MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017341	GTC	2	6	2635563	2635568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_017341	AAG	2	6	2635576	2635581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017341	ACT	2	6	2635582	2635587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_017341	CTT	2	6	2635598	2635603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_017341	CAT	2	6	2635667	2635672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_017341	CTA	2	6	2635697	2635702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_017341	GATT	2	8	2635770	2635777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017341	GCA	2	6	2635804	2635809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_017341	CTG	2	6	2635832	2635837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_017341	TCA	2	6	2635883	2635888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_017341	CAT	2	6	2635899	2635904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_017341	ATT	2	6	2636007	2636012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_017341	ACA	2	6	2636015	2636020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_017341	TTC	2	6	2636027	2636032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_017341	TTG	2	6	2636070	2636075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017341	ATAC	2	8	2636174	2636181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12517	NC_017341	TTCA	2	8	2636269	2636276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12518	NC_017341	ACA	2	6	2636288	2636293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_017341	ACT	2	6	2636371	2636376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_017341	T	7	7	2636425	2636431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_017341	T	6	6	2636462	2636467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_017341	G	6	6	2636492	2636497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_017341	AAT	2	6	2636498	2636503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_017341	TC	3	6	2638585	2638590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_017341	TAC	2	6	2638620	2638625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_017341	A	6	6	2638713	2638718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_017341	TA	3	6	2638719	2638724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_017341	T	6	6	2638769	2638774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017341	A	6	6	2638777	2638782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_017341	CA	4	8	2638784	2638791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12531	NC_017341	AT	4	8	2638844	2638851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_017341	TAT	2	6	2638872	2638877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017341	TGTAC	2	10	2638911	2638920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12534	NC_017341	TGA	3	9	2638940	2638948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_017341	ATT	2	6	2638995	2639000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_017341	AGA	2	6	2639022	2639027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_017341	AAT	2	6	2639420	2639425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017341	T	6	6	2639438	2639443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_017341	TGG	2	6	2639908	2639913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017341	TAC	2	6	2639941	2639946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_017341	AC	3	6	2639950	2639955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12542	NC_017341	AGC	2	6	2639998	2640003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_017341	TA	3	6	2640014	2640019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_017341	TGG	2	6	2640595	2640600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_017341	A	6	6	2640607	2640612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_017341	TCG	2	6	2640666	2640671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_017341	AAT	2	6	2640723	2640728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_017341	TAT	2	6	2640733	2640738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_017341	ATT	2	6	2640750	2640755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_017341	T	6	6	2641549	2641554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_017341	ATA	2	6	2641615	2641620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_017341	ATTAC	2	10	2641644	2641653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12553	NC_017341	T	6	6	2641690	2641695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_017341	CTT	2	6	2641723	2641728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_017341	TAA	2	6	2641751	2641756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_017341	GGA	2	6	2641797	2641802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_017341	TA	4	8	2642104	2642111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_017341	ATA	2	6	2642163	2642168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_017341	TTAA	2	8	2642247	2642254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_017341	ATCA	2	8	2642296	2642303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12561	NC_017341	GCC	2	6	2642314	2642319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_017341	GTA	2	6	2642328	2642333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_017341	ATC	2	6	2642544	2642549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_017341	TA	3	6	2642561	2642566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_017341	TA	3	6	2642572	2642577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_017341	CT	3	6	2642580	2642585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12567	NC_017341	TC	4	8	2642588	2642595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12568	NC_017341	TATT	2	8	2642596	2642603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_017341	CTT	2	6	2642606	2642611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_017341	AAAT	2	8	2642638	2642645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_017341	TA	3	6	2642709	2642714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_017341	TAA	2	6	2642721	2642726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_017341	T	6	6	2642819	2642824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_017341	TAA	2	6	2642841	2642846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_017341	ATGA	2	8	2642851	2642858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_017341	T	6	6	2642918	2642923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_017341	ATC	2	6	2642938	2642943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_017341	TTC	2	6	2642951	2642956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_017341	T	6	6	2643007	2643012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_017341	TTC	2	6	2643060	2643065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_017341	ATT	2	6	2643961	2643966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_017341	TAA	2	6	2644735	2644740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_017341	ATC	2	6	2644778	2644783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_017341	ATTTTT	2	12	2644797	2644808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_017341	AAGTT	2	10	2644815	2644824	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_017341	TAA	2	6	2644838	2644843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_017341	ATT	2	6	2644920	2644925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_017341	TAAT	2	8	2644970	2644977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_017341	ATA	2	6	2645004	2645009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_017341	TTA	2	6	2645033	2645038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_017341	CATT	2	8	2645068	2645075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12592	NC_017341	ATC	2	6	2648366	2648371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_017341	TA	4	8	2648403	2648410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_017341	TAT	2	6	2648479	2648484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_017341	ATA	2	6	2648485	2648490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017341	T	7	7	2648520	2648526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_017341	TTA	2	6	2648589	2648594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_017341	CATTT	2	10	2650296	2650305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12599	NC_017341	TAA	2	6	2650370	2650375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_017341	AATT	2	8	2650397	2650404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_017341	TAA	2	6	2650430	2650435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_017341	TAA	2	6	2650438	2650443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017341	AT	3	6	2650526	2650531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_017341	AAT	2	6	2650548	2650553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_017341	TATT	2	8	2650607	2650614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_017341	CATT	2	8	2650839	2650846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12607	NC_017341	TAA	2	6	2650851	2650856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_017341	A	6	6	2650860	2650865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_017341	T	6	6	2650882	2650887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017341	ACAT	2	8	2650892	2650899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12611	NC_017341	AT	3	6	2650898	2650903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_017341	CAA	2	6	2650957	2650962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_017341	GT	3	6	2651283	2651288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_017341	AGTA	2	8	2651314	2651321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_017341	A	7	7	2651332	2651338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_017341	ATA	2	6	2651485	2651490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_017341	TAT	2	6	2651504	2651509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_017341	ATTTC	2	10	2651542	2651551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12619	NC_017341	TTA	2	6	2651572	2651577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_017341	AAT	2	6	2652805	2652810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_017341	CCA	2	6	2652820	2652825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12622	NC_017341	T	6	6	2652828	2652833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_017341	CTT	2	6	2652838	2652843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_017341	CT	3	6	2652849	2652854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12625	NC_017341	AATT	2	8	2652868	2652875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_017341	ATT	2	6	2652904	2652909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_017341	ATAC	2	8	2652917	2652924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12628	NC_017341	CATA	2	8	2652937	2652944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12629	NC_017341	ACT	2	6	2652957	2652962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12631	NC_017341	A	7	7	2653014	2653020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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