MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus T0131 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017347	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017347	AC	4	8	148	155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017347	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017347	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017347	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017347	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017347	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017347	GTT	2	6	411	416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017347	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017347	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017347	GTT	2	6	466	471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017347	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017347	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017347	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017347	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017347	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017347	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017347	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017347	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017347	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017347	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017347	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017347	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017347	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017347	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017347	A	7	7	3537	3543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017347	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017347	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017347	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017347	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017347	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017347	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017347	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017347	A	7	7	9667	9673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017347	G	6	6	9693	9698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017347	CTATA	2	10	9725	9734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017347	AT	3	6	10619	10624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017347	TAT	2	6	10644	10649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017347	ATT	3	9	10664	10672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017347	ATT	2	6	10730	10735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017347	ACA	2	6	10746	10751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017347	ATA	2	6	10789	10794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017347	AAG	2	6	10849	10854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017347	TGAT	2	8	12412	12419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017347	TAA	2	6	12474	12479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017347	AT	3	6	12502	12507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017347	AG	3	6	12521	12526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017347	AT	4	8	12555	12562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017347	CTAC	2	8	12567	12574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017347	T	7	7	12705	12711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017347	A	6	6	12719	12724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017347	ATA	2	6	12744	12749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017347	ATT	2	6	12757	12762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017347	TA	3	6	14095	14100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017347	ATA	2	6	14137	14142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017347	GTG	2	6	14152	14157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017347	T	7	7	14174	14180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017347	AAC	2	6	14216	14221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017347	TGT	2	6	14235	14240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017347	CAA	2	6	14269	14274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017347	ATG	2	6	14287	14292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017347	TAT	2	6	14332	14337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017347	A	6	6	14353	14358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017347	GTA	2	6	14373	14378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017347	GTAGG	2	10	14396	14405	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017347	G	6	6	14404	14409	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017347	TCA	2	6	14450	14455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017347	A	6	6	14464	14469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017347	AAC	2	6	14490	14495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017347	GTA	2	6	14520	14525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017347	TAAA	2	8	14527	14534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017347	TAT	2	6	14660	14665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017347	T	6	6	14665	14670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017347	TA	3	6	14677	14682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017347	AGG	2	6	14698	14703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017347	ATC	2	6	15808	15813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017347	AAC	2	6	15872	15877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017347	TCA	2	6	15899	15904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017347	CTT	2	6	16043	16048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017347	T	6	6	16070	16075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017347	AGG	2	6	16081	16086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017347	TA	3	6	17069	17074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017347	TAAATC	2	12	17153	17164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017347	AAT	2	6	17192	17197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017347	CA	3	6	17215	17220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017347	TTA	2	6	17266	17271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017347	ATA	2	6	17335	17340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017347	AAT	2	6	22169	22174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017347	AT	3	6	22224	22229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017347	TGA	2	6	22251	22256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017347	TA	3	6	23719	23724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017347	AGG	2	6	23773	23778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017347	TCGAT	2	10	23802	23811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017347	A	6	6	23821	23826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017347	GGT	2	6	23839	23844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017347	AGA	2	6	23863	23868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017347	GAT	2	6	23872	23877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017347	ATT	2	6	24004	24009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017347	ATA	2	6	24010	24015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017347	TTC	2	6	24055	24060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017347	A	6	6	24061	24066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017347	A	6	6	24084	24089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017347	ATCT	2	8	24122	24129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017347	CGG	2	6	24180	24185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017347	T	6	6	24243	24248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017347	ATATT	2	10	24256	24265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017347	T	6	6	24387	24392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017347	TTA	2	6	24413	24418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017347	ATA	2	6	24467	24472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017347	TATT	2	8	24474	24481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017347	T	6	6	24513	24518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017347	TAA	2	6	24527	24532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017347	CCG	2	6	24587	24592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017347	TAA	2	6	24601	24606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017347	A	6	6	24605	24610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017347	AT	3	6	24616	24621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017347	TA	3	6	24667	24672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017347	T	6	6	24741	24746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017347	A	6	6	24771	24776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017347	ATA	2	6	24784	24789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017347	TAA	2	6	29486	29491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017347	TCA	2	6	29507	29512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017347	TAT	2	6	29551	29556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017347	AT	3	6	29594	29599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017347	TAA	2	6	29672	29677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017347	CATT	2	8	29684	29691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017347	AG	3	6	29836	29841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017347	CTG	2	6	30692	30697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017347	T	7	7	30718	30724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017347	TGT	2	6	30726	30731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017347	TGG	2	6	30732	30737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017347	TGT	2	6	30746	30751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017347	A	6	6	30778	30783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017347	AAT	2	6	30810	30815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017347	ATCA	2	8	30825	30832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017347	ATA	2	6	30852	30857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017347	AT	3	6	33211	33216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017347	TAC	2	6	33226	33231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017347	T	7	7	33262	33268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017347	A	7	7	33272	33278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017347	TAA	2	6	33322	33327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017347	T	6	6	34062	34067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017347	AAG	2	6	34139	34144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017347	TTTCA	2	10	34198	34207	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017347	ATA	2	6	34213	34218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017347	TTCT	2	8	34277	34284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017347	ATAA	2	8	34315	34322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017347	GAA	2	6	34332	34337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017347	ATA	2	6	34346	34351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017347	AGG	2	6	34363	34368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017347	TAAAA	2	10	35651	35660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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