MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 plasmid p11819-97

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017350	A	6	6	34	39	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017350	ATA	2	6	94	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017350	AAT	2	6	109	114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017350	ATA	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017350	TG	3	6	169	174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017350	TA	3	6	187	192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017350	ACA	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017350	AATT	2	8	243	250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017350	A	7	7	864	870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017350	TA	3	6	896	901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017350	A	6	6	910	915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017350	AAATG	2	10	956	965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017350	A	6	6	992	997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017350	ATT	2	6	1033	1038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017350	T	7	7	1112	1118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017350	TAAT	3	12	1139	1150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017350	TGA	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017350	TGTTA	2	10	1194	1203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017350	TTAT	2	8	1288	1295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017350	TAA	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017350	AAAT	2	8	1305	1312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017350	ATA	2	6	2014	2019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017350	A	7	7	2067	2073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017350	TGA	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017350	AAT	2	6	2128	2133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017350	T	7	7	2163	2169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017350	TAA	2	6	2197	2202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017350	TTG	2	6	2224	2229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017350	AT	3	6	2596	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017350	AGA	2	6	3294	3299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017350	ATTAT	2	10	3315	3324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017350	TATT	2	8	3349	3356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017350	TAA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017350	TAT	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017350	AAT	2	6	4300	4305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017350	AAG	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017350	ATA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017350	TTA	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017350	TAA	2	6	6517	6522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017350	TTA	2	6	6536	6541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017350	CT	3	6	6580	6585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017350	TA	5	10	6595	6604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017350	TA	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017350	AAGA	2	8	7307	7314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017350	AC	3	6	7329	7334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017350	GTT	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017350	GAT	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017350	AAT	2	6	8082	8087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017350	AG	3	6	8115	8120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017350	CT	4	8	8131	8138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017350	T	6	6	8138	8143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017350	CGTT	2	8	8165	8172	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017350	TACT	2	8	8196	8203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017350	TTCA	2	8	8213	8220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017350	ATG	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017350	AAAT	2	8	8265	8272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017350	TGAA	2	8	8276	8283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017350	GAT	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017350	A	8	8	8302	8309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017350	T	6	6	8323	8328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017350	GAA	2	6	8337	8342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017350	A	6	6	10870	10875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017350	AT	3	6	10891	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017350	AGA	2	6	11589	11594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017350	ATTAT	2	10	11610	11619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017350	T	7	7	11643	11649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017350	A	6	6	11720	11725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017350	TGA	2	6	11905	11910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017350	TCA	2	6	11917	11922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017350	T	7	7	11924	11930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017350	TAA	2	6	11945	11950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017350	TAA	2	6	11991	11996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017350	GCT	2	6	12013	12018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017350	TTG	2	6	12057	12062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017350	ATT	3	9	12069	12077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017350	ATT	2	6	12138	12143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017350	ATTA	2	8	12206	12213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017350	A	7	7	12216	12222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017350	AT	4	8	12236	12243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017350	ATTT	2	8	12259	12266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017350	ATT	2	6	12304	12309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017350	TTC	2	6	12318	12323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017350	TC	3	6	12351	12356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017350	T	6	6	12432	12437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017350	TAAA	2	8	13512	13519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017350	TTA	2	6	13520	13525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017350	GTATA	2	10	13526	13535	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017350	TA	4	8	13532	13539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017350	ATG	2	6	13570	13575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017350	TA	3	6	14401	14406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017350	A	6	6	14406	14411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017350	TATTT	2	10	14508	14517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017350	ACA	2	6	14586	14591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017350	ACT	2	6	14919	14924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017350	TCT	2	6	14941	14946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017350	AT	3	6	14954	14959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017350	TA	3	6	14975	14980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017350	AT	3	6	15027	15032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017350	AAT	2	6	15048	15053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017350	TAA	2	6	15081	15086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017350	TCA	2	6	15136	15141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017350	CATT	2	8	15189	15196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017350	ACC	2	6	16006	16011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017350	TCA	2	6	16026	16031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017350	TAC	2	6	16046	16051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017350	TAC	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017350	TA	3	6	16176	16181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017350	TAA	2	6	16256	16261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017350	GTTT	2	8	16276	16283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017350	AT	3	6	16284	16289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017350	T	6	6	16289	16294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017350	TAT	2	6	16303	16308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017350	ATCT	2	8	16309	16316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017350	ATC	2	6	16318	16323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017350	TTA	2	6	16365	16370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017350	GATT	2	8	17342	17349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017350	AG	3	6	17351	17356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017350	T	8	8	17378	17385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017350	GGT	2	6	17393	17398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017350	ACC	2	6	17409	17414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017350	GAG	2	6	17436	17441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017350	T	6	6	17663	17668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017350	TTA	2	6	17679	17684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017350	AAAAT	2	10	17723	17732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017350	GTT	2	6	17744	17749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017350	TCTT	2	8	17800	17807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017350	A	7	7	17825	17831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017350	ATTT	2	8	17842	17849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017350	GAAA	2	8	17862	17869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017350	CAT	2	6	17920	17925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017350	AAGT	2	8	17933	17940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017350	T	6	6	17984	17989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017350	T	7	7	18029	18035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017350	ATT	2	6	18043	18048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017350	AAAATA	2	12	18070	18081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017350	A	7	7	18105	18111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017350	TGTTT	2	10	18134	18143	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017350	ACC	2	6	18210	18215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017350	TGG	2	6	18218	18223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017350	TCA	2	6	18273	18278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017350	TA	3	6	18297	18302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017350	T	7	7	18412	18418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017350	T	7	7	18467	18473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017350	A	6	6	18530	18535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017350	T	6	6	18588	18593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017350	AAT	2	6	18609	18614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017350	ATT	2	6	18621	18626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017350	T	6	6	18629	18634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017350	A	7	7	18641	18647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017350	TTA	2	6	18690	18695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017350	TTA	2	6	18730	18735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017350	A	6	6	18747	18752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017350	TAA	2	6	18764	18769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017350	T	6	6	18797	18802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017350	ATT	2	6	18820	18825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017350	TTAA	2	8	18826	18833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017350	TAT	2	6	18861	18866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017350	AAATA	2	10	18887	18896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017350	AAAG	2	8	18928	18935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017350	TGAT	2	8	19036	19043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017350	GAA	3	9	19050	19058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017350	AAATAA	2	12	19059	19070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017350	ATT	2	6	19096	19101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017350	ATGA	2	8	19182	19189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017350	TA	3	6	19202	19207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017350	AT	3	6	19702	19707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017350	T	6	6	19748	19753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017350	TTAAAA	2	12	19821	19832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017350	TAA	2	6	19852	19857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017350	A	6	6	19868	19873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017350	AAGA	2	8	19948	19955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017350	GAA	2	6	20008	20013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017350	ATT	2	6	20722	20727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017350	A	7	7	20790	20796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017350	TAA	2	6	20859	20864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017350	TC	3	6	20877	20882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_017350	TCA	2	6	20952	20957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_017350	A	6	6	21040	21045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017350	AGT	2	6	21061	21066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.