MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	A	7	7	58	64	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017344	A	6	6	149	154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017344	CGT	2	6	157	162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017344	ACCT	2	8	212	219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017344	A	6	6	222	227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017344	ATTTTA	2	12	243	254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017344	T	6	6	255	260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017344	T	6	6	268	273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017344	A	6	6	374	379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017344	TTTG	2	8	404	411	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017344	AT	3	6	422	427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017344	T	6	6	569	574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017344	T	6	6	586	591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017344	TTTA	2	8	601	608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017344	ATT	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017344	T	7	7	630	636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017344	T	6	6	641	646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017344	T	6	6	704	709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017344	T	7	7	713	719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017344	A	7	7	743	749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017344	GAC	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017344	GAA	2	6	792	797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017344	TA	3	6	947	952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017344	CAT	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017344	GCTA	2	8	1014	1021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017344	TTAGA	2	10	1225	1234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017344	T	7	7	1257	1263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017344	ATTTT	2	10	1271	1280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017344	TA	3	6	1352	1357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017344	CAAGA	2	10	1362	1371	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017344	A	6	6	2381	2386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017344	TAT	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017344	AAT	2	6	2419	2424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017344	CTT	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017344	CGT	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017344	T	6	6	2955	2960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017344	A	6	6	2961	2966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017344	AT	3	6	3097	3102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017344	TAAA	2	8	3125	3132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017344	T	7	7	3144	3150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017344	T	6	6	3237	3242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017344	ATTTTT	2	12	3256	3267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017344	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017344	TACA	2	8	3417	3424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017344	T	6	6	3452	3457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017344	A	7	7	3460	3466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017344	A	7	7	3471	3477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017344	TCA	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017344	T	7	7	3898	3904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017344	CGT	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017344	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017344	TAA	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017344	AT	4	8	5017	5024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017344	A	6	6	5037	5042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017344	TA	3	6	5044	5049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017344	TTA	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017344	TA	3	6	5151	5156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017344	GTA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017344	A	6	6	5309	5314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017344	GGT	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017344	TAAT	2	8	6143	6150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017344	TA	3	6	6185	6190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017344	ATC	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017344	A	7	7	6720	6726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017344	TGA	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017344	T	6	6	6967	6972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017344	T	7	7	6978	6984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017344	A	6	6	6987	6992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017344	TGTA	2	8	7020	7027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017344	AT	3	6	7053	7058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017344	A	6	6	7227	7232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017344	TTTG	2	8	7346	7353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017344	AT	3	6	7364	7369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017344	TA	3	6	7401	7406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017344	A	6	6	7419	7424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017344	TAA	2	6	7492	7497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017344	T	6	6	7507	7512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017344	GA	3	6	7520	7525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017344	TAA	2	6	7591	7596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017344	TTC	2	6	7609	7614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017344	A	7	7	7616	7622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017344	ATT	2	6	7631	7636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017344	AGG	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017344	ATT	2	6	7656	7661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017344	T	6	6	8357	8362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017344	TCT	2	6	8382	8387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017344	TA	3	6	8399	8404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017344	TAT	2	6	8417	8422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017344	TAA	2	6	8497	8502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017344	TTA	2	6	8548	8553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017344	AT	3	6	8593	8598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017344	TCA	2	6	8608	8613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017344	GGTA	2	8	8614	8621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017344	CTT	2	6	8650	8655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017344	ATTTG	2	10	8704	8713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017344	T	6	6	8718	8723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017344	A	6	6	8737	8742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017344	TAT	2	6	8752	8757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017344	T	6	6	8874	8879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017344	GATT	2	8	8999	9006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017344	A	6	6	9136	9141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017344	ATT	2	6	9198	9203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017344	AAC	2	6	9213	9218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017344	A	6	6	9223	9228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017344	AATA	2	8	9283	9290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017344	AT	3	6	9297	9302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017344	TTGA	2	8	9326	9333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017344	ATAA	2	8	9338	9345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017344	ATTT	2	8	9370	9377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017344	AT	3	6	10291	10296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017344	ATG	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017344	AGT	2	6	10363	10368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017344	CAA	2	6	10388	10393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017344	TAA	2	6	10403	10408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017344	CTA	2	6	10420	10425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017344	TAG	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017344	TGG	2	6	10441	10446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017344	TTAA	2	8	10459	10466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017344	TTA	2	6	10483	10488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017344	ATTT	2	8	10520	10527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017344	T	6	6	10602	10607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017344	GA	3	6	10629	10634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017344	ATT	2	6	10678	10683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017344	ATA	2	6	10693	10698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017344	GTC	2	6	10704	10709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017344	AGG	2	6	10739	10744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017344	CAT	2	6	10748	10753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017344	TAT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017344	GTA	2	6	10791	10796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017344	ATT	2	6	10811	10816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017344	AAT	2	6	10830	10835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017344	CGA	2	6	10853	10858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017344	AGT	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017344	TTG	2	6	10940	10945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017344	TAGT	2	8	10961	10968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017344	A	6	6	10979	10984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017344	AAG	2	6	11006	11011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017344	ATG	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017344	ATT	2	6	12154	12159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017344	AAT	2	6	12166	12171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017344	TCA	2	6	12191	12196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017344	AT	3	6	12200	12205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017344	AGTA	2	8	12221	12228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017344	T	6	6	12322	12327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017344	TCA	2	6	12329	12334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017344	TGCAT	2	10	12340	12349	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017344	ACT	2	6	12373	12378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017344	CGTT	2	8	12393	12400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017344	CT	3	6	12405	12410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017344	TTA	2	6	12453	12458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017344	TGA	2	6	12489	12494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017344	TTC	2	6	12546	12551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017344	ATT	2	6	12561	12566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017344	CTTT	2	8	12571	12578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_017344	T	6	6	12604	12609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017344	T	6	6	13467	13472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017344	AT	4	8	13528	13535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017344	TCCT	2	8	13646	13653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_017344	T	6	6	13684	13689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017344	AT	3	6	13738	13743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017344	CAA	2	6	13764	13769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017344	TAA	2	6	13780	13785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017344	TAA	2	6	13820	13825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017344	T	6	6	13893	13898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017344	AAAT	2	8	13899	13906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017344	ATTT	2	8	14242	14249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017344	A	6	6	16143	16148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017344	TGT	2	6	16199	16204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017344	AT	4	8	27255	27262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017344	T	9	9	27262	27270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.