MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017341	TACA	2	8	2443656	2443663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11502	NC_017341	TCCC	2	8	2444001	2444008	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11503	NC_017341	TTC	2	6	2444027	2444032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_017341	CT	3	6	2444813	2444818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_017341	AT	3	6	2446806	2446811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_017341	T	6	6	2446886	2446891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_017341	ATA	2	6	2446924	2446929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_017341	TTA	2	6	2446933	2446938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_017341	T	7	7	2446944	2446950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_017341	TCGT	2	8	2447030	2447037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11511	NC_017341	TAT	2	6	2447074	2447079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_017341	A	6	6	2447235	2447240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_017341	CA	3	6	2447260	2447265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11514	NC_017341	TCTT	2	8	2447288	2447295	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11515	NC_017341	GA	3	6	2447309	2447314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_017341	AGG	2	6	2447377	2447382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_017341	CAA	2	6	2448220	2448225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_017341	TTG	2	6	2448239	2448244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_017341	T	6	6	2448247	2448252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_017341	A	7	7	2448263	2448269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_017341	TAA	2	6	2448323	2448328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_017341	ACA	2	6	2448336	2448341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_017341	AC	3	6	2448353	2448358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_017341	AATT	2	8	2448442	2448449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_017341	TTACA	2	10	2448477	2448486	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11526	NC_017341	TA	4	8	2448609	2448616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_017341	TGA	2	6	2450051	2450056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_017341	TTC	2	6	2450067	2450072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_017341	CAT	2	6	2450119	2450124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_017341	AAC	2	6	2451209	2451214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_017341	TTAAAA	2	12	2451232	2451243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_017341	ATG	2	6	2451271	2451276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_017341	CAT	2	6	2451290	2451295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_017341	TA	4	8	2451309	2451316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_017341	CCA	2	6	2451348	2451353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_017341	ATT	2	6	2451354	2451359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_017341	TAA	2	6	2451368	2451373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_017341	TAA	2	6	2451379	2451384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_017341	ATA	2	6	2451423	2451428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_017341	AAAT	2	8	2451887	2451894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_017341	ATTA	2	8	2451902	2451909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_017341	TTA	2	6	2451942	2451947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_017341	T	7	7	2451963	2451969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_017341	AAG	2	6	2452000	2452005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_017341	TCA	2	6	2452032	2452037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_017341	A	7	7	2452080	2452086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_017341	GGA	2	6	2452100	2452105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_017341	GAT	2	6	2452624	2452629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_017341	TCA	2	6	2452665	2452670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_017341	A	6	6	2452670	2452675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_017341	T	7	7	2452705	2452711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_017341	TTAT	2	8	2452734	2452741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_017341	TCC	2	6	2452745	2452750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_017341	T	6	6	2452768	2452773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_017341	TAATT	2	10	2452805	2452814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_017341	CAT	2	6	2452894	2452899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_017341	CAT	2	6	2452912	2452917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_017341	TCT	2	6	2452940	2452945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_017341	TAT	2	6	2453940	2453945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_017341	TTG	2	6	2454013	2454018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_017341	TAT	2	6	2455247	2455252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_017341	CAT	2	6	2455301	2455306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_017341	ATG	2	6	2455321	2455326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017341	TA	3	6	2455349	2455354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_017341	T	6	6	2455358	2455363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_017341	TAAC	2	8	2455382	2455389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11567	NC_017341	AC	3	6	2455388	2455393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_017341	CTTA	2	8	2456253	2456260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11569	NC_017341	A	6	6	2456267	2456272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_017341	A	6	6	2456303	2456308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_017341	GTT	2	6	2456333	2456338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_017341	CAT	2	6	2456350	2456355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_017341	A	7	7	2456392	2456398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_017341	TCA	2	6	2456418	2456423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_017341	AGAC	2	8	2456429	2456436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11576	NC_017341	TAA	2	6	2456449	2456454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_017341	TTTA	2	8	2456514	2456521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_017341	CATAAT	2	12	2456531	2456542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11579	NC_017341	ATG	2	6	2456548	2456553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_017341	GAT	2	6	2456569	2456574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_017341	T	7	7	2456595	2456601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_017341	ATT	2	6	2456612	2456617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_017341	A	7	7	2456662	2456668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_017341	TA	4	8	2460158	2460165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_017341	TAA	2	6	2460184	2460189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_017341	CA	3	6	2460222	2460227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11587	NC_017341	AATT	2	8	2460240	2460247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_017341	GTT	2	6	2460271	2460276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_017341	ATC	2	6	2460342	2460347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_017341	AAT	2	6	2460364	2460369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_017341	ATT	2	6	2460374	2460379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_017341	TTA	2	6	2460428	2460433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_017341	TAA	2	6	2460445	2460450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_017341	TCACC	2	10	2460451	2460460	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11595	NC_017341	TAA	2	6	2460504	2460509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_017341	CTA	2	6	2460528	2460533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_017341	TAAAT	2	10	2460559	2460568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_017341	AAATC	2	10	2460590	2460599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11599	NC_017341	TAAA	2	8	2460606	2460613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_017341	TCTA	2	8	2460692	2460699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11601	NC_017341	TATT	2	8	2461738	2461745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_017341	T	7	7	2461760	2461766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_017341	T	6	6	2461793	2461798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_017341	T	6	6	2461803	2461808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_017341	CCA	2	6	2462627	2462632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11606	NC_017341	ATCATT	2	12	2462641	2462652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11607	NC_017341	TTA	3	9	2462653	2462661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_017341	CAA	2	6	2462679	2462684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_017341	CTT	2	6	2462697	2462702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_017341	A	7	7	2462715	2462721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_017341	GAAAG	2	10	2462751	2462760	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_017341	TAA	2	6	2462765	2462770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_017341	TGT	2	6	2462781	2462786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_017341	TA	3	6	2462818	2462823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_017341	T	6	6	2462880	2462885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_017341	T	8	8	2462919	2462926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_017341	AT	3	6	2462978	2462983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_017341	AGG	2	6	2462992	2462997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_017341	CAG	2	6	2463703	2463708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_017341	GAT	2	6	2463712	2463717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_017341	TGC	2	6	2463737	2463742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_017341	TAC	2	6	2463851	2463856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_017341	A	7	7	2463889	2463895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_017341	CTG	2	6	2463932	2463937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_017341	CAT	2	6	2464021	2464026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_017341	ATC	2	6	2464043	2464048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_017341	ATG	2	6	2464054	2464059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_017341	TCATAT	2	12	2464072	2464083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11629	NC_017341	TAGAA	2	10	2464107	2464116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11631	NC_017341	CTT	2	6	2464169	2464174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11895	NC_017341	TAATG	2	10	2519989	2519998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11896	NC_017341	TAC	2	6	2520054	2520059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11897	NC_017341	A	6	6	2521833	2521838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11898	NC_017341	T	6	6	2521878	2521883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11899	NC_017341	CAT	2	6	2521890	2521895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11905	NC_017341	TTA	2	6	2522811	2522816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11938	NC_017341	CATT	2	8	2531649	2531656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11972	NC_017341	T	7	7	2533221	2533227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11973	NC_017341	AGTT	2	8	2533261	2533268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11975	NC_017341	ATTA	2	8	2533317	2533324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11976	NC_017341	TAATT	2	10	2533334	2533343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11985	NC_017341	T	6	6	2533793	2533798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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