563	TTAC	2	8	1210022	1210029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_017563	GCTT	2	8	1210036	1210043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_017563	ATG	2	6	1210057	1210062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017563	ATTT	2	8	1210131	1210138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017563	TTTTA	2	10	1210185	1210194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017563	T	6	6	1210264	1210269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017563	TGA	2	6	1210277	1210282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017563	TGTT	2	8	1210307	1210314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017563	TACT	2	8	1210347	1210354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_017563	A	6	6	1210426	1210431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5055	NC_017563	TCAG	2	8	1212588	1212595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_017563	CTGA	2	8	1212615	1212622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_017563	TAA	2	6	1213298	1213303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5061	NC_017563	ATT	2	6	1214303	1214308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017563	A	6	6	1214322	1214327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017563	AAT	2	6	1214335	1214340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5067	NC_017563	AAAG	2	8	1217209	1217216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017563	A	7	7	1217288	1217294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017563	ATT	2	6	1217326	1217331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017563	TAC	2	6	1218045	1218050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5080	NC_017563	TAT	3	9	1220811	1220819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017563	TAAG	2	8	1220853	1220860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017563	A	6	6	1220873	1220878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017563	AGTT	2	8	1220890	1220897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_017563	ATAC	2	8	1223730	1223737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_017563	GGTT	2	8	1223784	1223791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017563	TC	3	6	1223812	1223817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_017563	T	7	7	1223838	1223844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_017563	ATT	2	6	1224199	1224204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017563	C	6	6	1224257	1224262	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5111	NC_017563	AT	3	6	1224335	1224340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017563	CAT	2	6	1224379	1224384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5119	NC_017563	CAT	2	6	1224507	1224512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_017563	TA	3	6	1228511	1228516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017563	T	6	6	1228536	1228541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5401	NC_017563	TAC	2	6	1280737	1280742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5402	NC_017563	T	6	6	1280764	1280769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5403	NC_017563	AAGG	2	8	1280804	1280811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5404	NC_017563	A	6	6	1280990	1280995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_017563	AAG	2	6	1281012	1281017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_017563	TAA	2	6	1281047	1281052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5407	NC_017563	CCTCT	2	10	1281089	1281098	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5409	NC_017563	AGC	2	6	1281142	1281147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5410	NC_017563	AG	3	6	1281180	1281185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_017563	CT	3	6	1281195	1281200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5412	NC_017563	TTTC	2	8	1283842	1283849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5415	NC_017563	CTC	2	6	1288548	1288553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5419	NC_017563	TCT	2	6	1289652	1289657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5420	NC_017563	TTA	2	6	1289680	1289685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5421	NC_017563	ATC	2	6	1289711	1289716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5422	NC_017563	GTT	2	6	1289728	1289733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5423	NC_017563	T	6	6	1289803	1289808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5424	NC_017563	ACTC	2	8	1289853	1289860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5425	NC_017563	ATT	2	6	1292979	1292984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5426	NC_017563	A	6	6	1293027	1293032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5427	NC_017563	T	7	7	1294974	1294980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5428	NC_017563	GATT	2	8	1301475	1301482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5429	NC_017563	T	8	8	1301481	1301488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5430	NC_017563	ATA	2	6	1301515	1301520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5431	NC_017563	A	9	9	1301542	1301550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_017563	ATC	2	6	1301553	1301558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5433	NC_017563	AAT	2	6	1301575	1301580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5434	NC_017563	TTG	2	6	1301609	1301614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5435	NC_017563	AAT	2	6	1301616	1301621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5436	NC_017563	A	6	6	1301647	1301652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5437	NC_017563	A	6	6	1301656	1301661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5438	NC_017563	ACT	2	6	1301721	1301726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5439	NC_017563	AACCA	2	10	1301789	1301798	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5440	NC_017563	GAA	2	6	1301806	1301811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5442	NC_017563	AAG	2	6	1302977	1302982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5443	NC_017563	TCA	2	6	1302990	1302995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5445	NC_017563	A	7	7	1303010	1303016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5446	NC_017563	CT	3	6	1303031	1303036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5447	NC_017563	A	7	7	1305065	1305071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5448	NC_017563	T	6	6	1305072	1305077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5449	NC_017563	TAT	2	6	1305085	1305090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5451	NC_017563	AAC	2	6	1305165	1305170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5452	NC_017563	ATTT	2	8	1305213	1305220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_017563	A	6	6	1305240	1305245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5454	NC_017563	TAA	2	6	1305312	1305317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5462	NC_017563	ATC	2	6	1307637	1307642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5463	NC_017563	A	6	6	1307643	1307648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5464	NC_017563	ATC	2	6	1307668	1307673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5467	NC_017563	TAC	2	6	1307732	1307737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5481	NC_017563	CTTT	2	8	1310493	1310500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5482	NC_017563	TAT	2	6	1310501	1310506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5485	NC_017563	ATAAA	2	10	1313921	1313930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_017563	TTATA	2	10	1313940	1313949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5489	NC_017563	T	6	6	1314682	1314687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5490	NC_017563	AT	3	6	1314688	1314693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_017563	TC	3	6	1314730	1314735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5492	NC_017563	TCA	2	6	1314790	1314795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5494	NC_017563	TAT	2	6	1314859	1314864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5496	NC_017563	AT	3	6	1317366	1317371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_017563	TTAT	2	8	1317395	1317402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_017563	CAT	2	6	1317407	1317412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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