MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_017341	CAACA	2	10	2534699	2534708	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12003	NC_017341	CAAG	2	8	2534768	2534775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12004	NC_017341	CAG	2	6	2534819	2534824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_017341	GTAAAA	2	12	2534874	2534885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_017341	AGG	2	6	2534941	2534946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_017341	GACTT	2	10	2536169	2536178	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12008	NC_017341	ATG	2	6	2536265	2536270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_017341	ATT	2	6	2536292	2536297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_017341	TATTGA	2	12	2536302	2536313	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_017341	ATC	2	6	2536358	2536363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_017341	ATTT	2	8	2536395	2536402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_017341	ATC	2	6	2536416	2536421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_017341	TA	3	6	2536433	2536438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_017341	CTGT	2	8	2536444	2536451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12016	NC_017341	ATG	2	6	2536472	2536477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_017341	CAATT	2	10	2536487	2536496	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12018	NC_017341	ATT	2	6	2536524	2536529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_017341	ATT	2	6	2536557	2536562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12024	NC_017341	TTA	2	6	2536717	2536722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12041	NC_017341	TA	3	6	2538171	2538176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12057	NC_017341	TAA	2	6	2540443	2540448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12063	NC_017341	A	6	6	2540529	2540534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_017341	AT	3	6	2540577	2540582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_017341	ATT	2	6	2540588	2540593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12099	NC_017341	AT	3	6	2543949	2543954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_017341	ATTGA	2	10	2543977	2543986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_017341	CATTTA	2	12	2544112	2544123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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12112	NC_017341	A	7	7	2545237	2545243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12121	NC_017341	TC	3	6	2554274	2554279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12122	NC_017341	CTTA	2	8	2554289	2554296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12124	NC_017341	T	6	6	2554305	2554310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_017341	ATA	2	6	2558028	2558033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12127	NC_017341	TTTTGT	2	12	2558843	2558854	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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12129	NC_017341	AT	3	6	2558960	2558965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12395	NC_017341	GACA	2	8	2611224	2611231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12396	NC_017341	A	7	7	2611237	2611243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12397	NC_017341	CAAC	2	8	2611244	2611251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12398	NC_017341	GTT	2	6	2611266	2611271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12399	NC_017341	TGT	3	9	2611287	2611295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12400	NC_017341	TCA	2	6	2611923	2611928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12401	NC_017341	TAT	2	6	2611957	2611962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12402	NC_017341	AT	3	6	2611961	2611966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12403	NC_017341	A	6	6	2611978	2611983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12404	NC_017341	A	6	6	2612014	2612019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12405	NC_017341	TAT	3	9	2612030	2612038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12406	NC_017341	ATT	2	6	2612061	2612066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12408	NC_017341	AT	3	6	2613758	2613763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12409	NC_017341	AC	5	10	2613771	2613780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12410	NC_017341	AACC	2	8	2613784	2613791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12411	NC_017341	TTGG	2	8	2613807	2613814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12412	NC_017341	T	6	6	2613815	2613820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12413	NC_017341	TAAC	2	8	2613842	2613849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12415	NC_017341	AGT	2	6	2613915	2613920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12416	NC_017341	T	6	6	2613951	2613956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12417	NC_017341	GAC	2	6	2614028	2614033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12421	NC_017341	GAT	2	6	2614322	2614327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12422	NC_017341	AGG	2	6	2614330	2614335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12423	NC_017341	TAA	2	6	2614337	2614342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12424	NC_017341	A	6	6	2615711	2615716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12425	NC_017341	CAAA	2	8	2616961	2616968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12426	NC_017341	A	6	6	2617007	2617012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12427	NC_017341	TG	3	6	2617013	2617018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12428	NC_017341	TA	4	8	2617030	2617037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12429	NC_017341	TAT	2	6	2617045	2617050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12430	NC_017341	ATA	2	6	2617051	2617056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12431	NC_017341	ATT	2	6	2617089	2617094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12432	NC_017341	TAA	2	6	2617140	2617145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12433	NC_017341	CAA	2	6	2617168	2617173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12434	NC_017341	A	6	6	2617181	2617186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12435	NC_017341	GCAC	2	8	2617187	2617194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12436	NC_017341	CTC	2	6	2618782	2618787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12438	NC_017341	TAT	2	6	2618805	2618810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12439	NC_017341	T	7	7	2618816	2618822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12440	NC_017341	A	6	6	2618848	2618853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12441	NC_017341	A	6	6	2618914	2618919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12445	NC_017341	TAT	2	6	2620333	2620338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12453	NC_017341	A	8	8	2621237	2621244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12454	NC_017341	AAATTT	2	12	2621250	2621261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12457	NC_017341	GACT	2	8	2621326	2621333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12500	NC_017341	ATGA	2	8	2635552	2635559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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